TCF4

Pause

TCF-4 (от англ. Transcription factor 4) или Фактор транскрипции 4, также известный как фактор транскрипции иммуноглобулина 2 (ITF-2), представляет собой белок, который у человека кодируется геном TCF4, расположенным на хромосоме 18q21.2[5].

Общие сведения
TCF4
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2KWF

Идентификаторы
ПсевдонимыTCF4, E2-2, ITF-2, ITF2, PTHS, SEF-2, SEF2, SEF2-1, SEF2-1A, SEF2-1B, SEF2-1D, TCF-4, bHLHb19, FECD3, transcription factor 4, CDG2T
Внешние IDOMIM: 602272 MGI: 98506 HomoloGene: 2407 GeneCards: TCF4
Расположение гена (человек)
Хр.18-я хромосома человека[1]
Локус18q21.2Начало55,222,185 bp[1]
Конец55,664,787 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.18-я хромосома мыши[2]
Локус18|18 E2Начало69,343,356 bp[2]
Конец69,689,079 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001083962
NM_001243226
NM_001243227
NM_001243228
NM_001243230

NM_001243231
NM_001243232
NM_001243233
NM_001243234
NM_001243235
NM_001243236
NM_001306207
NM_001306208
NM_003199
NM_001330604
NM_001330605
NM_001348211
NM_001348212
NM_001348213
NM_001348214
NM_001348215
NM_001348216
NM_001348217
NM_001348218
NM_001348219
NM_001348220
NM_001369572
NM_001369573
NM_001369574
NM_001369575
NM_001369576
NM_001369577
NM_001369578
NM_001369579
NM_001369580
NM_001369581
NM_001369582
NM_001369583
NM_001369584
NM_001369585
NM_001369586
NM_001369567
NM_001369568
NM_001369569
NM_001369570
NM_001369571

NM_001083967
NM_013685
NM_001361126
NM_001361127
NM_001361128

NM_001361129

RefSeq (белок)
NP_001077431
NP_001230155
NP_001230156
NP_001230157
NP_001230159

NP_001230160
NP_001230161
NP_001230162
NP_001230163
NP_001230164
NP_001230165
NP_001293136
NP_001293137
NP_001317533
NP_001317534
NP_003190
NP_001335140
NP_001335141
NP_001335142
NP_001335143
NP_001335144
NP_001335145
NP_001335146
NP_001335147
NP_001335148
NP_001335149
NP_001356501
NP_001356502
NP_001356503
NP_001356504
NP_001356505
NP_001356506
NP_001356507
NP_001356508
NP_001356509
NP_001356510
NP_001356511
NP_001356512
NP_001356513
NP_001356514
NP_001356515
NP_001356496
NP_001356497
NP_001356498
NP_001356499
NP_001356500

NP_001077436
NP_038713
NP_001348055
NP_001348056
NP_001348057

NP_001348058

Локус (UCSC)Chr 18: 55.22 – 55.66 MbChr 18: 69.34 – 69.69 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функция

Белок TCF4 действует как фактор транскрипции, который связывается с мотивом усилителя иммуноглобулина mu-E5/kappa-E2. TCF4 активирует транскрипцию путём связывания с E-боксом (5’-CANNTG-3 ’), обычно обнаруживаемым на SSTR2-INR или инициаторном элементе рецептора 2 соматостатина. TCF4 в первую очередь участвует в неврологическом развитии плода во время беременности, инициируя нейральную дифференцировку путем связывания с ДНК. Он обнаруживается в центральной нервной системе, сомитах и ​​предшественнике гонад на ранних этапах развития. На более поздних этапах развития его находят в щитовидной железе, тимусе и почках, тогда как во взрослом возрасте TCF4 может быть обнаружен в лимфоцитах, мышцах, зрелых нейронах и желудочно-кишечной системе[6][7][8].

Клиническое значение

Мутации в TCF4 вызывают синдром Питта — Хопкинса (PTHS). Эти мутации приводят к тому, что белки TCF4 не связываются должным образом с ДНК и не контролируют дифференцировку нервной системы. В большинстве изученных случаев мутации были de novo, то есть это была новая мутация, не обнаруженная у других членов семьи пациента. Общие симптомы синдрома Питта-Хопкинса включают широкий рот, желудочно-кишечные проблемы, задержку развития мелкой моторики, проблемы с речью и дыханием, эпилепсию и другие дефекты головного мозга[9][10].

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196628 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053477 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (Feb 1990). “Sequence of the cDNA encoding ITF-2, a positive-acting transcription factor”. Nucleic Acids Research. 18 (3): 678. DOI:10.1093/nar/18.3.678. PMC 333500. PMID 2308860.
  6. ↑ de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et al. (Apr 2009). “Mutational, functional, and expression studies of the TCF4 gene in Pitt-Hopkins syndrome”. Human Mutation. 30 (4): 669—76. DOI:10.1002/humu.20935. PMID 19235238.
  7. ↑ Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (Dec 1996). “The helix-loop-helix transcription factor SEF-2 regulates the activity of a novel initiator element in the promoter of the human somatostatin receptor II gene”. The EMBO Journal. 15 (23): 6680—90. DOI:10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x. PMC 452492. PMID 8978694.
  8. ↑ D'Rozario, Mitchell; Zhang, Ting; Waddell, Edward A.; Zhang, Yonggang; Sahin, Cem; Sharoni, Michal; Hu, Tina; Nayal, Mohammad; Kutty, Kaveesh; Liebl, Faith; Hu, Wenhui (2016-04-12). “Type I bHLH Proteins Daughterless and Tcf4 Restrict Neurite Branching and Synapse Formation by Repressing Neurexin in Postmitotic Neurons”. Cell Reports. 15 (2): 386—397. DOI:10.1016/j.celrep.2016.03.034. ISSN 2211-1247. PMC 4946342. PMID 27050508.
  9. ↑ Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et al. (May 2007). “Mutations in TCF4, encoding a class I basic helix-loop-helix transcription factor, are responsible for Pitt-Hopkins syndrome, a severe epileptic encephalopathy associated with autonomic dysfunction”. American Journal of Human Genetics. 80 (5): 988—93. DOI:10.1086/515582. PMC 1852736. PMID 17436254.
  10. ↑ Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, et al. (May 2007). “Haploinsufficiency of TCF4 causes syndromal mental retardation with intermittent hyperventilation (Pitt-Hopkins syndrome)”. American Journal of Human Genetics. 80 (5): 994—1001. DOI:10.1086/515583. PMC 1852727. PMID 17436255.

Дополнительно по теме

Pause