HCFC1

Хостфактор клеток C1
Хостфактор клеток C1
Доступные структуры
PDB
	Список идентификаторов PDB 4GO6, 4N39, 4N3A, 4N3B, 4N3C
Идентификаторы
Символ
Внешние ID
Функция	• chromatin binding; • sequence-specific DNA binding transcription factor activity; • transcription coactivator activity; • protein binding; • identical protein binding; • histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific); • histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific); • histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific);
Компонент клетки	• histone acetyltransferase complex; • nucleus; • nucleoplasm; • Ada2/Gcn5/Ada3 transcription activator complex; • nucleolus; • cytoplasm; • mitochondrion; • membrane; • neuronal cell body; • Set1C/COMPASS complex; • SAGA-type complex; • MLL5-L complex; • MLL1 complex;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • chromatin organization; • regulation of transcription, DNA-templated; • transcription from RNA polymerase II promoter; • cell cycle; • positive regulation of gene expression; • release from viral latency; • regulation of protein complex assembly; • histone H4-K5 acetylation; • histone H4-K8 acetylation; • histone H4-K16 acetylation; • positive regulation of cell cycle; • protein stabilization;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Хостфактор клеток C1
Хостфактор клеток C1
Доступные структуры
PDB
	Список идентификаторов PDB 4GO6, 4N39, 4N3A, 4N3B, 4N3C
Идентификаторы
Символ
Внешние ID
Функция	• chromatin binding; • sequence-specific DNA binding transcription factor activity; • transcription coactivator activity; • protein binding; • identical protein binding; • histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific); • histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific); • histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific);
Компонент клетки	• histone acetyltransferase complex; • nucleus; • nucleoplasm; • Ada2/Gcn5/Ada3 transcription activator complex; • nucleolus; • cytoplasm; • mitochondrion; • membrane; • neuronal cell body; • Set1C/COMPASS complex; • SAGA-type complex; • MLL5-L complex; • MLL1 complex;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • chromatin organization; • regulation of transcription, DNA-templated; • transcription from RNA polymerase II promoter; • cell cycle; • positive regulation of gene expression; • release from viral latency; • regulation of protein complex assembly; • histone H4-K5 acetylation; • histone H4-K8 acetylation; • histone H4-K16 acetylation; • positive regulation of cell cycle; • protein stabilization;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Хостфактор клеток 1 (HCFC1, HCF1 или HCF-1), также известный как VP16-вспомогательный белок^[1] — белок, который у человека кодируется геном HCFC1 ^[2]^[3].

HCF1 является членом высококонсервативного семейства хостфакторов клеток и кодирует белок с пятью Kelch-повторами, фибронектино-подобным мотивом, и шестью HCF-повторами, каждый из которых имеет весьма специфичный сигнал расщепления. Это ядерный транскрипционный корегулятор протеолитически расщеплённый на один или более из шести возможных сайтов, в результате чего создаётся N-концевая цепь и соответствующая С-концевая цепь. Окончательная форма этого белка состоит из нековалентно связанных N- и С-концевых цепей, которые взаимодействуют с помощью электростатических сил.

HCF1 участвует в управлении клеточным циклом, а также имеет регуляторную роль во множестве процессов, связанных с транскрипцией. Кроме того, работы с модельными организмами указывают на HCF1, как на фактор, предположительно определяющий долголетие^[4]. Существуют варианты сплайсинга, кодирующие разные изоформы белка, однако, не все варианты были полностью охарактеризованы^[3].

Мутации в этом гене были связаны с нарушениями метаболизма кобаламина. ( https://dx.doi.org/10.1016/j.ajhg.2013.07.022 )

Хостфактор клеток C1, как было выявлено, взаимодействует с:

Oehler T., Angel P. A common intermediary factor (p52/54) recognizing "acidic blob"-type domains is required for transcriptional activation by the Jun proteins (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1992. — Vol. 12, no. 12. — P. 5508—5515. — PMID 1448082. — PMC 360488.
Wilson A.C., Peterson M.G., Herr W. The HCF repeat is an unusual proteolytic cleavage signal (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1995. — Vol. 9, no. 20. — P. 2445—2458. — doi:10.1101/gad.9.20.2445. — PMID 7590226.
Klemm R.D., Goodrich J.A., Zhou S., Tjian R. Molecular cloning and expression of the 32-kDa subunit of human TFIID reveals interactions with VP16 and TFIIB that mediate transcriptional activation (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 13. — P. 5788—5792. — doi:10.1073/pnas.92.13.5788. — PMID 7597030. — PMC 41586.
Frattini A., Faranda S., Redolfi E., et al. Genomic organization of the human VP16 accessory protein, a housekeeping gene (HCFC1) mapping to Xq28 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1995. — Vol. 23, no. 1. — P. 30—5. — doi:10.1006/geno.1994.1455. — PMID 7829097.
Kristie T.M., Pomerantz J.L., Twomey T.C., et al. The cellular C1 factor of the herpes simplex virus enhancer complex is a family of polypeptides (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — Vol. 270, no. 9. — P. 4387—4394. — doi:10.1074/jbc.270.9.4387. — PMID 7876203.
Kristie T.M., Sharp P.A. Purification of the cellular C1 factor required for the stable recognition of the October–1 homeodomain by the herpes simplex virus alpha-trans-induction factor (VP16) (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1993. — Vol. 268, no. 9. — P. 6525—6534. — PMID 8454622.
Zoppè M., Frattini A., Faranda S., Vezzoni P. The complete sequence of the host cell factor 1 (HCFC1) gene and its promoter: a role for YY1 transcription factor in the regulation of its expression (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1996. — Vol. 34, no. 1. — P. 85—91. — doi:10.1006/geno.1996.0244. — PMID 8661027.
Wilson A.C., Freiman R.N., Goto H., et al. VP16 targets an amino-terminal domain of HCF involved in cell cycle progression (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — Vol. 17, no. 10. — P. 6139—6146. — PMID 9315674. — PMC 232464.
Freiman R.N., Herr W. Viral mimicry: common mode of association with HCF by VP16 and the cellular protein LZIP (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1998. — Vol. 11, no. 23. — P. 3122—3127. — doi:10.1101/gad.11.23.3122. — PMID 9389645. — PMC 316754.
Lu R., Yang P., Padmakumar S., Misra V. The herpesvirus transactivator VP16 mimics a human basic domain leucine zipper protein, luman, in its interaction with HCF (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1998. — Vol. 72, no. 8. — P. 6291—6297. — PMID 9658067. — PMC 109766.
Ge H., Si Y., Roeder R.G. Isolation of cDNAs encoding novel transcription coactivators p52 and p75 reveals an alternate regulatory mechanism of transcriptional activation (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1999. — Vol. 17, no. 22. — P. 6723—6729. — doi:10.1093/emboj/17.22.6723. — PMID 9822615. — PMC 1171017.
La Boissière S., Hughes T., O'Hare P. HCF-dependent nuclear import of VP16 (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 2. — P. 480—489. — doi:10.1093/emboj/18.2.480. — PMID 9889203. — PMC 1171141.
Lu R., Misra V. Potential role for luman, the cellular homologue of herpes simplex virus VP16 (alpha gene trans-inducing factor), in herpesvirus latency (англ.) // Journal of Virology : journal. — 2000. — Vol. 74, no. 2. — P. 934—943. — doi:10.1128/JVI.74.2.934-943.2000. — PMID 10623756. — PMC 111614.
Mahajan S.S., Wilson A.C. Mutations in host cell factor 1 separate its role in cell proliferation from recruitment of VP16 and LZIP (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 3. — P. 919—928. — doi:10.1128/MCB.20.3.919-928.2000. — PMID 10629049. — PMC 85209.
Ajuh P.M., Browne G.J., Hawkes N.A., et al. Association of a protein phosphatase 1 activity with the human factor C1 (HCF) complex (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2000. — Vol. 28, no. 3. — P. 678—686. — doi:10.1093/nar/28.3.678. — PMID 10637318. — PMC 102561.
Vogel J.L., Kristie T.M. The novel coactivator C1 (HCF) coordinates multiprotein enhancer formation and mediates transcription activation by GABP (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 4. — P. 683—690. — doi:10.1093/emboj/19.4.683. — PMID 10675337. — PMC 305606.
Scarr R.B., Smith M.R., Beddall M., Sharp P.A. A novel 50-kilodalton fragment of host cell factor 1 (C1) in G(0) cells (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 10. — P. 3568—3575. — doi:10.1128/MCB.20.10.3568-3575.2000. — PMID 10779346. — PMC 85649.
Choi Y., Asada S., Uesugi M. Divergent hTAFII31-binding motifs hidden in activation domains (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 21. — P. 15912—15916. — doi:10.1074/jbc.275.21.15912. — PMID 10821850.
Lu R., Misra V. Zhangfei: a second cellular protein interacts with herpes simplex virus accessory factor HCF in a manner similar to Luman and VP16 (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2000. — Vol. 28, no. 12. — P. 2446—2454. — doi:10.1093/nar/28.12.2446. — PMID 10871379. — PMC 102720.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

HCFC1

Структура

Функция

Взаимодействия

Примечания

Литература