CLEC4A

CLEC4A (англ. C-type lectin domain family 4 member A, лектин С-типа домен семейство 4 член A; CD367) — мембранный белок, рецептор семейства лектинов типа С. Продукт гена человека CLEC4A[5][6].

Общие сведения
CLEC4A
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

5B1W, 5B1X

Идентификаторы
ПсевдонимыCLEC4A, CLECSF6, DCIR, DDB27, LLIR, CD367, HDCGC13P, C-type lectin domain family 4 member A, hDCIR
Внешние IDOMIM: 605306 MGI: 1349412 HomoloGene: 49291 GeneCards: CLEC4A
Расположение гена (человек)
Хр.12-я хромосома человека[1]
Локус12p13.31Начало8,123,617 bp[1]
Конец8,138,607 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.6-я хромосома мыши[2]
Локус6 F2|6 58.18 cMНачало123,083,387 bp[2]
Конец123,120,958 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • upper lobe of left lung
Наибольшая экспрессия в
  • seminiferous tubule

  • body of femur
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

50856

26888

Ensembl

ENSG00000111729

ENSMUSG00000030148

UniProt

Q9UMR7

Q9QZ15

RefSeq (мРНК)

NM_016184
NM_194447
NM_194448
NM_194450

NM_001170332
NM_001170333
NM_011999

RefSeq (белок)

NP_057268
NP_919429
NP_919430
NP_919432

NP_001163803
NP_001163804
NP_036129

Локус (UCSC)Chr 12: 8.12 – 8.14 MbChr 6: 123.08 – 123.12 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Структура

CLEC7A состоит из 237 аминокислот, молекулярная масса 27,5 кДа. Содержит лектиновый домен типа C и ингибирующий ITIM-подобный мотив.

Функции

CLEC4A является мембранным белком 2-го типа из семейства лектинов типа С. Этот рецептор опознавания паттерна связывает углеводы маннозу и фукозу и с меньшей афинностью N-ацетилглюкозамин в Ca2+-зависимой манере. Регулирует иммунную реактивность. После связывания антигена рецептор CLEC4A интернализуется в ходе клатрин-зависимого эндоцитоза и доставляет антиген в антиген-представляющий путь, что приводит к презентации антигена CD8+ T-лимфоцитам. Презентация и активация CD8+ T-клеток усиливается агонистами рецепторов TLR7 и TLR8.

Через ITAM-мотив может также участвовать в ингибировании мобилизации кальция, опосредованной B-клеточным рецептором, и фосфорилирования.

Играет роль во взаимодействии вируса HIV-1 и дендритных клеток. Повышает связывание вируса с клеткой, его проникновение и инфицирование.

Тканевая специфичность

Белок экспрессирован в основном на гематопоэтических клетках: на всех циркулирующих антиген-представляющих клетках, включая дендритные клетки, миелоидные клетки, моноциты, макрофагы, B-лимфоциты и эпидермальных клетках Лангерганса. Кроме этого, экспрессирован на лейкоцитах, нейтрофилах периферической крови, в меньше степени - в селезёнке, лимфатических узлах и костном мозге.

Примечания

Литература

  • Drickamer K. C-type lectin-like domains. (англ.) // Curr. Opin. Struct. Biol.. — 1999. — Vol. 9, no. 5. — P. 585—590. — doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3. — PMID 10508765.
  • Huang X., Yuan Z., Chen G. et al. Cloning and characterization of a novel ITIM containing lectin-like immunoreceptor LLIR and its two transmembrane region deletion variants. (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2001. — Vol. 281, no. 1. — P. 131—140. — doi:10.1006/bbrc.2001.4322. — PMID 11178971.
  • Richard M., Veilleux P., Rouleau M. et al. The expression pattern of the ITIM-bearing lectin CLECSF6 in neutrophils suggests a key role in the control of inflammation. (англ.) // Journal of Leukocyte Biology : journal. — 2002. — Vol. 71, no. 5. — P. 871—880. — PMID 11994513.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Ebner S., Sharon N., Ben-Tal N. Evolutionary analysis reveals collective properties and specificity in the C-type lectin and lectin-like domain superfamily. (англ.) // Proteins : journal. — 2003. — Vol. 53, no. 1. — P. 44—55. — doi:10.1002/prot.10440. — PMID 12945048.
  • Richard M., Thibault N., Veilleux P. et al. The ITIM-bearing CLECSF6 (DCIR) is down-modulated in neutrophils by neutrophil activating agents. (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2003. — Vol. 310, no. 3. — P. 767—773. — doi:10.1016/j.bbrc.2003.09.077. — PMID 14550269.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Richard M., Thibault N., Veilleux P. et al. Granulocyte macrophage-colony stimulating factor reduces the affinity of SHP-2 for the ITIM of CLECSF6 in neutrophils: a new mechanism of action for SHP-2. (англ.) // Molecular Immunology : journal. — 2006. — Vol. 43, no. 10. — P. 1716—1721. — doi:10.1016/j.molimm.2005.10.006. — PMID 16360206.
  • Lorentzen J.C., Flornes L., Eklöw C. et al. Association of arthritis with a gene complex encoding C-type lectin-like receptors. (англ.) // Arthritis & Rheumatology : journal. — 2007. — Vol. 56, no. 8. — P. 2620—2632. — doi:10.1002/art.22813. — PMID 17665455.
12-я хромосома человека
12-я хромосома человека
Расположение в геноме CLEC4A
Расположение в геноме CLEC4A
6-я хромосома мыши
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме CLEC4A
Расположение в геноме CLEC4A
PBB GE CLEC4A 219947 at fs.png
PBB GE CLEC4A 221724 s at fs.png