АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
2219276 статей на русском языкеО РУВИКИ

PHF21A

Пальцевидный белок PHD 21A  — белок, кодируемый у человека геном PHF21A .[1][2][3]

Общие сведения
Пальцевидный белок PHD 21A
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2PUY, 2YQL

Идентификаторы
Символ PHF21A ; BHC80
Внешние ID OMIM: 608325 HomoloGene: 9597 GeneCards: Ген PHF21A
Генная онтология
Функция • DNA binding

• chromatin binding

• zinc ion binding
Компонент клетки • histone deacetylase complex
• nucleoplasm
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• suckling behavior
• transcription, DNA-templated
• regulation of transcription, DNA-templated
• blood coagulation

• chromatin modification
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
PBB GE PHF21A 203278 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 51317 192285
Ensembl ENSG00000135365 ENSMUSG00000058318
UniProt Q96BD5 Q6ZPK0
RefSeq (мРНК) NM_001101802 NM_001109690
RefSeq (белок) NP_001095272 NP_001103160
Локус (UCSC) Chr 11:
45.95 – 46.14 Mb		 Chr 2:
92.09 – 92.36 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Функция

PHF21A является составной частью BRAF35 (MIM 605535)/гистондеацетилазы (HDAC, см MIM 601241) комплекса (BHC), являясь посредником репрессии нейроноспецифических генов посредством цис-регуляторных элементов, известный как репрессорный элемент 1 (RE1) или нейронный ограничительный сайленсер (NRS) (Hakimi и др., 2002).[3]

Взаимодействия

Примечания

  1. ↑ Nagase T., Kikuno R., Hattori A., Kondo Y., Okumura K., Ohara O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Research : journal. — 2000. — February (vol. 7, no. 6). — P. 347—355. — doi:10.1093/dnares/7.6.347. — PMID 11214970.
  2. ↑ 1 2 3 4 5 Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — May (vol. 99, no. 11). — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298. — PMC 124246.
  3. ↑ 1 2 Entrez Gene: PHF21A PHD finger protein 21A. Архивировано 5 декабря 2010 года.
  4. ↑ 1 2 3 4 Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2004. — September (vol. 322, no. 2). — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.
  5. ↑ Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — February (vol. 278, no. 9). — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.

Литература

  • Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 9. — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
  • Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2004. — Vol. 322, no. 2. — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.
  • Shi Y.J., Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Regulation of LSD1 histone demethylase activity by its associated factors (англ.) // Molecular Cell : journal. — 2005. — Vol. 19, no. 6. — P. 857—864. — doi:10.1016/j.molcel.2005.08.027. — PMID 16140033.
  • Rual J.F., Venkatesan K., Hao T., Hirozane-Kishikawa T., Dricot A., Li N., Berriz G.F., Gibbons F.D., Dreze M., Ayivi-Guedehoussou N., Klitgord N., Simon C., Boxem M., Milstein S., Rosenberg J., Goldberg D.S., Zhang L.V., Wong S.L., Franklin G., Li S., Albala J.S., Lim J., Fraughton C., Llamosas E., Cevik S., Bex C., Lamesch P., Sikorski R.S., Vandenhaute J., Zoghbi H.Y., Smolyar A., Bosak S., Sequerra R., Doucette-Stamm L., Cusick M.E., Hill D.E., Roth F.P., Vidal M. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
  • Hailesellasse Sene K., Porter C.J., Palidwor G., Perez-Iratxeta C., Muro E.M., Campbell P.A., Rudnicki M.A., Andrade-Navarro M.A. Gene function in early mouse embryonic stem cell differentiation (англ.) // BMC Genomics : journal. — 2007. — Vol. 8. — P. 85. — doi:10.1186/1471-2164-8-85. — PMID 17394647. — PMC 1851713.

Категории