Систематика бактерий

Бактериальная клетка обладает относительно простым строением и не имеет оформленного ядра. Её генетический материал представлен нуклеоидом — зоной в цитоплазме, содержащей бактериальную хромосому. Также в цитоплазме могут присутствовать плазмиды — небольшие автономные кольцевые молекулы ДНК^[2]. Снаружи клетка покрыта клеточной стенкой, основу которой составляет биополимер пептидогликан (муреин). В зависимости от строения стенки бактерии делятся на грамположительные (имеют толстую клеточную стенку из многослойного пептидогликана) и грамотрицательные (имеют тонкую стенку, в которой слой пептидогликана окружён наружной мембраной). На поверхности бактериальной клетки могут располагаться жгутики и пили (фимбрии). Жгутики обеспечивают движение клетки и состоят из базального тела, крюка и жгутиковой нити. Пили служат для адгезии к различным поверхностям, а также участвуют в процессе конъюгации.

По способу получения энергии бактерии делятся на фототрофов и хемотрофов. Фототрофы используют энергию света, осуществляя фотосинтез, который может быть аноксигенным (без выделения кислорода) или оксигенным (с выделением кислорода). Хемотрофы получают энергию в результате химических реакций и подразделяются на хемолитоавтотрофов, окисляющих неорганические соединения, и хемоорганогетеротрофов, использующих готовые органические вещества. По типу дыхания выделяют аэробное (с использованием молекулярного кислорода в качестве конечного акцептора электронов) и анаэробное дыхание (с использованием нитратов, сульфатов и других соединений). В зависимости от отношения к кислороду бактерии классифицируются на облигатных аэробов (строго нуждаются в кислороде), облигатных анаэробов (растут только в отсутствие кислорода), факультативных анаэробов (способны развиваться как в присутствии, так и в отсутствие кислорода), микроаэрофилов (нуждаются в пониженных концентрациях кислорода) и аэротолерантных (не используют кислород, но выживают в его присутствии).

В мае 2024 года Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) опубликовала обновлённый список приоритетных бактериальных патогенов, представляющих глобальную угрозу из-за устойчивости к противомикробным препаратам^[3]. Патогены в документе разделены на три категории по уровню приоритетности: критический, высокий и средний^[3]. В группу критического уровня приоритетности включены бактерии, устойчивые к лечению и способные передавать гены резистентности: устойчивые к карбапенемам Acinetobacter baumannii и энтеробактерии (Enterobacterales), а также устойчивая к рифампицину микобактерия туберкулёза (Mycobacterium tuberculosis)^[4]. Наличие групп высокого и среднего приоритета дополнительно подчёркивает масштаб проблемы антибиотикорезистентности для общественного здравоохранения^[3].

В 2025 году международная группа учёных объявила об идентификации 26 ранее неизвестных видов экстремофильных бактерий, обнаруженных в «чистых комнатах» NASA. Эти микроорганизмы отличаются высокой устойчивостью к агрессивной химической очистке, радиации и перепадам температур. Открытие имеет важное значение для обеспечения планетарной защиты, так как подчёркивает риск межпланетного загрязнения при исследовании космоса, а также представляет интерес для развития биотехнологий^[5].

В 2024 году в соответствии с Международным кодексом номенклатуры прокариот (ICNP) были официально утверждены новые царства бактерий, включая Bacillati, Fusobacteriati, Pseudomonadati и Thermotogati^[6].

• Класс Aquificae

Порядок Aquificales * Семейство Aquificaceae ' Роды Aquifex, Calderobacterium, Hydrogenobaculum, Hydrogenobacter, Hydrogenothermus, Persephonella, Sulfurihydrogenibium, Thermocrinis * Роды incertae sedis Desulfurobacterium, Thermovibrio

• Класс Thermotogae

Порядок Thermotogales * Семейство Thermotogaceae ' Роды Thermotoga, Fervidobacterium, Geotoga, Marinitoga, Petrotoga, Thermosipho

• Класс Thermodesulfobacteria

Порядок Thermodesulfobacteriales * Семейство Thermodesulfobacteriaceae ' Род Thermodesulfobacterium

• Класс Deinococci

Порядок Deinococcales * Семейство Deinococcaceae ' Род Deinococcus Порядок Thermales * Семейство Thermaceae ' Роды Thermus, Marinithermus, Meiothermus, Oceaniothermus, Vulcanithermus

• Класс Chrysiogenetes

Порядок Chrysiogenales * Семейство Chrysiogenaceae ' Род Chrysiogenes

• Класс «Chloroflexi»

Порядок «Chloroflexales» * Семейство «Chloroflexaceae» ' Роды Chloroflexus, Chloronema, Heliothrix, Roseiflexus * Семейство Oscillochloriaceae ' Род Oscillochloris Порядок Herpetosiphonales * Семейство Herpetosiphonaceae ' Род Herpetosiphon

• Класс Anaerolinae

Порядок Anaerolinales * Семейство Anaerolinaceae

• Класс Thermomicrobia

Порядок Thermomicrobiales * Семейство Thermomicrobiaceae ' Род Thermomicrobium

• Класс Nitrospira

Порядок Nitrospirales * Семейство Nitrospiraceae ' Роды Nitrospira, Leptospirillum, Magnetobacterium, Thermodesulfovibrio

• Класс Deferribacteres

Порядок Deferribacterales * Семейство Deferribacteraceae ' Роды Deferribacteres, Denitrovibrio, Flexistipes, Geovibrio

• Класс Cyanobacteria

Согласно Международному кодексу номенклатуры прокариот (ICNP), валидным названием типа является Cyanobacteriota^[7]. Среди недавних научных открытий — обнаружение у цианобактерий фотопериодизма^[8], а также их успешное использование для производства прекурсоров биопластика^[9].

• Класс Chlorobia

Порядок Chlorobiales * Семейство Chlorobiaceae ' Роды Chlorobium, Ancalochloris, Chlorobalum, Chloroherpeton, Pelodictyon, Prosthecochloris

Тип, ранее известный как протеобактерии (лат. Proteobacteria), официально переименован в Pseudomonadota и отнесён к царству Pseudomonadati^[10]. Многие представители этого отдела (например, Acinetobacter, энтеробактерии, Pseudomonas) входят в список приоритетных бактериальных патогенов ВОЗ 2024 года^[11].

• Класс Alphaproteobacteria

Порядок Rhodospirillales * Семейство Rhodospirillaceae ' Роды Rhodospirillum, Azospirillum, Levispirillum, Magnetospirillum, Phaeospirillum, Rhodocista, Rhodospira, Rhodovibrio, Roseospira, Roseospirillum, Skermanella ' Род incertae sedis «Sporospirillum» * Семейство Acetobacteraceae ' Роды Acetobacter, Acidiphilium, Acidisphaera, Acidocella, Acidomonas, Asaia, Craurococcus, Gluconacetobacter, Gluconobacter, Paracraurococcus, Rhodopila, Roseococcus, Roseomonas, Stella, Zavarzinia Порядок Rickettsiales * Семейство Rickettsiaceae ' Роды Rickettsia, Orientia * Семейство Anaplasmataceae ' Роды Anaplasma, Ehrlichia, Neorickettsia, Wolbachia * Род incertae sedis Aegyptianella * Семейство Holosporaceae ' Род Holospora * Роды incertae sedis Caedibacter, Lyticum, Odyssella, Pseudocaedibacter, Pseudolyticum, Tectibacter Порядок Rhodobacterales * Семейство Rhodobacteraceae ' Роды Rhodobacter, Ahrensia, Amaricoccus, Antarctobacter, Gemmobacter, Hirschia, Hyphomonas, Ketogulonicigenium, Maricaulis, Methylarcula, Octadecabacter, Paracoccus, Rhodobaca, Rhodovulum, Roseibium, Roseinatronobacter, Roseivivax, Roseobacter, Roseovarius, Rubrimonas, Ruegeria, Sagittula, Staleya, Stappia, Sulfitobacter * Род incertae sedis Rhodothalassium Порядок Sphingomonadales * Семейство Sphingomonadaceae ' Роды Sphingomonas, Blastomonas, Citromicrobium, Erythrobacter, Erythromicrobium, Erythromonas, Porphyrobacter, Sandaracinobacter, Zymomonas Порядок Caulobacterales * Семейство Caulobacteraceae ' Роды Caulobacter, Asticcacaulis, Brevundimonas, Phenylobacterium Порядок Rhizobiales * Семейство Rhizobiaceae ' Роды Rhizobium, Agrobacterium, Allorhizobium, Carbophilus, Chelatobacter, Ensifer, Sinorhizobium * Семейство Bartonellaceae ' Род Bartonella * Семейство Brucellaceae ' Роды Brucella, Mycoplana, Ochrobactrum * Семейство Phyllobacteriaceae ' Роды Phyllobacterium, Aminobacter, Aquamicrobium, Defluvibacter, Liberibacter, Mesorhizobiumm, Pseudominobacter * Семейство Methylocystaceae ' Роды Methylocystis, Albibacter, Methylosinus * Род incertae sedis Methylopila * Семейство Beijerinckiaceae ' Роды Beijerinckia, Chelatococcus, Methylocella * Семейство Bradyrhizobiaceae ' Роды Bradyrhizobium, Afipia, Agromonas, Blastobacter, Bosea, Nitrobacter, Oligotropha, Rhodoblastus, Rhodopseudomonas * Семейство Hyphomicrobiaceae ' Роды Hyphomicrobium, Ancalomicrobium, Ancylobacter, Angulomicrobium, Aquabacter, Azorhizobium, Blastochloris, Devosia, Dichotomicrobium, Filomicrobium, Gemmiger, Labrys, Methylorhabdus, Pedomicrobium, Prosthecomicrobium, Rhodomicrobium, Rhodoplanes, Seliberia, Starkeya, Xanthobacter * Семейство Methylobacteriaceae ' Род Methylobacterium * Семейство Rhodobiaceae ' Род Rhodobium

• Класс Betaproteobacteria

Порядок Burkholderiales * Семейство Burkholderiaceae ' Роды Burkholderia, Cupriavidus, Lautropia, Pandoraea, Paucimonas, Polynucleobacter, Ralstonia, Thermothrix * Семейство Oxalobacteraceae ' Роды Oxalobacter, Duganella, Herbaspirillum, Janthinobacterium, Massilia, Telluria * Семейство Alcaligenaceae ' Роды Alcaligenes, Achromobacter, Bordetella, Derxia, Oligella, Pelistega, Pigmentiphaga, Sutterella, Taylorella * Семейство Comamonadaceae ' Роды Comamonas, Acidovorax, Brachymonas, Delftia, Hydrogenophaga, Lampropedia, Macromonas, Polaromonas, Rhodoferax, Variovorax * Роды incertae sedis Aquabacterium, Ideonella, Leptothrix, Roseateles, Rubrivivax, Sphaerotilus, Tepidimonas, Thiomonas, Xylophilus Порядок Hydrogenophilales * Семейство Hydrogenophilaceae ' Роды Hydrogenophilus, Thiobacillus Порядок Methylophilales * Семейство Methylophilaceae ' Роды Methylophilus, Methylobacillus, Methylovorus Порядок Neisseriales * Семейство Neisseriaceae ' Роды Neisseria, Alysiella, Aquaspirillum, Chromobacterium, Eikenella, Formivibrio, Iodobacter, Kingella, Microvirgula, Prolinoborus, Simonsiella, Vitreoscilla, Vogesella * Роды incertae sedis Catenococcus, Morococcus Порядок Nitrosomonadales * Семейство Nitrosomonadaceae ' Роды Nitrosomonas, Nitrosolobus, Nitrosospira, Nitrosovibrio * Семейство Spirillaceae ' Род Spirillum * Семейство Gallionellaceae ' Род Gallionella Порядок Rhodocyclales * Семейство Rhodocyclaceae ' Роды Rhodocyclus, Azoarcus, Azonexus, Azospira, Azovibrio, Dechloromonas, Dechlorosoma, Ferribacterium, Propionibacter, Propionivibrio, Thauera, Zoogloea

• Класс Gammaproteobacteria

Порядок Chromatiales * Семейство Chromatiaceae ' Роды Chromatium, Allochromatium, Halochromatium, Isochromatium, Lamprobacter, Lamprocystis, Marichromatium, Nitrosococcus, Pfennigia, Rhabdochromatium, Thermochromatium, Thioalkalicoccus, Thiocapsa, Thiococcus, Thiocystis, Thiodictyon, Thiohalocapsa, Thiolamprovum, Thiopedia, Thiorhodococcus, Thiorhodovibrio, Thiospirillum * Семейство Ectothiorhodospiraceae ' Роды Ectothiorhodospira, Arhodomonas, Halorhodospira, Nitrococcus, Thioalkalivibrio, Thiorhodospira * Семейство Halothiobacillaceae ' Род Halothiobacillus Порядок Acidithiobacillales * Семейство Acidithiobacillaceae ' Род Acidithiobacillus * Семейство Thermithiobacillaceae ' Род Thermithiobacillus Порядок Xanthomonadales * Семейство Xanthomonadaceae ' Роды Xanthomonas, Frateuria, Luteimonas, Lysobacter, Nevskia, Pseudoxanthomonas, Rhodanobacter, Schineria, Stenotrophomonas, Thermomonas, Xylella Порядок Cardiobacteriales * Семейство Cardiobacteriaceae ' Роды Cardiobacterium, Dichelobacter, Suttonella Порядок Thiotrichales * Семейство Thiotrichaceae ' Роды Thiothrix, Achromatium, Beggiatoa, Leucothrix, Thiobacterium, Thiomargarita, Thioploca, Thiospira * Семейство Piscirickettsiaceae ' Роды Piscirickettsia, Cycloclasticus, Hydrogenovibrio, Methylophaga, Thioalkalimicrobium, Thiomicrospira * Семейство Francisellaceae ' Род Francisella Порядок Legionellales * Семейство Legionellaceae ' Род Legionella * Семейство Coxiellaceae ' Роды Coxiella, Rickettsiella Порядок Methylococcales * Семейство Methylococcaceae ' Роды Methylococcus, Methylobacter, Methylocaldum, Methylomicrobium, Methylomonas, Methylosarcina, Methylosphaera Порядок Oceanospirillales * Семейство Oceanospirillaceae ' Роды Oceanospirillum, Balneatrix, Marinomonas, Marinospirillum, Neptunomonas * Семейство Alcanivoraceae ' Род Alcanivorax * Семейство Hahellaceae ' Роды Hahella * Семейство Halomonadaceae ' Роды Halomonas, Caminomonas, Chromohalobacter, Zymobacter Порядок Pseudomonadales * Семейство Pseudomonadaceae ' Роды Pseudomonas, Azomonas, Azotobacter, Cellvibrio, Mesopllilobacter, Rhizobacter, Rugamonas, Serpens * Семейство Moraxellaceae ' Роды Moraxella, Acinetobacter, Psychrobacter * Род incertae sedis Enhydrobacter Порядок Alteromonadales * Семейство Alteromonadaceae ' Роды Alteromonas, Alishewanella, Colwellia, Ferrimonas, Glaciecola, Idiomarina, Marinobacter, Marinobacterium, Microbulbifer, Moritella, Pseudoalteromonas, Psychromonas, Shewanella Порядок Vibrionales * Семейство Vibrionaceae ' Роды Vibrio, Photobacterium, Salinivibrio Порядок Aeromonadales * Семейство Aeromonadaceae ' Роды Aeromonas, Oceanimonas * Род incertae sedis Tolumonas * Семейство Succinivibrionaceae ' Роды Succinivibrio, Anaerobiospirillum, Ruminobacter, Succinimonas Порядок Enterobacteriales * Семейство Enterobacteriaceae ' Роды Escherichia, Alterococcus, Arsenophonus, Brenneria, Buchnera, Budvicia, Buttiauxella, Calymmatobacterium, Cedecea, Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Erwinia, Ewingella, Hafnia, Klebsiella, Kluyvera, Leclercia, Leminorella, Moellerella, Morganella, Obesumbacterium, Pantoea, Pectobacterium, Candidatus Phlomobacter, Photorhabdus, Plesiomonas, Pragia, Proteus, Providencia, Ralmella, Saccharobacter, Salmonella, Serratia, Shigella, Sodalis, Tatumella, Trabulsiella, Wigglesworthia, Xenorhabdus, Yersinia, Yokenella Порядок Pasteurellales * Семейство Pasteurellaceae ' Роды Pasteurella, Actinobacillus, Haemophilus, Lonepinella, Mannheimia, Phocoenobacter

• Класс Deltaproteobacteria

Порядок Desulfurellales * Семейство Desulfurellaceae ' Роды Desulfurella, Hippea Порядок Desulfovibrionales * Семейство Desulfovibrionaceae ' Роды Desulfovibrio, Bilophila, Lawsonia * Семейство Desulfomicrobiaceae ' Род Desulfomicrobium * Семейство Desulfohalobiaceae ' Роды Desulfohalobium, Desulfonatronovibrio, Desulfothermus * Семейство Desulfonatronumaceae ' Род Desulfonatronum Порядок Desulfobacterales * Семейство Desulfobacteraceae ' Роды Desulfobacter, Desulfobacterium, Desulfobacula, Desulfobotulus, Desulfocella, Desulfococcus, Desulfofaba, Desulfofrigus, Desulfonema, Desulfosarcina, Desulfospira, Desulfotignum * Семейство Desulfobulbaceae ' Роды Desulfobulbus, Desulfocapsa, Desulfofustis, Desulforhopalus, Desulfotalea * Семейство Nitrospinaceae ' Род Nitrospina Порядок Desulfarcales * Семейство Desulfarculaceae ' Род Desulfarculus Порядок Desulfuromonales * Семейство Desulfuromonaceae ' Роды Desulfuromonas, Desulfuromusa, Malonomonas, Pelobacter * Семейство Geobacteraceae ' Роды Geobacter, Trichlorobacter Порядок Syntrophobacterales * Семейство Syntrophobacteraceae ' Роды Syntrophobacter, Desulfacinum, Desulforhabdus, Desulfovirga, Thermodesulforhabdus * Семейство Syntrophaceae ' Роды Syntrophus, Desulfobacca, Desulfomonile, Smithella Порядок Bdellovibrionales * Семейство Bdellovibrionaceae ' Роды Bdellovibrio, Bacteriovorax, Micavibrio, Vampirovibrio Порядок Myxococcales * Семейство Myxococcaceae ' Роды Myxococcus, Corallococcus, Pyxicoccus, Chondromyces * Семейство Cystobacteraceae ' Роды Cystobacter, Archangium, Hyalangium, Melittangium, Stigmatella * Семейство Polyangiaceae ' Роды Polyangium, Byssophaga, Haploangium, Jahmia, Sorangium * Семейство Nannocystaceae ' Род Nannocystis * Семейство Kofleriaceae ' Род Kofleria

• Класс Epsilonproteobacteria

Порядок Campylobacterales * Семейство Campylobacteraceae ' Роды Campylobacter, Arcobacter, Sulfurospirillum * Семейство Helicobacteraceae ' Роды Helicobacter, Thiovulum, Wolinella

Согласно актуальной номенклатуре, тип получил валидное название Bacillota и включён в состав нового царства Bacillati^[1][6]. Основными признанными классами являются Bacilli, Clostridia, Negativicutes и Erysipelotrichia^[12].

• Класс Bacilli

Порядок Bacillales * Семейство Alicyclobacillaceae ' Роды Alicyclobacillus, Pasteuria, Sulfobacillus * Семейство Bacillaceae ' Роды Alkalibacillus, Amphibacillus, Anoxybacillus, Bacillus, Caldalkalibacillus, Cerasibacillus, Exiguobacterium, Filobacillus, Geobacillus, Gracilibacillus, Halalkalibacillus, Halobacillus, Halolactibacillus, Jeotgalibacillus, Lentibacillus, Lysinibacillus, Marinibacillus, Oceanobacillus, Ornithinibacillus, Paraliobacillus, Paucisalibacillus, Pelagibacillus, Piscibacillus, Pontibacillus, Saccharococcus, Salibacillus, Salimicrobium, Salinibacillus, Salirhabdus, Salsuginibacillus, Tenuibacillus, Terribacillus, Thalassobacillus, Ureibacillus, Virgibacillus, Vulcanibacillus * Семейство Caryophanaceae ' Род Caryophanon * Семейство Listeriaceae ' Роды Brochothrix, Listeria * Семейство Paenibacillaceae ' Роды Paenibacillus, Ammoniphilus, Aneurinibacillus, Brevibacillus, Oxalophagus, Thermicanus, Thermobacillus * Семейство Planococcaceae ' Роды Filibacter, Kurthia, Planomicrobium, Sporosarcina * Семейство Sporolactobacillaceae ' Роды Sporolactobacillus, Marinococcus * Семейство Staphylococcaceae ' Роды Staphylococcus, Gemella, Jeotgalicoccus, Macrococcus, Salinicoccus * Семейство Thermoactinomycetaceae ' Род Thermoactinomyces * Семейство Turicibacteraceae ' Род Turicibacter Порядок Lactobacillales * Семейство Aerococcaceae ' Род Aerococcus * Семейство Carnobacteriaceae ' Род Carnobacterium * Семейство Enterococcaceae ' Роды Atopobacter, Enterococcus, Melissococcus, Tetragenococcus, Vagococcus * Семейство Lactobacillaceae ' Роды Lactobacillus, Paralactobacillus, Pediococcus * Семейство Leuconostocaceae ' Роды Leuconostoc, Oenococcus, Weissella * Семейство Streptococcaceae ' Роды Lactococcus, Lactovum, Pilibacter, Streptococcus

• Класс Clostridia

Порядок Clostridiales * Семейство Acidaminococcaceae ' Роды Acetonema, Acidaminococcus, Anaeromusa, Dialister, Megasphaera, Pectinatus, Phascolarctobacterium, Quinella, Schwartzia, Selenomonas, Sporomusa, Succinclasticum, Veillonella, Zymophilus * Семейство Clostridiaceae ' Роды Acetanaerobacterium, Acetivibrio, Acidaminobacter, Alkaliphilus, Anaerobacter, Anaerotruncus, Anoxynatronum, Bryantella, Caldanaerocella, Caloramator, Caloranaerobacter, Caminicella, Candidatus Arthromitus, Clostridium, Coprobacillus, Dorea, Ethanologenbacterium, Faecalibacterium, Garciella, Guggenheimella, Hespellia, Linmingia, Natronincola, Oxobacter, Parasporobacterium, Sarcina, Soehngenia, Sporobacter, Subdoligranulum, Tepidibacter, Tepidimicrobium, Thermobrachium, Thermohalobacter, Tindallia * Семейство Eubacteriaceae ' Род Eubacterium * Семейство Heliobacteriaceae ' Роды Heliobacterium, Heliobacillus, Heliophilum, Heliorestis * Семейство Lachnospiraceae ' Род Lachnospira * Семейство Peptococcaceae ' Род Peptococcus * Семейство Peptostreptococcaceae ' Роды Filifactor, Finegoldia, Fusibacter, Helcococcus, Micromonas, Peptostreptococcus, Tissierella * Семейство Syntrophomonadaceae ' Род Syntrophomonas Порядок Halanaerobiales * Семейство Halanaerobiaceae ' Род Halanaerobium * Семейство Halobacteroidaceae ' Род Halobacteroides Порядок Thermoanaerobacteriales * Семейство Thermoanaerobacteriaceae * Семейство Thermodesulfobiaceae

• Класс Mollicutes

Порядок Mycoplasmatales * Семейство Mycoplasmataceae ' Роды Candidatus Hepatoplasma, Mycoplasma, Ureaplasma Порядок Entomoplasmatales * Семейство Entomoplasmataceae ' Роды Entomoplasma, Mesoplasma * Семейство Spiroplasmataceae ' Род Spiroplasma Порядок Anaeroplasmatales * Семейство Anaeroplasmataceae ' Роды Anaeroplasma, Asteroleplasma * Семейство Erysipelotrichaceae ' Роды Erysipelothrix, Holdemania, Solobacterium Порядок Acholeplasmatales * Семейство Acholeplasmataceae ' Роды Acholeplasma, Candidatus Phytoplasma

• Класс Bacteroidia

Порядок Bacteroidales * Семейство Bacteroidaceae ' Роды Acetofilamentum, Acetomicrobium, Acetothermus, Anaerorhabdus, Bacteroides * Семейство Marinilabiaceae ' Роды Alkaliflexus, Anaerophaga, Marinilabilia * Семейство Porphyromonadaceae ' Роды Barnesiella, Capsularis, Dysgonomonas, Odoribacter, Oribaculum, Paludibacter, Parabacteroides, Petrimonas, Porphyromonas, Proteiniphilum, Tannerella * Семейство Prevotellaceae ' Роды Hallella, Prevotella, Xylanibacter * Семейство Rikenellaceae ' Роды Alistipes, Rikenella

• Класс Flavobacteria

Порядок Flavobacteriales * Семейство Blattabacteriaceae ' Род Blattabacterium * Семейство Cryomorphaceae ' Роды Brumimicrobium, Crocinitomix, Cryomorpha, Fluviicola, Lishizhenia, Owenweeksia, Sediminitomix * Семейство Flavobacteriaceae ' Роды Actibacter, Aequorivita, Algibacter, Aquimarina, Arenibacter, Bergeyella, Bizionia, Capnocytophaga, Cellulophaga, Chryseobacterium, Cloacibacterium, Coenonia, Costertonia, Croceibacter, Dokdonia, Donghaeana, Elizabethkingia, Empedobacter, Epilithonimonas, Flagellimonas, Flaviramulus, Flavobacterium, Formosa, Fulvibacter, Gaetbulibacter, Gaetbulimicrobium, Galbibacter, Gelidibacter, Gillisia, Gilvibacter, Gramella, Joostella, Kaistella, Kordia, Krokinobacter, Lacinutrix, Leeuwenhoekiella, Lutibacter, Lutimonas, Maribacter, Mariniflexile, Marixanthomonas, Mesoflavibacter, Mesonia, Muricauda, Myroides, Nonlabens, Olleya, Ornithobacterium, Persicivirga, Pibocella, Polaribacter, Psychroflexus, Psychroserpens, Riemerella, Robiginitalea, Salinimicrobium, Salegentibacter, Sandarakinotalea, Sediminibacter, Sediminicola, Sejongia, Stanierella, Stenothermobacter, Subsaxibacter, Subsaximicrobium, Tamlana, Tenacibaculum, Ulvibacter, Vitellibacter, Wautersiella, Weeksella, Winogradskyella, Yeosuana, Zeaxanthinibacter, Zhouia, Zobellia, Zunongwangia '* Formosa bonchosmolovskayae — морской вид, описанный в 2026 году и выделенный из водорослей^[13].

• Класс Sphingobacteria

Порядок Sphingobacteriales * Семейство Chitinophagaceae ' Роды Balneola, Chitinophaga, Niastella, Terrimonas, Toxothrix * Семейство Cyclobacteriaceae ' Роды Algoriphagus, Aquiflexum, Belliella, Chimaereicella, Cyclobacterium, Echinicola, Hongiella * Семейство Cytophagaceae ' Роды Adhaeribacter, Arcicella, Cytophaga, Dyadobacter, Effluviibacter, Emticicia, Flectobacillus, Flexibacter, Hymenobacter, Larkinella, Leadbetterella, Meniscus, Microscilla, Persicitalea, Pontibacter, Rhodonellum, Rudanella, Runella, Spirosoma, Sporocytophaga * Семейство Flammeovirgaceae ' Роды Fabibacter, Flammeovirga, Flexithrix, Limibacter, Marinicola, Perexilibacter, Persicobacter, Rapidithrix, Reichenbachiella, Roseivirga, Thermonema * Семейство Rhodothermaceae ' Роды Rhodothermus, Salinibacter * Семейство Saprospiraceae ' Роды Aureispira, Haliscomenobacter, Lewinella, Saprospira * Семейство Sphingobacteriaceae ' Роды Mucilaginibacter, Nubsella, Olivibacter, Parapedobacter, Pedobacter, Pseudosphingobacterium, Sphingobacterium * Род incertae sedis Niabella

• «Bacteroidetes», Роды incertae sedis Flavisolibacter, Fulvivirga, Prolixibacter, Segetibacter

• Класс Planctomycetia

Порядок Planctomycetales * Семейство Planctomycetaceae ' Роды Blastopirellula, Gemmata, Isosphaera, Pirellula, Planctomyces, Rhodopirellula, Schlesneria, Singulisphaera, candidatus Brocadia, candidatus Kuenenia, candidatus Scalindua, candidatus Anammoxoglobus

• Класс Chlamydiae

Порядок Chlamydiales * Семейство Chlamydiaceae ' Роды Chlamydia, Chlamydophila * Семейство Parachlamydiaceae ' Роды Neochlamydia, Parachlamydia * Семейство Simkaniaceae ' Род Simkania * Семейство Waddliaceae ' Род Waddlia

• Класс Spirochaetes

Порядок Spirochaetales * Семейство Brachyspiraceae ' Роды Brachyspira, Serpulina * Семейство Brevinemataceae ' Род Brevinema * Семейство Leptospiraceae ' Роды Leptonema, Leptospira, Turneriella * Семейство Spirochaetaceae ' Роды Borrelia, Clevelandina, Cristispira, Diplocalyx, Hollandina, Pillotina, Spirochaeta, Treponema

• Класс Fibrobacteria

ПорядокFibrobacterales * Семейство Fibrobacteraceae ' Род Fibrobacter

В 2024 году тип Fusobacteriota был выделен в самостоятельное царство Fusobacteriati^[14]. Ключевые представители отдела, такие как Fusobacterium nucleatum и Fusobacterium necrophorum, вызывают различные заболевания^[15], однако по состоянию на 2024 год они не входят в список приоритетных патогенов ВОЗ^[3][11].

• Класс Fusobacteria

Порядок Fusobacteriales * Семейство Fusobacteriaceae ' Роды Cetobacterium, Fusobacterium, Ilyobacter, Propionigenium * Семейство Leptotrichiaceae ' Роды Leptotrichia, Sebaldella, Sneathia, Streptobacillus

• Класс Acidobacteria

Порядок Acidobacteriales * Семейство Acidobacteriaceae ' Роды Acidobacterium, Edaphobacter, Geothrix, Holophaga, Terriglobus

• Класс Verrucomicrobiae

Порядок Verrucomicrobiales * Семейство Akkermansiaceae ' Род Akkermansia * Семейство Rubritaleaceae ' Род Rubritalea * Семейство Verrucomicrobiaceae ' Роды Luteolibacter, Persicirhabdus, Prosthecobacter, Roseibacillus, Verrucomicrobium

• Класс Opitutae

Порядок Opitutales * Семейство Opitutaceae ' Роды Alterococcus, Opitutus Порядок Puniceicoccales * Семейство Puniceicoccaceae ' Роды Cerasicoccus, Coraliomargarita, Pelagicoccus, Puniceicoccus

• Класс Dictyoglomia

Порядок Dictyoglomales * Семейство Dictyoglomaceae ' Род Dictyoglomus

• Класс Gemmatimonadetes

Порядок Gemmatimonadales * Семейство Gemmatimonadaceae ' Род Gemmatimonas

• Класс Actinobacteria

Порядок Acidimicrobiales * Семейство Acidimicrobiaceae ' Род Acidimicrobium Порядок Actinomycetales * Семейство Actinomycetaceae ' Роды Actinobaculum, Actinomyces, Arcanobacterium, Falcivibrio, Mobiluncus, Varibaculum * Семейство Actinospicaceae ' Род Actinospica * Семейство Catenulisporaceae ' Род Catenulispora * Семейство Corynebacteriaceae ' Роды Bacterionema, Caseobacter, Corynebacterium * Семейство Dietziaceae ' Род Dietzia * Семейство Gordoniaceae ' Роды Gordonia, Millisia, Skermania * Семейство Mycobacteriaceae ' Род Mycobacterium * Семейство Nocardiaceae ' Роды Micropolyspora, Nocardia, Rhodococcus, Smaragdicoccus * Семейство Segniliparaceae ' Род Segniliparus * Семейство Tsukamurellaceae ' Род Tsukamurella * Семейство Williamsiaceae ' Род Williamsia * Семейство Acidothermaceae ' Род Acidothermus * Семейство Kineosporiaceae ' Роды Cryptosporangium, Kineococcus, Kineosporia * Семейство Frankiaceae ' Род Frankia * Семейство Geodermatophilaceae ' Роды Blastococcus, Geodermatophilus, Modestobacter * Семейство Nakamurellaceae ' Роды Humicoccus, Nakamurella, Quadrisphaera, Saxeibacter * Семейство Sporichthyaceae ' Род Sporichthya * Семейство Glycomycetaceae ' Роды Glycomyces, Stackebrandtia * Семейство Beutenbergiaceae ' Роды Beutenbergia, Georgenia, Salana * Семейство Bogoriellaceae ' Род Bogoriella * Семейство Brevibacteriaceae ' Род Brevibacterium * Семейство Cellulomonadaceae ' Роды Actinotalea, Cellulomonas, Oerskovia, Tropheryma * Семейство Dermabacteraceae ' Роды Brachybacterium, Dermabacter * Семейство Dermacoccaceae ' Роды Demetria, Dermacoccus, Kytococcus * Семейство Dermatophilaceae ' Роды Dermatophilus, Kineosphaera * Семейство Intrasporangiaceae ' Роды Arsenicicoccus, Humibacillus, Humihabitans, Intrasporangium, Janibacter, Knoellia, Kribbia, Lapillicoccus, Ornithinicoccus, Ornithinimicrobium, Oryzihumus, Phycicoccus, Serinicoccus, Terrabacter, Terracoccus, Tetrasphaera * Семейство Jonesiaceae ' Род Jonesia * Семейство Microbacteriaceae ' Роды Agreia, Agrococcus, Agromyces, Aureobacterium, Clavibacter, Cryobacterium, Curtobacterium, Frigoribacterium, Frondicola, Gulosibacter, Humibacter, Labedella, Leifsonia, Leucobacter, Microbacterium, Microcella, Microterricola, Mycetocola, Okibacterium, Phycicola, Plantibacter, Pseudoclavibacter, Rathayibacter, Rhodoglobus, Salinibacterium, Subtercola, Yonghaparkia, Zimmermannella * Семейство Micrococcaceae ' Роды Acaricomes, Arthrobacter, Citricoccus, Kocuria, Micrococcus, Nesterenkonia, Renibacterium, Rothia, Stomatococcus, Zhihengliuella * Семейство Promicromonosporaceae ' Роды Cellulosimicrobium, Isoptericola, Myceligenerans, Promicromonospora, Xylanibacterium, Xylanimonas * Семейство Rarobacteraceae ' Род Rarobacter * Семейство Sanguibacteraceae ' Род Sanguibacter * Семейство Yaniellaceae ' Род Yaniella * Семейство Micromonosporaceae ' Роды Actinocatenispora, Actinoplanes, Amorphosporangium, Ampullariella, Asanoa, Catellatospora, Catelliglobosispora, Catenuloplanes, Couchioplanes, Dactylosporangium, Hamadaea, Krasilnikovia, Longispora, Luedemannella, Micromonospora, Pilimelia, Planopolyspora, Planosporangium, Polymorphospora, Pseudosporangium, Salinispora, Spirilliplanes, Verrucosispora, Virgisporangium * Семейство Nocardioidaceae ' Роды Actinopolymorpha, Aeromicrobium, Friedmanniella, Hongia, Kribbella, Marmoricola, Micropruina, Nocardioides, Pimelobacter, Propionicicella, Propionicimonas * Семейство Propionibacteriaceae ' Роды Aestuariimicrobium, Arachnia, Brooklawnia, Granulicoccus, Jiangella, Luteococcus, Microlunatus, Propionibacterium, Propioniferax, Propionimicrobium, Tessaracoccus * Семейство Actinosynnemataceae ' Роды Actinokineospora, Actinosynnema, Lechevalieria, Lentzea, Saccharothrix, Umezawaea * Семейство Pseudonocardiaceae ' Роды Actinoalloteichus, Actinobispora, Actinomycetospora, Actinopolyspora, Allokutzneria, Amycolata, Amycolatopsis, Crossiella, Faenia, Goodfellowiella, Kibdelosporangium, Kutzneria, Prauserella, Pseudoamycolata, Pseudonocardia, Saccharomonospora, Saccharopolyspora, Streptoalloteichus, Thermobispora, Thermocrispum * Семейство Streptomycetaceae ' Роды Actinopycnidium, Actinosporangium, Chainia, Elytrosporangium, Kitasatoa, Kitasatospora, Microellobosporia, Streptacidiphilus, Streptomyces, Streptoverticillium * Семейство Nocardiopsaceae ' Роды Nocardiopsis, Streptomonospora, Thermobifida * Семейство Streptosporangiaceae ' Роды Acrocarpospora, Herbidospora, Microbispora, Microtetraspora, Nonomuraea, Planobispora, Planomonospora, Planotetraspora, Sphaerisporangium, Streptosporangium, Thermopolyspora * Семейство Thermomonosporaceae ' Роды Actinocorallia, Actinomadura, Excellospora, Spirillospora, Thermomonospora * «Actinomycetales», Роды incertae sedis Demequina, Ruania, Fodinicola Порядок Bifidobacteriales * Семейство Bifidobacteriaceae ' Роды Aeriscardovia, Alloscardovia, Bifidobacterium, Gardnerella, Metascardovia, Parascardovia, Scardovia * Род incertae sedis Turicella Порядок Coriobacteriales * Семейство Coriobacteriaceae ' Роды Adlercreutzia, Asaccharobacter, Atopobium, Collinsella, Coriobacterium, Cryptobacterium, Denitrobacterium, Eggerthella, Olsenella, Slackia Порядок Rubrobacterales * Семейство Conexibacteraceae ' Род Conexibacter * Семейство Patulibacteraceae ' Род Patulibacter * Семейство Rubrobacteraceae ' Род Rubrobacter * Семейство Solirubrobacteraceae ' Род Solirubrobacter * Семейство Thermoleophilaceae ' Род Thermoleophilum Порядок Sphaerobacterales * Семейство Sphaerobacteraceae ' Род Sphaerobacter