HAVCR2

HAVCR2, или TIM-3 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 2, или англ. T-cell immunoglobulin and mucin domain 3) — мембранный белок, продукт гена HAVCR2.

Белок был впервые описан в 2002 году на поверхности интерферон-гамма-продуцирующих CD4+ Th1 и CD8+ Tc1 клеток[5][6]. Позже экспрессия HAVCR2 была обнаружена также на клетках Th17[7], регуляторных T-клетках[8], а также на дендритных клетках, естественных киллерах, моноцитах.[9]

Общие сведения
HAVCR2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

5F71

Идентификаторы
ПсевдонимыHAVCR2, HAVcr-2, KIM-3, TIM3, TIMD-3, TIMD3, Tim-3, CD366, hepatitis A virus cellular receptor 2, SPTCL
Внешние IDOMIM: 606652 MGI: 2159682 HomoloGene: 129541 GeneCards: HAVCR2
Расположение гена (человек)
Хр.5-я хромосома человека[1]
Локус5q33.3Начало157,085,422 bp[1]
Конец157,142,869 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.11-я хромосома мыши[2]
Локус11|11 B1.1Начало46,345,762 bp[2]
Конец46,372,082 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_032782

NM_134250

RefSeq (белок)

NP_116171

NP_599011

Локус (UCSC)Chr 5: 157.09 – 157.14 MbChr 11: 46.35 – 46.37 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функции

HAVCR2 является иммунным чекпоинтом вместе с другими ингибирующими рецепторами PD-1 и LAG3 и опосредует истощение CD8+ T-лимфоцитов[10]. Рецептор на поверхности CD4+ Th1-клеток также регулирует активацию макрофагов и усиливать экспериментальный аутоиммунный энцефаломиелит у мышей[5].

Основным лигандом HAVCR2 является галектин-9[11]. Взаимодействие с ним приводит к выходу кальция во внутриклеточную среду и вызывает апоптоз[12]. В результате это приводит к подавлению Th1- и Th17-клеточного иммунного ответа и вызывает иммунную толерантность. Другие лиганды HAVCR2 - фосфатидилсерин[13], HMGB1[14] и CEACAM1[15].

Структура

Белок состоит из 301 аминокислоты, молекулярная масса — 33,4 кДа. HAVCR2 принадлежит к семейству рецепторных белков клеточной поверхности TIM. Белки семейства TIM являются гликопротеинами клеточной поверхности, в структуре которых присутствуют иммуноглобулино-подобный домен IgV и гликозилированный муциновый домен, расположенный вблизи мембраны[16], а также один трансмембранный домен и короткий C-концевой цитоплазматический фрагмент. Содержит 5 консервативных тирозиновых остатков, которые отвечают за взаимодействие с комплексом Т-клеточного рецептора[17][18] и отрицательно регулируют его функцию[19].

Примечания