Verrucomicrobia
Verrucomicrobia (лат., от лат. verruca — бугорок) — тип бактерий, к которому относятся в основном некультивируемые формы. Как указывают метагеномные данные, в природе они распространены исключительно широко. Они составляют от 1 до 10 % почвенной микробиоты и потому имеют важное экологическое значение[2].
Что важно знать
| Verrucomicrobia | |
|---|---|
| Научная классификация | |
|
Домен: Тип: Verrucomicrobia |
|
| Международное научное название | |
| Verrucomicrobia Hedlund 1997[1] |
Описание
Представители Verrucomicrobia — грамотрицательные бактерии, у многих из которых на поверхности имеются простеки (бугорки), за что тип и получил своё название. Клетки — палочковидные, овоидные, одиночные или в парах, веретеновидные. У Prosthecobacter на одном из конце клетки имеется уникальное бульбовидное утолщение. По типу питания Verrucomicrobia — хемоорганогетеротрофы и сбраживают разнообразные сахара[3]. Некоторые представители способны окислять метан при экстремально низких значениях рН[4][5].
Среди Verrucomicrobia есть анаэробы, факультативные анаэробы и аэробы; лучше всего представители филы растут при температуре 25 °C и pH от 4 до 7. Помимо почв, встречаются в пресноводных водоёмах, пелагиали и желудочно-кишечном тракте человека[3].
Систематика
По данным филогенетического анализа, ближайшими родственниками Verrumicrobia являются представители типа Chlamydiae[6]. В 2008 году был секвенирован и опубликован геном одного из представителей типа, Methylacidiphilum infernorum. Его анализ указал на возможное родство Verrumicrobia и протеобактерий[7].
Ниже представлено филогенетическое дерево Verrumicrobia, построенное по последовательностям 16S рРНК в рамках проекта The All-Species Living Tree.
| Verrumicrobia |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
На декабрь 2017 года в тип включают следующие таксоны до рода включительно[8]:
- Класс "Spartobacteria"
- Роды incertae sedis
- Род Terrimicrobium
- Роды incertae sedis
- Класс Opitutae Choo et al. 2007
- Порядок Opitutales Choo et al. 2007
- Семейство Opitutaceae Choo et al. 2007
- Роды Alterococcus, Opitutus
- Семейство Opitutaceae Choo et al. 2007
- Порядок Puniceicoccales Choo et al. 2007
- Семейство Puniceicoccaceae Choo et al. 2007
- Порядок Opitutales Choo et al. 2007
- Класс Verrucomicrobiae Hedlund et al. 1998 emend. Yoon et al. 2008
- Порядок Verrucomicrobiales Ward-Rainey et al. 1996 emend. Yoon et al. 2008
- Семейство Akkermansiaceae Hedlund and Derrien 2012
- Род Akkermansia
- Семейство Rubritaleaceae Hedlund 2012
- Род Rubritalea
- Семейство Verrucomicrobiaceae Ward-Rainey et al. 1996 emend. Takeda et al. 2008
- Роды incertae sedis
- Род Limisphaera
- Семейство Akkermansiaceae Hedlund and Derrien 2012
- Порядок Verrucomicrobiales Ward-Rainey et al. 1996 emend. Yoon et al. 2008
Примечания
Литература
- Пиневич А. В. Микробиология. Биология прокариотов: в 3 т. — СПб.: Издательство С.-Петербургского университета, 2006. — ISBN 5-288-04056-7.
