CD1D

CD1d — трансмембранный белок семейства гликопротеинов CD1[5], локализованных на поверхности антигенпредставляющих клеток. Продукт гена человека CD1D.

Общие сведения
CD1D
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4WO4, 1ZT4, 2PO6, 3HUJ, 3SDX, 3TZV, 3U0P, 3VWJ, 3VWK, 4EN3, 4LHU, 4MNG, 4MQ7, 4WW2

Идентификаторы
ПсевдонимыCD1D, CD1A, R3, R3G1, CD1d molecule
Внешние IDOMIM: 188410 MGI: 107674 HomoloGene: 1337 GeneCards: CD1D
Расположение гена (человек)
Хр.1-я хромосома человека[1]
Локус1q23.1Начало158,178,030 bp[1]
Конец158,186,427 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.3-я хромосома мыши[2]
Локус3 F1|3 37.91 cMНачало86,903,141 bp[2]
Конец86,906,748 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right lobe of liver
Наибольшая экспрессия в
  • left lobe of liver

  • subcutaneous adipose tissue

  • intercostal muscle

  • body of femur

  • fossa

  • medial ganglionic eminence
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

912

12479

Ensembl

ENSG00000158473

ENSMUSG00000028076

UniProt

P15813

P11609

RefSeq (мРНК)

NM_001766
NM_001319145
NM_001371761
NM_001371762
NM_001371763

NM_007639
NM_001379501
NM_001379502
NM_001379503

RefSeq (белок)

NP_001306074
NP_001757
NP_001358690
NP_001358691
NP_001358692

NP_031665
NP_001366430
NP_001366431
NP_001366432

Локус (UCSC)Chr 1: 158.18 – 158.19 MbChr 3: 86.9 – 86.91 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функции

CD1d-представляющие липидные антигены активируют особый класс T-клеток, известных как естественные киллеры T-клетки (NKT) через взаимодействие с T-клеточным рецептором, расположенным на поверхности плазматической мембраны этих клеток[5]. После активации NKT быстро начинают продуцировать Th1 и Th2 цитокины, в частности интерферон-гамма и интерлейин 4.

Лиганды

Известны следующие лиганды CD1d:

  • α-галактозилцерамид (α-GalCer), компонент, выделенный первоначально из морской губки Agelas mauritanius[6]. Лиганд в основном используется для исследовательких целей, так как не несёт никакой физиологической роли.
  • α-глюкуронил- и α-галактуронил- церамиды, семейство соединений бактериального происхождения, которые могут быть найдены, например, в клеточной стенке Sphingomonas[7]. Похожие β-D-глюкопиранозил-церамиды накапливаются в антигенпредставляющих клетках после инфекции.
  • iGb3, аутоантиген, играющий роль в селекции iNKT[8].
  • HS44, синтетический аминоциклитольный аналог церамида, который меньше связывается с TCR, активируя клетки iNKT более умеренно, чем α-GalCer и может иметь интерес с терапевтической точки зрения[9].

Примечания

Литература

  • Melián A., Beckman E. M., Porcelli S. A., Brenner M. B. Antigen presentation by CD1 and MHC-encoded class I-like molecules. (англ.) // Curr. Opin. Immunol. : journal. — 1996. — Vol. 8, no. 1. — P. 82—8. — doi:10.1016/S0952-7915(96)80109-9. — PMID 8729450.
  • Joyce S. CD1d and natural T cells: how their properties jump-start the immune system. (англ.) // Cell. Mol. Life Sci. : journal. — 2001. — Vol. 58, no. 3. — P. 442—469. — doi:10.1007/PL00000869. — PMID 11315191.
  • Sköld M., Behar S. M. Role of CD1d-Restricted NKT Cells in Microbial Immunity (англ.) // Infection and Immunity : journal. — 2003. — Vol. 71, no. 10. — P. 5447—5455. — doi:10.1128/IAI.71.10.5447-5455.2003. — PMID 14500461. — PMC 201095.
  • Brigl M., Brenner M. B. CD1: antigen presentation and T cell function (англ.) // Annu. Rev. Immunol.. — 2004. — Vol. 22, no. 1. — P. 817—890. — doi:10.1146/annurev.immunol.22.012703.104608. — PMID 15032598.
  • Stove V., Verhasselt B. Modelling thymic HIV-1 Nef effects (англ.) // Current HIV Research : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 1. — P. 57—64. — doi:10.2174/157016206775197583. — PMID 16454711.
  • Brutkiewicz R. R. CD1d ligands: the good, the bad, and the ugly (англ.) // Journal of Immunology : journal. — 2006. — Vol. 177, no. 2. — P. 769—775. — doi:10.4049/jimmunol.177.2.769. — PMID 16818729.
  • Blumberg R. S., Terhorst C., Bleicher P. et al. Expression of a nonpolymorphic MHC class I-like molecule, CD1D, by human intestinal epithelial cells (англ.) // Journal of Immunology : journal. — 1991. — Vol. 147, no. 8. — P. 2518—2524. — PMID 1717564.
  • Balk S. P., Bleicher P. A., Terhorst C. Isolation and characterization of a cDNA and gene coding for a fourth CD1 molecule (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86, no. 1. — P. 252—256. — doi:10.1073/pnas.86.1.252. — PMID 2463622. — PMC 286442.
  • Calabi F., Jarvis J. M., Martin L., Milstein C. Two classes of CD1 genes (англ.) // European Journal of Immunology : journal. — 1989. — Vol. 19, no. 2. — P. 285—292. — doi:10.1002/eji.1830190211. — PMID 2467814.
  • Yu C. Y., Milstein C. A physical map linking the five CD1 human thymocyte differentiation antigen genes (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1990. — Vol. 8, no. 12. — P. 3727—3732. — doi:10.1002/j.1460-2075.1989.tb08548.x. — PMID 2583117. — PMC 402056.
  • Martin L. H., Calabi F., Milstein C. Isolation of CD1 genes: a family of major histocompatibility complex-related differentiation antigens (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1987. — Vol. 83, no. 23. — P. 9154—9158. — doi:10.1073/pnas.83.23.9154. — PMID 3097645. — PMC 387093.
  • Balk S. P., Burke S., Polischuk J. E. et al. Beta 2-microglobulin-independent MHC class Ib molecule expressed by human intestinal epithelium (англ.) // Science : journal. — 1994. — Vol. 265, no. 5169. — P. 259—262. — doi:10.1126/science.7517575. — PMID 7517575.
  • Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene (журнал) : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
  • Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K. et al. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene (журнал) : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
  • Kawano T., Cui J., Koezuka Y. et al. CD1d-restricted and TCR-mediated activation of valpha14 NKT cells by glycosylceramides (англ.) // Science : journal. — 1997. — Vol. 278, no. 5343. — P. 1626—1629. — doi:10.1126/science.278.5343.1626. — PMID 9374463.
  • Katabami S., Matsuura A., Chen H. Z. et al. Structural organization of rat CD1 typifies evolutionarily conserved CD1D class genes (англ.) // Immunogenetics : journal. — 1998. — Vol. 48, no. 1. — P. 22—31. — doi:10.1007/s002510050396. — PMID 9601940.
  • Somnay-Wadgaonkar K., Nusrat A., Kim H. S. et al. Immunolocalization of CD1d in human intestinal epithelial cells and identification of a beta2-microglobulin-associated form (англ.) // International Immunology : journal. — 1999. — Vol. 11, no. 3. — P. 383—392. — doi:10.1093/intimm/11.3.383. — PMID 10221650.
  • Campbell N. A., Kim H. S., Blumberg R. S., Mayer L. The nonclassical class I molecule CD1d associates with the novel CD8 ligand gp180 on intestinal epithelial cells (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 37. — P. 26259—26265. — doi:10.1074/jbc.274.37.26259. — PMID 10473580.
  • Han M., Hannick L. I., DiBrino M., Robinson M. A. Polymorphism of human CD1 genes (англ.) // HLA (journal) : journal. — 2000. — Vol. 54, no. 2. — P. 122—127. — doi:10.1034/j.1399-0039.1999.540202.x. — PMID 10488738.
Protein CD1D PDB 1zt4.png
1-я хромосома человека
1-я хромосома человека
Расположение в геноме CD1D
Расположение в геноме CD1D
3-я хромосома мыши
3-я хромосома мыши
Расположение в геноме CD1D
Расположение в геноме CD1D
PBB GE CD1D 205789 at fs.png