Синдекан 1

Синдекан 1 (англ. syndecan 1; CD138) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Всего описано 4 белка этого семейства. Продукт гена человека SDC1.

Общие сведения
Синдекан 1
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

4GVC, 4GVD

Идентификаторы
Символ SDC1 ; CD138; SDC; SYND1; syndecan
Внешние ID OMIM: 186355 MGI: 1349162 HomoloGene: 2252 GeneCards: Ген SDC1
Генная онтология
Функция • glycoprotein binding

• protein binding
• protein C-terminus binding

• cytoskeletal protein binding
Компонент клетки • cytoplasm

• Golgi lumen
• plasma membrane
• integral component of plasma membrane
• focal adhesion
• external side of plasma membrane
• lysosomal lumen
• protein complex

• extracellular vesicular exosome
Биологический процесс • retinoid metabolic process

• ureteric bud development
• carbohydrate metabolic process
• glycosaminoglycan biosynthetic process
• glycosaminoglycan catabolic process
• inflammatory response
• phototransduction, visible light
• response to toxic substance
• extracellular matrix organization
• glycosaminoglycan metabolic process
• chondroitin sulfate metabolic process
• wound healing
• lipoprotein metabolic process
• odontogenesis
• response to hydrogen peroxide
• small molecule metabolic process
• myoblast development
• response to glucocorticoid
• response to cAMP
• response to calcium ion
• striated muscle cell development
• Sertoli cell development

• canonical Wnt signaling pathway
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
PBB GE SDC1 201286 at tn.png
PBB GE SDC1 201287 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 6382 20969
Ensembl ENSG00000115884 ENSMUSG00000020592
UniProt P18827 P18828
RefSeq (мРНК) NM_001006946 NM_011519
RefSeq (белок) NP_001006947 NP_035649
Локус (UCSC) Chr 2:
20.4 – 20.43 Mb		 Chr 12:
8.77 – 8.79 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Функции

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 1 участвует в клеточной пролиферации, клеточной миграции и клеточном взаимодействии с белками внеклеточного матрикса.[1]

Структура

Синдекан 1 несёт гепарансульфатные и хондроитинсульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом. Связывается с CDCP1.

Отщепление эктодомена приводит к образованию растворимой формы белка. Отщепление может происходить под действием гепараназы, тромбина и эпидермального фактора роста, а также при стрессе и в процессе заживления раны.

Белок состоит из 288 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 32.5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (232 аминокислоты), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 6 участков гликозилирования: 3 участка присоединения O-хондроитинсульфатных цепей, 2 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей и 1 участок N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит фосфорилируемый тирозин.

Применение

Синдекан 1 используется в качестве маркёра плазматических клеток[2], если известно, что клетки произошли из клеток крови.[3]

См. также

Примечания

Литература

  • Teng Y.H., Aquino R.S., Park P.W. Molecular functions of syndecan-1 in disease (англ.) // Matrix Biology (journal) : journal. — 2012. — January (vol. 31, no. 1). — P. 3—16. — doi:10.1016/j.matbio.2011.10.001. — PMID 22033227.
  • Katz B.Z. Adhesion molecules--The lifelines of multiple myeloma cells (англ.) // Semin. Cancer Biol. : journal. — 2010. — June (vol. 20, no. 3). — P. 186—195. — doi:10.1016/j.semcancer.2010.04.003. — PMID 20416379.
  • Bass M.D., Morgan M.R., Humphries M.J. Syndecans shed their reputation as inert molecules (англ.) // Science Signaling : journal. — 2009. — March (vol. 2, no. 64). — P. pe18. — doi:10.1126/scisignal.264pe18. — PMID 19336838. — PMC 3328204.

Ссылки