SEMA4D

Семафорин-4D (англ. Semaphorin-4D; SEMA4D; CD100) — мембранный гликопротеин, рецептор класса семафоринов. Продукт гена человека SEMA4D[5]. Рецептор для PLXNB1 и PLXNB2[6].

Общие сведения
SEMA4D
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1OLZ, 3OL2

Идентификаторы
ПсевдонимыSEMA4D, C9orf164, CD100, M-sema-G, SEMAJ, coll-4, semaphorin 4D, COLL4, A8, GR3, BB18
Внешние IDOMIM: 601866 MGI: 109244 HomoloGene: 21282 GeneCards: SEMA4D
Расположение гена (человек)
Хр.9-я хромосома человека[1]
Локус9q22.2Начало89,360,787 bp[1]
Конец89,498,130 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.13-я хромосома мыши[2]
Локус13|13 A5Начало51,685,529 bp[2]
Конец51,793,747 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001142287
NM_006378
NM_182635
NM_001371194
NM_001371195

NM_001371196
NM_001371197
NM_001371198
NM_001371199
NM_001371200
NM_001371201
NM_001371202

NM_001281880
NM_013660

RefSeq (белок)
NP_001135759
NP_006369
NP_001358123
NP_001358124
NP_001358125

NP_001358126
NP_001358127
NP_001358128
NP_001358129
NP_001358130
NP_001358131

NP_001268809
NP_038688
NP_001365242
NP_001365243
NP_001365246

NP_001365247
NP_001365248
NP_001365249
NP_001365251
NP_001365252
NP_001365253
NP_001365244
NP_001365245
NP_001365250
NP_001365254

Локус (UCSC)Chr 9: 89.36 – 89.5 MbChr 13: 51.69 – 51.79 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Структура

SEMA4D состоит из 862 аминокислот, молекулярная масса 96,15 кДа. Взаимодействует с рецептором семафоринов PLXNB1 и PLXNB2[6].

Функции

SEMA4D — молекула, участвующая в процессе аксонального наведения. Секретируется олигодендроцитами и индуцирует коллапс конуса роста в центральной нервной системе. За счёт связывания с рецептором PLXNB1 функционирует как ГТФаза-активирующий белок Ras и ингибирует рост аксона во взрослой центральной нервной системе[7].

В иммунной системе SEMA4D/CD100 связывается с CD72 и активирует B-лимфоциты и дендритные клетки, хотя это взаимодействие ещё недостаточно изучено[8][9].

В процессе заживления повреждения кожи SEMA4D взаимодействует с PLXNB2 на поверхности γδ-T-лимфоцитов и играет роль в процессе заживления[10].

Тканевая локализация

Белок экспрессирован с высоким уровнем в скелетных мышцах, лимфоцитах периферической крови, селезёнке и вилочковой железе. Детектируется на яичках, мозге, почках, тонком кишечнике, предстательной железе, сердце, плаценте, лёгких и поджелудочной железе, отсутствует в толстом кишечнике и печени.

Примечания

Литература