CXCR6

CXCR6 (англ. C-X-C chemokine receptor type 6; CD186) — рецептор хемокинов, продукт гена CXCR6[5][6][7]. Относится к семейству хемокиновых рецепторов CXC суперсемейства рецепторов, сопряжённых с G-белком. Рецептор хемокина CXCL16.

Общие сведения
CXCR6
Идентификаторы
ПсевдонимыCXCR6, BONZO, CD186, STRL33, TYMSTR, C-X-C motif chemokine receptor 6
Внешние IDOMIM: 605163 MGI: 1934582 HomoloGene: 38197 GeneCards: CXCR6
Расположение гена (человек)
Хр.3-я хромосома человека[1]
Локус3p21.31Начало45,940,933 bp[1]
Конец45,948,351 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.9-я хромосома мыши[2]
Локус9 F4|9 74.57 cMНачало123,635,540 bp[2]
Конец123,640,825 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
    н/д
Наибольшая экспрессия в
  • subcutaneous adipose tissue

  • right lung lobe

  • skin of abdomen
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

10663

80901

Ensembl

ENSG00000172215

ENSMUSG00000048521

UniProt

O00574

Q9EQ16

RefSeq (мРНК)

NM_006564

NM_030712

RefSeq (белок)

NP_006555

NP_109637

Локус (UCSC)Chr 3: 45.94 – 45.95 MbChr 9: 123.64 – 123.64 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функции

CXCR6 является корецептором, который используется вирусами HIV-1 и SIV для проникновения в клетки так же, как CD4[5][6][7][8]. Это минорный корецептор для подтипа HIV-1, тогда как большинство подтипов используют CCR5 и/или CXCR4. С другой стороны подтипы вируса обезьян SIV используют CXCR6 как основной рецептор[8].

Тканевая локализация

CXCR6 эспрессирован в лимфоидной ткани и на активированных T-лимфоцитах.

Примечания

Литература

  • Ruibal-Ares B.H., Belmonte L., Baré P.C., Parodi C.M., Massud I., de Bracco M.M. HIV-1 infection and chemokine receptor modulation (англ.) // Current HIV Research : journal. — 2004. — January (vol. 2, no. 1). — P. 39—50. — doi:10.2174/1570162043484997. — PMID 15053339.
  • Loetscher M., Amara A., Oberlin E., Brass N., Legler D., Loetscher P., D'Apuzzo M., Meese E., Rousset D., Virelizier J.L., Baggiolini M., Arenzana-Seisdedos F., Moser B. TYMSTR, a putative chemokine receptor selectively expressed in activated T cells, exhibits HIV-1 coreceptor function (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press, 1997. — September (vol. 7, no. 9). — P. 652—660. — doi:10.1016/S0960-9822(06)00292-2. — PMID 9285716.
  • Hoffman T.L., Stephens E.B., Narayan O., Doms R.W. HIV type I envelope determinants for use of the CCR2b, CCR3, STRL33, and APJ coreceptors (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — September (vol. 95, no. 19). — P. 11360—11365. — doi:10.1073/pnas.95.19.11360. — PMID 9736741. — PMC 21647.
  • Schramm B., Penn M.L., Speck R.F., Chan S.Y., De Clercq E., Schols D., Connor R.I., Goldsmith M.A. Viral entry through CXCR4 is a pathogenic factor and therapeutic target in human immunodeficiency virus type 1 disease (англ.) // Journal of Virology : journal. — 2000. — January (vol. 74, no. 1). — P. 184—192. — doi:10.1128/JVI.74.1.184-192.2000. — PMID 10590105. — PMC 111527.
  • Tscherning-Casper C., Vödrös D., Menu E., Aperia K., Fredriksson R., Dolcini G., Chaouat G., Barré-Sinoussi F., Albert J., Fenyö E.M. Coreceptor usage of HIV-1 isolates representing different genetic subtypes obtained from pregnant Cameroonian women. European Network for In Utero Transmission of HIV-1 (англ.) // Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes : journal. — 2000. — May (vol. 24, no. 1). — P. 1—9. — doi:10.1097/00126334-200005010-00001. — PMID 10877489.
  • Ignatius R., Wei Y., Beaulieu S., Gettie A., Steinman R.M., Pope M., Mojsov S. The immunodeficiency virus coreceptor, Bonzo/STRL33/TYMSTR, is expressed by macaque and human skin- and blood-derived dendritic cells (англ.) // AIDS Research and Human Retroviruses : journal. — 2000. — July (vol. 16, no. 11). — P. 1055—1059. — doi:10.1089/08892220050075318. — PMID 10933620.
  • Unutmaz D., Xiang W., Sunshine M.J., Campbell J., Butcher E., Littman D.R. The primate lentiviral receptor Bonzo/STRL33 is coordinately regulated with CCR5 and its expression pattern is conserved between human and mouse (англ.) // Journal of Immunology : journal. — 2000. — September (vol. 165, no. 6). — P. 3284—3292. — doi:10.4049/jimmunol.165.6.3284. — PMID 10975845.
  • Matloubian M., David A., Engel S., Ryan J.E., Cyster J.G. A transmembrane CXC chemokine is a ligand for HIV-coreceptor Bonzo (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2000. — October (vol. 1, no. 4). — P. 298—304. — doi:10.1038/79738. — PMID 11017100.
  • Wilbanks A., Zondlo S.C., Murphy K., Mak S., Soler D., Langdon P., Andrew D.P., Wu L., Briskin M. Expression cloning of the STRL33/BONZO/TYMSTRligand reveals elements of CC, CXC, and CX3C chemokines (англ.) // Journal of Immunology : journal. — 2001. — April (vol. 166, no. 8). — P. 5145—5154. — doi:10.4049/jimmunol.166.8.5145. — PMID 11290797.
  • Lee B., Leslie G., Soilleux E., O'Doherty U., Baik S., Levroney E., Flummerfelt K., Swiggard W., Coleman N., Malim M., Doms R.W. cis Expression of DC-SIGN allows for more efficient entry of human and simian immunodeficiency viruses via CD4 and a coreceptor (англ.) // Journal of Virology : journal. — 2001. — December (vol. 75, no. 24). — P. 12028—12038. — doi:10.1128/JVI.75.24.12028-12038.2001. — PMID 11711593. — PMC 116098.
  • Calabresi P.A., Yun S.H., Allie R., Whartenby K.A. Chemokine receptor expression on MBP-reactive T cells: CXCR6 is a marker of IFNgamma-producing effector cells (англ.) // Journal of Neuroimmunology : journal. — 2002. — June (vol. 127, no. 1—2). — P. 96—105. — doi:10.1016/S0165-5728(02)00106-6. — PMID 12044980.
  • Kim C.H., Johnston B., Butcher E.C. Trafficking machinery of NKT cells: shared and differential chemokine receptor expression among V alpha 24(+)V beta 11(+) NKT cell subsets with distinct cytokine-producing capacity (англ.) // Blood (журнал) : journal. — American Society of Hematology, 2002. — July (vol. 100, no. 1). — P. 11—6. — doi:10.1182/blood-2001-12-0196. — PMID 12070001.
  • Duggal P., An P., Beaty T.H., Strathdee S.A., Farzadegan H., Markham R.B., Johnson L., O'Brien S.J., Vlahov D., Winkler C.A. Genetic influence of CXCR6 chemokine receptor alleles on PCP-mediated AIDS progression among African Americans (англ.) // Genes & Immunity : journal. — 2003. — June (vol. 4, no. 4). — P. 245—250. — doi:10.1038/sj.gene.6363950. — PMID 12761559.
  • Koprak S., Matheravidathu S., Springer M., Gould S., Dumont F.J. Down-regulation of cell surface CXCR6 expression during T cell activation is predominantly mediated by calcineurin (англ.) // Cellular Immunology : journal. — 2003. — May (vol. 223, no. 1). — P. 1—12. — doi:10.1016/S0008-8749(03)00130-8. — PMID 12914753.
  • Shimaoka T., Nakayama T., Fukumoto N., Kume N., Takahashi S., Yamaguchi J., Minami M., Hayashida K., Kita T., Ohsumi J., Yoshie O., Yonehara S. Cell surface-anchored SR-PSOX/CXC chemokine ligand 16 mediates firm adhesion of CXC chemokine receptor 6-expressing cells (англ.) // Journal of Leukocyte Biology : journal. — 2004. — February (vol. 75, no. 2). — P. 267—274. — doi:10.1189/jlb.1003465. — PMID 14634054.
3-я хромосома человека
3-я хромосома человека
Расположение в геноме CXCR6
Расположение в геноме CXCR6
9-я хромосома мыши
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме CXCR6
Расположение в геноме CXCR6
PBB GE CXCR6 206974 at fs.png
PBB GE CXCR6 211469 s at fs.png