SLAMF8

SLAMF8 — мембранный белок, продукт гена человека SLAMF8[5][6]. Входит в семейство сигнальных лимфоцитарных молекул активации (англ. Signaling lymphocytic activation molecule, SLAM).

Общие сведения
SLAMF8
Идентификаторы
ПсевдонимыSLAMF8, BLAME, CD353, SBBI42, SLAM family member 8
Внешние IDOMIM: 606620 MGI: 1921998 HomoloGene: 10589 GeneCards: SLAMF8
Расположение гена (человек)
Хр.1-я хромосома человека[1]
Локус1q23.2Начало159,826,811 bp[1]
Конец159,837,492 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.1-я хромосома мыши[2]
Локус1|1 H3Начало172,409,325 bp[2]
Конец172,418,135 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • lower lobe of lung

  • upper lobe of lung
Наибольшая экспрессия в
  • subcutaneous adipose tissue

  • skin of abdomen
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

56833

74748

Ensembl

ENSG00000158714

ENSMUSG00000053318

UniProt

Q9P0V8

Q9D3G2

RefSeq (мРНК)

NM_020125
NM_001330741

NM_029084

RefSeq (белок)

NP_001317670
NP_064510

NP_083360

Локус (UCSC)Chr 1: 159.83 – 159.84 MbChr 1: 172.41 – 172.42 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функции

Белок относится к трансмембранным белкам 1-го типа подсемейства CD2 суперсемейства иммуноглобулинов. Играет роль в активации лимфоцитов. Эспрессирован в лимфоидных тканях: лимфатических узлах, селезёнке, вилочковой железе и костном мозге. Может участвовать в дифференцировке миелоидных клеток-предшественников в B-лимфоциты и/или модуляции сигнала, опосредованного через рецептор B-лимфоцитов.

Структура

Белок состоит из 263 аминокислот, молекулярная масса 31,67 кДа. Внеклеточный участок содержит Ig-домен типа C2, 1 участок гликозилорования и 1 дисульфидную связь.

Примечания

Литература

  • Tangye S.G., Nichols K.E., Hare N.J., van de Weerdt B.C. Functional requirements for interactions between CD84 and Src homology 2 domain-containing proteins and their contribution to human T cell activation (англ.) // Journal of Immunology : journal. — 2003. — September (vol. 171, no. 5). — P. 2485—2495. — doi:10.4049/jimmunol.171.5.2485. — PMID 12928397.
  • Zhang Z., Henzel W.J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites (англ.) // Protein Science : journal. — 2004. — October (vol. 13, no. 10). — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
1-я хромосома человека
1-я хромосома человека
Расположение в геноме SLAMF8
Расположение в геноме SLAMF8
1-я хромосома мыши
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме SLAMF8
Расположение в геноме SLAMF8
PBB GE SLAMF8 219386 s at fs.png
PBB GE SLAMF8 219385 at fs.png