Acidobacteria
Acidobacteria (лат.) — тип бактерий. Представители типа широко распространены и имеют разнообразный метаболизм, особенно много их обнаруживается в почве. Однако лишь немногих представителей удалось культивировать[1][2][3].
Первый представитель типа, Acidobacterium capsulatum, был описан в 1991 году[4]. Однако в самостоятельным тип Acidobacteria были выделены лишь в 2012 году[5].
Общие сведения
| Acidobacteria | |
|---|---|
| Научная классификация | |
|
Домен: Тип: Acidobacteria |
|
| Международное научное название | |
| Acidobacteria Thrash and Coates 2012 |
Описание
Acidobacteria физиологически разнообразны и могут встречаться в самых разнообразных местообитаниях: почве (в том числе почвах, загрязнённых металлами), горячих источниках, океанах, пещерах[6]. Многие представители Acidobacteria — ацидофилы, в том числе и первый описанный вид, Acidobacterium capsulatum[7]. Недавно описанные виды типа Acidobacteria: Holophaga foetida[8], Geothrix fermentans[9], Acanthopleuribacter pedis[10] и Bryobacter aggregatus[11] — чрезвычайно многочисленны в почвах, поэтому могут играть важную роль во многих экосистемах[12]. Однако большинство представителей Acidobacteria практически не поддаются культивированию, поэтому их физиология и экология изучены плохо[2]. ДНК двух неклассифицированных бактерий типа Acidobacteria были обнаружены в наборах для выделения ДНК, что могло исказить метагеномные данные и данные о составе микробиоты[13].
Филогения
На следующем филогенетическом дереве представлена филогения Acidobacteria согласно List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[14][15]. Филогенетическое дерево было построено на основе последовательностей 16S рРНК, предоставленных проектом The All-Species Living Tree Project[16].
| Acidobacteria |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Примечания:
♠ Штаммы, указанные в Национальный центр биотехнологической информации, но отсутствующие в LSPN.