CD302

CD302, или CLEC13A (англ. C-type lectin domain family 13 member A, лектин С-типа домен семейство 13 член A) — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CD302[5][6].

Общие сведения
CD302
Идентификаторы
ПсевдонимыCD302, BIMLEC, CLEC13A, DCL-1, DCL1, CD302 molecule
Внешние IDOMIM: 612246 MGI: 1913455 HomoloGene: 8919 GeneCards: CD302
Расположение гена (человек)
Хр.2-я хромосома человека[1]
Локус2q24.2Начало159,768,628 bp[1]
Конец159,798,255 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.2-я хромосома мыши[2]
Локус2|2 C1.1Начало60,082,337 bp[2]
Конец60,114,832 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_014880
NM_001198763
NM_001198764

NM_001290660
NM_025422

RefSeq (белок)

NP_001185692
NP_001185693
NP_055695

NP_001277589
NP_079698

Локус (UCSC)Chr 2: 159.77 – 159.8 MbChr 2: 60.08 – 60.11 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Тканевая специфичность

Экспрессирован в умеренном количестве на моноцитах, миелоидных дендритных клетках крови, низкий уровень обнаружен на плазмацитоидных дендритных клетках крови, а также макрофагах и дендритных клетках моноцитарного происхождения. Наивысший уровень находится в печени, лёгких, лейкоцитах периферической крови, селезёнке. При лимфоме Ходжкина изоформы 2 и 3 экспрессируются клетками Ходжкина-Рида-Штернберга.

Функции

Белок относится к суперсемейству белков CTL/CTLD (лектин типа С/лектин типа С-подобный домен). Члены этого семейства имеют сходную белковую структуру и обладают разнообразными функциями, такими как адгезия клеток, межклеточная передача сигнала, метаболизм гликопротеинов, роль в воспалении и иммунном ответе. CD302 является мультифункциональным рецептором, который играет роль в клеточной адгезии, миграции, а также в эндоцитозе и фагоцитозе.[7].

Структура

Является трансмембранным белком 1-го типа. Белок состоит из 210 аминокислот, содержит один трансмембранный домен. Внеклеточный домен содержит 1 участока N-гликозилирования аспарагинового остатка и 1 дисульфидную связь.

Примечания

Литература

  • Hillier L.W., Graves T.A., Fulton R.S. et al. Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4. (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 434, no. 7034. — P. 724—731. — doi:10.1038/nature03466. — PMID 15815621.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Yang S., Noble C.G., Yang D. Characterization of DLC1-SAM equilibrium unfolding at the amino acid residue level (англ.) // Biochemistry : journal. — 2009. — Vol. 48, no. 19. — P. 4040—4049. — doi:10.1021/bi9000936. — PMID 19317456.
  • Kato M., Khan S., Gonzalez N. et al. Hodgkin's lymphoma cell lines express a fusion protein encoded by intergenically spliced mRNA for the multilectin receptor DEC-205 (CD205) and a novel C-type lectin receptor DCL-1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 36. — P. 34035—34041. — doi:10.1074/jbc.M303112200. — PMID 12824192.
  • Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Research : journal. — 1996. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.