SAP30
Белок, ассоциированный с Sin3A, 30 кДа, известный также как SAP30, — белок, кодируемый у человека геном SAP30[1].
Общие сведения
Белок, ассоциированный с Sin3A, 30kDa Доступные структуры Список идентификаторов PDB Идентификаторы
Профиль экспрессии РНК Ортологи Вид
Человек
Мышь
| ||||||||
Функция
Ацетилирование гистонов играет ключевую роль в регуляции экспрессии эукариотических генов. Ацетилирование и деацетилирование гистонов катализируют мультисубъединичные комплексы. Белок, кодируемый этим геном — составляющая комплекса гистондеацетилазы, который включает в себя SIN3A, SAP18, HDAC1, HDAC2, RbAp46, RbAp48 и другие полипептиды. Этот комплекс принимает активное участие в деацетилировании основных гистонов октамеров, но бездействует при деацетилировании нуклеосомных гистонов. Псевдоген этого гена находится на хромосоме 3[1].
Млекопитающие имеют один паралог SAP30, названный SAP30-подобным (SAP30L), доступные последовательности которого на 70 % идентичны с SAP30[2]. SAP30 и SAP30L вместе составляют хорошо сохранившееся семейство белков SAP30. SAP30L также взаимодействует с несколькими компонентами корепрессора комплекса Sin3A и вызывает репрессию транскрипции с помощью рекрутирования Sin3A и гистондеацетилаз[3].
Белки семейства SAP30 имеют функциональную ядерную локализацию сигнала и они могут передавать сигнал Sin3A к ядру[3]. Белки SAP30 имеют независимый контакт последовательностей с ДНК, их N-терминальнвй цинкозависимой модуль и их кислый центральный регион вносит свой вклад в взаимодействия гистонов и нуклеосом. ДНК-связывание белков SAP30 регулируется ядерной сигнализацией липидов, фосфоинозитидов (PI)[4]. Белки SAP30 предоставляют первый пример, в котором ДНК и PI, кажется, стоят во взаимно антагонистических взаимоотношениях в части их взаимодействия с белками цинкового пальца и, таким образом, иллюстрируют молекулярный механизм, как эти липиды могут способствовать регуляции генов[4][5].
Взаимодействия
Примечания
Литература
- Ayer D.E., Lawrence Q.A., Eisenman R.N. Mad-Max transcriptional repression is mediated by ternary complex formation with mammalian homologs of yeast repressor Sin3. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1995. — Vol. 80, no. 5. — P. 767—776. — doi:10.1016/0092-8674(95)90355-0. — PMID 7889570.
- Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., et al. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 357—364. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80216-0. — PMID 9150135.
- Zhang Y., Sun Z.W., Iratni R., et al. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex. (англ.) // Molecular Cell : journal. — 1998. — Vol. 1, no. 7. — P. 1021—1031. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. — PMID 9651585.
- Laherty C.D., Billin A.N., Lavinsky R.M., et al. SAP30, a component of the mSin3 corepressor complex involved in N-CoR-mediated repression by specific transcription factors. (англ.) // Molecular Cell : journal. — 1998. — Vol. 2, no. 1. — P. 33—42. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80111-2. — PMID 9702189.
- Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.P., et al. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 95, no. 2. — P. 279—289. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. — PMID 9790534.
- Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., et al. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395, no. 6705. — P. 917—921. — doi:10.1038/27699. — PMID 9804427.
- Hsieh J.J., Zhou S., Chen L., et al. CIR, a corepressor linking the DNA binding factor CBF1 to the histone deacetylase complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 1. — P. 23—8. — doi:10.1073/pnas.96.1.23. — PMID 9874765. — PMC 15086.
- Boutell J.M., Thomas P., Neal J.W., et al. Aberrant interactions of transcriptional repressor proteins with the Huntington's disease gene product, huntingtin. (англ.) // Human Molecular Genetics : journal. — Oxford University Press, 2000. — Vol. 8, no. 9. — P. 1647—1655. — doi:10.1093/hmg/8.9.1647. — PMID 10441327.
- Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., et al. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation. (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
- Krithivas A., Young D.B., Liao G., et al. Human herpesvirus 8 LANA interacts with proteins of the mSin3 corepressor complex and negatively regulates Epstein-Barr virus gene expression in dually infected PEL cells. (англ.) // Journal of Virology : journal. — 2000. — Vol. 74, no. 20. — P. 9637—9645. — doi:10.1128/JVI.74.20.9637-9645.2000. — PMID 11000236. — PMC 112396.
- Underhill C., Qutob M.S., Yee S.P., Torchia J. A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 275, no. 51. — P. 40463—40470. — doi:10.1074/jbc.M007864200. — PMID 11013263.
- Humphrey G.W., Wang Y., Russanova V.R., et al. Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 9. — P. 6817—6824. — doi:10.1074/jbc.M007372200. — PMID 11102443.
- Skowyra D., Zeremski M., Neznanov N., et al. Differential association of products of alternative transcripts of the candidate tumor suppressor ING1 with the mSin3/HDAC1 transcriptional corepressor complex. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 12. — P. 8734—8739. — doi:10.1074/jbc.M007664200. — PMID 11118440.
- Yochum G.S., Ayer D.E. Pf1, a novel PHD zinc finger protein that links the TLE corepressor to the mSin3A-histone deacetylase complex. (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 13. — P. 4110—4118. — doi:10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001. — PMID 11390640. — PMC 87072.
- Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., et al. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1). (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 3. — P. 835—848. — doi:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. — PMID 11784859. — PMC 133546.
- Saito M., Ishikawa F. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 38. — P. 35434—35439. — doi:10.1074/jbc.M203455200. — PMID 12124384.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., et al. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. (англ.) // Genes & Development : journal. — 2003. — Vol. 17, no. 7. — P. 896—911. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868. — PMC 196026.
- Huang N.E., Lin C.H., Lin Y.S., Yu W.C. Modulation of YY1 activity by SAP30. (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2003. — Vol. 306, no. 1. — P. 267—275. — doi:10.1016/S0006-291X(03)00966-5. — PMID 12788099.
- Sironi E., Cerri A., Tomasini D., et al. Loss of heterozygosity on chromosome 4q32-35 in sporadic basal cell carcinomas: evidence for the involvement of p33ING2/ING1L and SAP30 genes. (англ.) // J. Cutan. Pathol. : journal. — 2004. — Vol. 31, no. 4. — P. 318—322. — doi:10.1111/j.0303-6987.2004.0187.x. — PMID 15005689.

