CHD3
CHD3 (от англ. Chromodomain-Helicase-DNA-binding protein 3) — фермент, кодируемый у человека геном CHD3.[1][2][3]
Этот ген кодирует члена CHD семейства белков, которые характеризуются наличием хромодоменов (организация модификатора хроматина) и SNF2-связанных хеликазных/АТФазных доменов. Этот белок является одним из компонентов комплекса гистондеацетилаз, называемого Mi-2/NuRD комплексом, который участвует в ремоделировании хроматина при деацетилировании гистонов. Ремоделирование хроматина имеет важное значение для многих процессов, включая транскрипцию. Аутоантитела против этого белка содержатся в подгруппе пациентов с дерматомиозитом. Существуют три альтернативных варианта транскриптов сплайсинга, кодирующих различные изоформы.[3]
Что важно знать
Взаимодействия
Примечания
Литература
- Bowen N.J., Fujita N., Kajita M., Wade P.A. Mi-2/NuRD: multiple complexes for many purposes (англ.) // Biochimica et Biophysica Acta : journal. — 2004. — Vol. 1677, no. 1—3. — P. 52—7. — doi:10.1016/j.bbaexp.2003.10.010. — PMID 15020045.
- Gieser L., Swaroop A. Expressed sequence tags and chromosomal localization of cDNA clones from a subtracted retinal pigment epithelium library (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1992. — Vol. 13, no. 3. — P. 873—876. — doi:10.1016/0888-7543(92)90173-P. — PMID 1639417.
- Seelig H.P., Moosbrugger I., Ehrfeld H., et al. The major dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen is a presumed helicase involved in transcriptional activation (англ.) // Arthritis & Rheumatology : journal. — 1995. — Vol. 38, no. 10. — P. 1389—1399. — doi:10.1002/art.1780381006. — PMID 7575689.
- Seelig H.P., Renz M., Targoff I.N., et al. Two forms of the major antigenic protein of the dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen (англ.) // Arthritis & Rheumatology : journal. — 1996. — Vol. 39, no. 10. — P. 1769—1771. — doi:10.1002/art.1780391029. — PMID 8843877.
- Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Research : journal. — 1997. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
- Aubry F., Mattéi M.G., Galibert F. Identification of a human 17p-located cDNA encoding a protein of the Snf2-like helicase family (англ.) // The FEBS Journal : journal. — 1998. — Vol. 254, no. 3. — P. 558—564. — doi:10.1046/j.1432-1327.1998.2540558.x. — PMID 9688266.
- Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., et al. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395, no. 6705. — P. 917—921. — doi:10.1038/27699. — PMID 9804427.
- Kleiderlein J.J., Nisson P.E., Jessee J., et al. CCG repeats in cDNAs from human brain (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 103, no. 6. — P. 666—673. — doi:10.1007/s004390050889. — PMID 9921901.
- Kim J., Sif S., Jones B., et al. Ikaros DNA-binding proteins direct formation of chromatin remodeling complexes in lymphocytes (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 1999. — Vol. 10, no. 3. — P. 345—355. — doi:10.1016/S1074-7613(00)80034-5. — PMID 10204490.
- Wade P.A., Gegonne A., Jones P.L., et al. Mi-2 complex couples DNA methylation to chromatin remodelling and histone deacetylation (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 1. — P. 62—6. — doi:10.1038/12664. — PMID 10471500.
- Cousin P., Billotte J., Chaubert P., Shaw P. Physical map of 17p13 and the genes adjacent to p53 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — Vol. 63, no. 1. — P. 60—8. — doi:10.1006/geno.1999.6062. — PMID 10662545.
- Minty A., Dumont X., Kaghad M., Caput D. Covalent modification of p73alpha by SUMO-1. Two-hybrid screening with p73 identifies novel SUMO-1-interacting proteins and a SUMO-1 interaction motif (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 46. — P. 36316—36323. — doi:10.1074/jbc.M004293200. — PMID 10961991.
- Schultz D.C., Friedman J.R., Rauscher F.J. Targeting histone deacetylase complexes via KRAB-zinc finger proteins: the PHD and bromodomains of KAP-1 form a cooperative unit that recruits a novel isoform of the Mi-2α subunit of NuRD (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2001. — Vol. 15, no. 4. — P. 428—443. — doi:10.1101/gad.869501. — PMID 11230151. — PMC 312636.
- Yasui D., Miyano M., Cai S., et al. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances (англ.) // Nature : journal. — 2002. — Vol. 419, no. 6907. — P. 641—645. — doi:10.1038/nature01084. — PMID 12374985.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3 (англ.) // FEBS Letters : journal. — 2003. — Vol. 533, no. 1—3. — P. 14—20. — doi:10.1016/S0014-5793(02)03737-7. — PMID 12505151.
- Fujita N., Jaye D.L., Kajita M., et al. MTA3, a Mi-2/NuRD complex subunit, regulates an invasive growth pathway in breast cancer (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2003. — Vol. 113, no. 2. — P. 207—219. — doi:10.1016/S0092-8674(03)00234-4. — PMID 12705869.
- Lee B.H., Yoshimatsu K., Maeda A., et al. Association of the nucleocapsid protein of the Seoul and Hantaan hantaviruses with small ubiquitin-like modifier-1-related molecules (англ.) // Virus Res. : journal. — 2004. — Vol. 98, no. 1. — P. 83—91. — doi:10.1016/j.virusres.2003.09.001. — PMID 14609633.