За время руководства Токарева «Транснефть» реализовала несколько крупномасштабных проектов, самым важным из них стало строительство и расширение нефтепровода «Восточная Сибирь — Тихий океан» (ВСТО) для поставок нефти на рынки Азии. Контракт Токарева продлён правительством России до 2025 года[4].
Служил в Первом главном управленииКГБ СССР, отвечавшем за внешнюю разведку, в начале 1980-х был определён в дрезденскую резидентуру КГБ. Там майор Токарев делил[6] один кабинет с капитаном Чемезовым, там же он познакомился c Владимиром Путиным, приехавшим в ГДР в 1985 году. В 1990 году Путин вернулся в Ленинградское управление КГБ, а Токарев остался в Германии. Позднее он был переведён на год в Берлин в инспекторскую группу[1][5].
В 1996 году перешёл на работу Управление делами президента РФ заместителем генерального директора унитарного государственного предприятия по управлению собственностью за рубежом (УГП «Госзагрансобственность»). СМИ связывали переход Токарева в Управление с протекцией Путина, бывшего на тот момент заместителем управделами президента[1][5].
С лета 1999 года Токарев был руководителем службы безопасности, затем — вице-президентом ОАО «АК „Транснефть“». Курировал внешнеэкономический блок, зарубежные проекты и информационно-аналитическую работу[7][8].
В сентябре 2000 года Токарев был назначен вместо Олега Попова генеральным директором государственного предприятия «Российское внешнеэкономическое объединение „Зарубежнефть“» (ГП «РВО „Зарубежнефть“», с 2004 года — ОАО «Зарубежнефть»). Работу в «Зарубежнефти» Токарев начал с кадровых и структурных изменений, а также с проведения аудита. В результате проверок в 2002 году «Зарубежнефть» оценила потери при Попове примерно в 100 млн долларов и подала заявление в МВД. Уголовное дело тянулось два года и было прекращено в июне 2004[1][2][9].
При Токареве компания была акционирована и стала вместо государства совладельцем основного актива — совместного предприятия «Зарубежнефти» и вьетнамской государственной PetroVietnam — «Вьетсовпетро», разрабатывавшего нефтегазовые месторождения на вьетнамском шельфе на условиях соглашения о разделе продукции. Выручка компании к 2007 году выросла в четыре с лишним раза до 11,5 млрд руб., чистая прибыль — на порядок до 8,7 млрд руб[1].
13 сентября 2007 года закончился 8-летний контракт президента российской нефтепроводной госмонополии «Транснефть» Семёна Вайнштока. Месяц спустя на эту должность был назначен Токарев. В ходе последовавшей ревизии распределения подрядов «Транснефти» на строительстве нефтепровода «Восточная Сибирь — Тихий океан» (ВСТО) прежнее руководство было обвинено в перерасходовании 2 млрд долларов и привлечении к работам структур, связанных с родственниками прежних топ-менеджеров.
При Токареве «Транснефть» достроила ВСТО и с нуля проложила ВСТО-2, а после расширила пропускную способность системы, а также ввела в эксплуатацию БТС-2, идущую в сторону Европы[11]. Кроме расширения трубопроводной сети «Транснефть» при Токареве заинтересовалась портовой перевалкой и создала совместное предприятие с группой «Сумма»Зиявудина Магомедова, владевшей портом в Приморске. В дальнейшем «Транснефть» и «Сумма» склонили к продаже бизнеса владельцев Новороссийского морского торгового порта. В январе 2011 года совместное предприятие приобрело 50,1 % порта за 2-2,5 млрд долларов, заплатив 80%-премию к биржевой цене. В результате сделки СП стало контролировать 75 % нефтяного экспорта через европейские гавани России[1][12].
«Транснефть» при Токареве подвергалась критике финансовую непрозрачность. Благотворительные расходы «Транснефти» и её дочерних компаний только за 2007 год составили 7,2 млрд рублей. Среди получателей части средств упоминался фонд по содействию сотрудникам и ветеранам Федеральной службы охраны «Кремль-9», при этом большая часть адресатов осталась неизвестной, а сама компания игнорировала запросы о раскрытии информации[13].
В 2015 году Счётная палата РФ предъявила претензии к работе «Транснефти» и отметила несоответствие планов компании схемам развития нефтяной отрасли России[14]. Месяцем позже «Транснефть» продлила контракт с Токаревым до 2020 года[15].
В 2016 года «Независимая Газета» публиковала информацию о том, что в Новороссийском порту существует сеть фирм-посредников, аффилированных с высшим менеджментом «Транснефти» и используемых в ущерб акционерам для перевалки нефти и работах по модернизации самого порта[16][17]. Миноритарии, владеющие привилегированными акциями, обвиняли Токарева и «Транснефть» в намеренном занижении прибыли на головной компании и уменьшении базы для выплаты дивидендов[18].
Также в 2014—2016 годы «Транснефть» потеряла более 80 млрд рублей на использовании производных финансовых инструментов и около 19 млрд рублей вложений в «Внешпромбанк» и банк «Интеркоммерц». Суммарно потери Транснефти за 2014 и 2015 годы составили более 100 млрд рублей, что в два раза превышает все дивиденды, выплаченные за всю историю компании[19][20].
Журнал Forbes поставил Токарева на 21-е место в рейтинге «25 самых дорогих руководителей компаний России — 2016» с оценкой годового вознаграждения в 3 млн долларов[21].
ПАО «Транснефть» под руководством Токарева в 2017 году официально ввело в промышленную эксплуатацию[22] масштабные проекты: магистральные нефтепроводы Заполярье — Пурпе и Куюмба — Тайшет.
Очередному переназначению Токарева мог препятствовать инцидент с загрязнением нефти в нефтепроводе «Дружба» весной 2019 года, что заострило вопросы о контроле качества нефти в системе. Однако «Транснефть» смогла урегулировать проблемы с большинством потребителей, а смена руководства стратегической компании в период нефтяного кризиса и пандемии нового коронавируса эксперты считали неоправданным риском. Важным плюсом Токарева было завершение под его руководством строительства всех запланированных объектов в срок или с опережением графика. Весной 2020 года полномочия Токарева были продлены ещё на пять лет, до 2025 года[4].
24 февраля 2022 года Токарев с супругой были включены в санкционный список Канады[23][24].
28 февраля 2022 года санкции против Токарева ввёл Евросоюз. В марте 2022 года Токарев и члены семьи были внесены в санкционные списки США[25][26], Великобритании, Швейцарии, Австралии, Новой Зеландии и Японии[27].
В сентябре 2024 года суд юстиции в Люксембурге удовлетворил иски двоюродного брата российского бизнесмена Олега Дерипаски Павла Езубова и дочери главы «Транснефти» Николая Токарева Майи Токаревой с требованием снять санкции ЕС. В случае с Токаревой суд не только аннулировал санкции ЕС, но и поручил Совету ЕС оплатить расходы истицы[28].
Дочь — Майя Николаевна Болотова — владелица фармацевтического холдинга «ФармЭКО» и «Ирвин 2». Кроме этого владеет компанией, управлявшей элитным курортом в Хорватии, и вместе с мужем — компанией «РПА эстейт», на которую в 2016 году был куплен памятник архитектуры — доходный дом Кекушевой на Остоженке[30]. Вместе с мужем имеет гражданство Кипра.
Зять — Андрей Болотов — в прошлом вице-президент банка «ВТБ» по работе с крупными клиентами.