Бактериолог (врач)

Работая в бактериологических лабораториях, врачи-бактериологи сталкиваются с множеством патогенных и условно патогенных микроорганизмов. Для патогенных микробов характерны инфективность (прилипание к клеткам и колонизация экологической ниши организма), инвазивность (способность перемещаться одной из ниши в другие, вглубь тканей или клеток) и токсичность (способность нарушать обмен веществ или работу жизненно важных органов). Попадая в организм, патогенные микробы вызывают болезнь. Условно патогенные микробы обитают в пищевых продуктах, почве, воде, отходах, иногда попадая в организм человека, или постоянно живут в экологических нишах нашего организма. В обычных условиях они безвредны, но, например, у больных иммунодефицитом могут стать возбудителями болезней^[4].

Туберкулёз развивается после попадания в организм Mycobacterium tuberculosis, M. bovis, M. africanum, M. bovis BCG, M. microti или M. canettii. Микобактерии устойчивы к факторам окружающей среды и многим лекарствам. В организм они попадают через слизистую оболочку полости рта, миндалины, бронхи, лёгкие, желудочно-кишечный тракт. Проникнув в организм, микобактерии внедряются в макрофаги, эпителиальные и дендритные клетки. Для заражения бывает достаточно до 10 бактерий. В макрофагах микобактерии блокируют созревание фагосомы, размножаются в ней и препятствуют апоптозу. В 5—15 % случаев развивается активная форма туберкулёза; в остальных случаях иммунной системе десятилетиями удаётся блокировать возбудителя в гранулёме^[5].

Сальмонеллы — возбудители сальмонеллёза, брюшного тифа и паратифов — попадают в желудочно-кишечный тракт с пищей, проникают в энтероциты, микроскладчатые клетки, макрофаги и дендритные клетки. Микробы перепрограммируют метаболизм макрофагов на бета-оксидативное окисление жирных кислот. В результате в макрофагах повышается концентрация глюкозы, которую бактерии используют в качестве источника энергии. Получив доступ к энергии сальмонеллы размножаются, заселяют лимфатические узлы кишечника, мезентериальные лимфатические узлы, паренхиматозные органы, проникают в кровь. Из погибших сальмонелл выделяется эндотоксин, приводящий к лихорадке^[5].

Возбудители дифтерии — Corynebacterium diphtheriae — выживают вне организма около полугода, проникают в организм воздушно-капельным, контактно-бытовым и алиментарным путями через слизистую оболочку ротоглотки, носа, гортани, трахеи, половых органов, конъюнктиву, повреждённую кожу. Возбудитель остаётся в области входных ворот и провоцирует образование фибриновых плёнок, а его токсин поступает в кровь и распространяется по всему организму^[5].

Возбудителями бактериальной пневмонии могут быть Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Moraxella catarrhalis, Legionella spp., Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia, Staphylococcus aureus, Enterobacterales, Chlamydophila psittaci, Chlamydophila pneumoniae, Coxiella burnetii, Bordetella pertussis, Bordetella bronchiseptica, Prevotella^[4][6].

Сепсис — генерализованная инфекция, которая сопровождается острой угрожающей жизни полиорганной дисфункцией. При сепсисе во всём организме высвобождаются медиаторы воспаления, расширяются кровеносные сосуды, повышается проницаемость эндотелия и активируется свёртывание крови. Эти процессы приводят к падению артериального давления и микротромбозам жизненно важных органов. Частые причины сепсиса — инфекции, вызванные Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacterales^[7][8].

Антибиотикограмму выполняют следующими методами:

• Метод диффузии антибиотика в агар — на питательную среду засевают культуру микроба и вносят антибиотики в лунки на среде или на поверхность посева раскладывают диски с антибиотиками. Через сутки оценивают чувствительность по росту микробов вокруг антибиотиков.
• Эпсилометр-тест — узкую полоску полимера, пропитанную антибиотиком в разных концентрациях, помещают на поверхность питательной среды, засеянной культурой бактерии. По части полоски, к которой вплотную подходит рост бактерии, определяют минимальные подавляющие концентрации антибиотика.
• Метод серийных разведений — готовят несколько питательных сред, содержащих разные концентрации антибиотика, высевают на эти среды бактерии и через сутки определяют минимальную подавляющую концентрацию.
• Молекулярно-генетические методы — обнаруживают гены резистентности в геноме бактерий^[4].

Результаты исследований зависят от того, как забирали, доставляли и хранили биоматериал. Субстрат для исследования выбирают, исходя из локализации воспаления: при болезнях лёгких — мокрота, лаважная жидкость; при болезнях желудочно-кишечного тракта — рвотные массы, кал, слизь; при болезнях мочеполовой системы — моча, влагалищная слизь, соскоб слизистой оболочки уретры. Кровь — универсальный субстрат — в ней можно обнаружить антитела и токсины большинства возбудителей, а иногда и самого возбудителя.

• Забор материала проводят до начала антибиотикотерапии.
• Материал стараются брать из участка, содержащего наибольшее количество бактерий.
• Соблюдают правила асептики:
  • перед забором крови кожу обрабатывают 70 % раствором этанола и раствором калия йодида;
  • перед забором мокроты больных просят почистить зубы и прополоскать рот антисептиком;
  • перед забором мочи моют наружные половые органы с мылом и кипячёной водой.
• Предпочтительно посеять материал на питательную среду в месте забора. Если это невозможно, то биоматериал как можно скорее доставляют в лабораторию в контейнерах, биксах, сумках-холодильниках, чтобы предупредить гибель неустойчивых микробов и размножение сопутствующей микрофлоры.
• При заборе биоматериала строго соблюдают меры инфекционной безопасности.
• К биоматериалу прилагают сопроводительный документ, в котором указывают фамилию, имя, отчество больного, время забора материала, предполагаемый диагноз^[4].

Культуральный (бактериологический) метод — «золотой стандарт» идентификации возбудителей бактериальных инфекций и подбора антибиотиков для лечения. Кроме того, метод помогает найти источник и цепочку передачи инфекции. Микроскопический метод обычно используют как ориентировочный^[4].

В качестве экспресс-диагностики используют молекулярно-генетический метод, хемотаксономический и серологические реакции на выявление антигенов, ферментов и токсинов^[5]. Например, определение ДНК бактерий с помощью полимеразной цепной реакции, 13С-уреазный дыхательный тест на Helicobacter pylori^[9] и экспресс-тест на бета-гемолитический стрептококк группы А^[10].

Бактериологи консультируют клиницистов (инфекционистов, пульмонологов, гастроэнтерологов, хирургов и других врачей) по правилам забора и транспортировки биоматериала для исследования, по вопросам антибиотикорезистентности и профилактики внутрибольничной инфекции. Междисциплинарное обсуждение клинических случаев помогает врачам выбирать подходящие методы диагностики, обосновывать лечебные и профилактические мероприятия^[3].

Для эпидемиологического надзора и профилактики внутрибольничных инфекций врачи-бактериологи тесно взаимодействуют с врачами-эпидемиологами и санитарными врачами через автоматизированные рабочие места, оснащённые медицинскими информационными системами. Информационные технологии позволяют быстро обмениваться важными сведениями, хранить и анализировать большие массивы данных, оперативно принимать управленческие решения и прогнозировать эпидемический процесс. Работа врачей-бактериологов помогает выявить предвестники ухудшения эпидемиологической обстановки, антибиотикорезистентные больничные штаммы бактерий, оптимизировать тактику антибиотикотерапии и дезинфекции^[11].