В настоящее время, в соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации от 30.06.2012 № 666, Росрыболовство находится в ведении Министерства сельского хозяйства Российской Федерации.
Постановлением Правительства Российской Федерации от 11.06.2008 № 444 утверждено Положение о Федеральном агентстве по рыболовству.
В соответствии с пунктом 12 указа президента Российской Федерации от 21 мая 2012 г. № 636 «О структуре федеральных органов исполнительной власти» полномочия по нормативно-правовому регулированию в сфере рыболовства, производственной деятельности на судах рыбопромыслового флота, охраны, рационального использования, изучения, сохранения, воспроизводства водных биологических ресурсов и среды их обитания, а также по контролю и надзору за водными биологическими ресурсами и средой их обитания во внутренних водах Российской Федерации переданы в Министерство сельского хозяйства Российской Федерации. Федеральное агентство по рыболовству перешло в ведение Министерства сельского хозяйства Российской Федерации.
Росрыболовство является федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции:
по оказанию государственных услуг;
управлению государственным имуществом в сфере рыбохозяйственной деятельности, охраны, рационального использования, изучения, сохранения, воспроизводства водных биологических ресурсов и среды их обитания;
рыбоводства (за исключением промышленного рыбоводства);
рыбопереработки;
обеспечения безопасности мореплавания и аварийно-спасательных работ в районах промысла;
производственной деятельности на судах рыбопромыслового флота и в морских портах в части, касающейся обслуживания судов рыбопромыслового флота.