Гистондеацетилаза 1
Что важно знать
Функция
Осуществляет ацетилирование и деацетилирование гистонов, катализ мультисубъединичных комплексов, играет ключевую роль в регуляции в экспрессии эукариотических генов. Белок, кодируемый этим геном относится к семейству гистондезацетилаза/acuc/apha и является составной частью гистондезацетилазного комплекса. Он также взаимодействует с белком-супрессором опухоли ретинобластомы, и этот комплекс является ключевым элементом в управлении клеточной пролиферацией и дифференцировкой. Вместе с метастазосвязанным белком-2 MTA2, деацетилирует p53 и модулирует его действие на рост клеток и апоптоз.[6]
Модельные организмы
| Характеристики | Фенотип |
|---|---|
| Жизнеспособность гомозитов | Ненормальный |
| Recessive lethal study | ненормальный |
| Плодовитость | Норма |
| Вес тела | Норма |
| Тревога | Норма |
| Неврологическое обследование | Норма |
| Сила хватания | Норма |
| Hot plate | Норма |
| Dysmorphology | Норма |
| Indirect calorimetry | Норма |
| Глюкозотолерантный тест | Норма |
| Auditory brainstem response | Норма |
| DEXA | Норма |
| Рентгенография | Норма |
| Температура тела | Норма |
| Eye morphology | Норма |
| Клиническая химия | Норма |
| Гематология | Норма |
| Лимфоциты периферийной крови | Норма |
| Тест микроядер | Норма |
| Масса сердца | Норма |
| Гистопатология мозга | Норма |
| Гистопатология глаз | Норма |
| Сальмонелла | Normal[7] |
| Citrobacter infection | Normal[8] |
| Все тесты и анализы из[9][10] |
Модельные организмы были использованы при исследовании функции HDAC1. Условная линия нокаутных мышей, под названием Hdac1tm1a(EUCOMM)Wtsi[11][12] была создана в рамках международной программы консорциума Нокаутная мышь — проект мутагенеза высокой пропускной способности для создания и распространения животных моделей для изучения болезней заинтересованными учёными — в институте Сенгера.[13][14][15] Мужские и женские особи прошли стандартное фенотипическое обследование для определения последствий удаления.[9][16] Двадцать пять испытаний были проведены и два фенотипа оказались с отклонениями. Сокращение числа гомозиготных мутантов были определены у эмбрионов во время беременности, и никто не дожил до конца лактации. Остальные испытания проводились на гетерозиготных мутантах взрослых мышей, и не было обнаружено каких-либо существенных отклонений у этих животных.[9]
Взаимодействия
HDAC 1,как было выявлено, взаимодействует с:
- Андрогенный рецептор,[17]
- BCL6,[18][19]
- BTG2,[20]
- BUB1B,[21]
- BUB1,[21]
- BUB3,[21]
- CBFA2T3,[22][23]
- CDC20,[21]
- CDH1,[21]
- CHD3,[24][25]
- CHD4,[26][24][27]
- COUP-TFII,[28]
- CTBP1,[29][30][31]
- DDX17,[32]
- DDX5,[32]
- DNMT3A,[33]
- DNMT3L,[34][35]
- Death-associated protein 6,[36]
- EED,[37]
- EVI1,[38][39]
- EZH2,[37]
- FKBP3,[40]
- GATA1,[41]
- HMG20B,[42]
- HSPA4,[43]
- HUS1,[44]
- Гистондеацетилаза 2,[26][45][42][46][47][43][48][49][50][24][51][52][37]
- TGIF1,[29][53]
- HCFC1,[54]
- IFRD1,[55]
- IKZF1,[56][57]
- ING1,[25][58]
- MBD3,[50][59][60]
- MIER1,[61]
- MLL,[62]
- MTA1,[26][63]
- MTA2,[26][50][64][65]
- Mad1,[21]
- Mdm2,[66]
- MBD2,[50][67][68]
- SMAD2,[69]
- MyoD,[70][71]
- NFKB1,[72]
- NCOR2,[45][73]
- PCNA,[74]
- PHF21A,[42][75]
- Прохибитин,[76][77]
- Белок промиелоцитарного лейкоза,[78][79]
- RAD9A,[44]
- RBBP4,[26][50][51][52][80][27][64][81][67][82][83]
- RBBP7,[26][50][52][67]
- RCOR1,[42][64]
- RELA,[49][84][72]
- RFC1,[85]
- Белок ретинобластомы,[77][70][86][87][88][89][90]
- RBL1,[86][87]
- RBL2,[86][91]
- SAP30,[50][25][92][93][94][95]
- SATB1,[65]
- SIN3A,[26][50][24][51][80][96][97][27][98][64][81][65][99][25]
- SIN3B,[56][50]
- SPEN,[100]
- SUDS3,[96][101]
- SUV39H1,[102]
- Sp1,[81][103][104][105]
- TOP2A,[106][107]
- TOP2B,[106][107] and
- Цинковый палец и BTB домен, содержащий белок 16.[108][18][109]
Примечания
Литература
- Wolffe A.P. Histone deacetylase: a regulator of transcription (англ.) // Science. — 1996. — Vol. 272, no. 5260. — P. 371—372. — doi:10.1126/science.272.5260.371. — PMID 8602525.
- Ahringer J. NuRD and SIN3 histone deacetylase complexes in development (англ.) // Trends (journals) : journal. — 2000. — Vol. 16, no. 8. — P. 351—356. — doi:10.1016/S0168-9525(00)02066-7. — PMID 10904264.
- Verdin E., Dequiedt F., Kasler H.G. Class II histone deacetylases: versatile regulators (англ.) // Trends (journals) : journal. — 2003. — Vol. 19, no. 5. — P. 286—293. — doi:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. — PMID 12711221.
- Zhang Y., Dufau M.L. Dual mechanisms of regulation of transcription of luteinizing hormone receptor gene by nuclear orphan receptors and histone deacetylase complexes (англ.) // The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology : journal. — 2003. — Vol. 85, no. 2—5. — P. 401—414. — doi:10.1016/S0960-0760(03)00230-9. — PMID 12943729.
- Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
- Hijmans E.M., Voorhoeve P.M., Beijersbergen R.L., van 't Veer LJ, Bernards R. E2F-5, a new E2F family member that interacts with p130 in vivo (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1995. — Vol. 15, no. 6. — P. 3082—3089. — PMID 7760804. — PMC 230539.
- Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene (журнал) : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
- Margolis D.M., Somasundaran M., Green M.R. Human transcription factor YY1 represses human immunodeficiency virus type 1 transcription and virion production (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1994. — Vol. 68, no. 2. — P. 905—910. — PMID 8289393. — PMC 236527.
- Furukawa Y., Kawakami T., Sudo K., Inazawa J., Matsumine A., Akiyama T., Nakamura Y. Isolation and mapping of a human gene (RPD3L1) that is homologous to RPD3, a transcription factor in Saccharomyces cerevisiae (англ.) // Cytogenetic and Genome Research : journal. — Karger Publishers, 1996. — Vol. 73, no. 1—2. — P. 130—133. — doi:10.1159/000134323. — PMID 8646880.
- Hassig C.A., Fleischer T.C., Billin A.N., Schreiber S.L., Ayer D.E. Histone deacetylase activity is required for full transcriptional repression by mSin3A (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 341—347. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80214-7. — PMID 9150133.
- Laherty C.D., Yang W.M., Sun J.M., Davie J.R., Seto E., Eisenman R.N. Histone deacetylases associated with the mSin3 corepressor mediate mad transcriptional repression (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 349—356. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80215-9. — PMID 9150134.
- Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 357—364. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80216-0. — PMID 9150135.
- Romerio F., Gabriel M.N., Margolis D.M. Repression of human immunodeficiency virus type 1 through the novel cooperation of human factors YY1 and LSF (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1997. — Vol. 71, no. 12. — P. 9375—9382. — PMID 9371597. — PMC 230241.
- Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene (журнал) : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
- Brehm A., Miska E.A., McCance D.J., Reid J.L., Bannister A.J., Kouzarides T. Retinoblastoma protein recruits histone deacetylase to repress transcription (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 391, no. 6667. — P. 597—601. — doi:10.1038/35404. — PMID 9468139.
- Magnaghi-Jaulin L., Groisman R., Naguibneva I., Robin P., Lorain S., Le Villain J.P., Troalen F., Trouche D., Harel-Bellan A. Retinoblastoma protein represses transcription by recruiting a histone deacetylase (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 391, no. 6667. — P. 601—605. — doi:10.1038/35410. — PMID 9468140.
- Lin R.J., Nagy L., Inoue S., Shao W., Miller W.H., Evans R.M. Role of the histone deacetylase complex in acute promyelocytic leukaemia (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 391, no. 6669. — P. 811—814. — doi:10.1038/35895. — PMID 9486654.
- Luo R.X., Postigo A.A., Dean D.C. Rb interacts with histone deacetylase to repress transcription (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 92, no. 4. — P. 463—473. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80940-X. — PMID 9491888.
| Регуляция транскрипции |
| ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Активация | |||||||||||||
| Инициация | |||||||||||||
| Элонгация |
| ||||||||||||
| Терминация | |||||||||||||
