Гистондеацетилаза 2
Гистондеацетилаза 2 — фермент из семейства деацетилаз гистонов, кодируемый у человека геном HDAC2 .[5]
Что важно знать
Функция
Продукт гена HDAC2 относится к семейству деацетилаз гистонов. Гистондеацетилазы работают в составе крупных мультибелковых комплексов и отвечают за деацетилирование остатков лизина на N-концевой области кóровых гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Этот белок также формирует комплексы транскрипционных репрессоров, связываясь с различными белками, в том числе YY1, одним из фактором транскрипции млекопитающих. Гистондеацетилаза 2 играет важную роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и в развитии.[6]
Взаимодействия
Гистондезацетилаза 2 взаимодействует с:
- ATR,[7]
- BUB3,[8]
- CDC20,[8]
- CDH1,[8]
- CHD3,[9][10][11]
- CHD4,[9][10][7]
- DNMT1,[12]
- EED,[13]
- EZH2[13]
- FKBP3,[14]
- GATA4,[15]
- GTF2I,[9][16]
- HDAC10,[17]
- HDAC1,[9][10][18][19][13][17][20][21][22][23][24][25][26]
- HMG20B,[9][19]
- HSPA4,[20]
- HCF1,[27]
- MTA1,[9][18][28]
- MTA2,[9][18][24]
- MXD1,[29][30]
- Mad1,[8]
- MBD2,[24][31][32]
- PHF21A,[9][19][33]
- PPP1R8,[34]
- RBBP4,[9][10][35][36]
- RCOR1,[19][37]
- RELA,[38][39]
- Белок ретинобластомы,[40]
- SAP30,[24][41][42]
- SIN3A,[9][10][35][36][29][43][44]
- SMARCA5,[11]
- SNW1,[45]
- SUV39H1,[46]
- Sp1,[36][47][48]
- Sp3,[47][48]
- TOP2B,[49]
- YY1.[50][51][52]
Примечания
Литература
- Ahringer J. NuRD and SIN3 histone deacetylase complexes in development (англ.) // Trends (journals) : journal. — 2000. — Vol. 16, no. 8. — P. 351—356. — doi:10.1016/S0168-9525(00)02066-7. — PMID 10904264.
- Verdin E., Dequiedt F., Kasler H.G. Class II histone deacetylases: versatile regulators (англ.) // Trends (journals) : journal. — 2003. — Vol. 19, no. 5. — P. 286—293. — doi:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. — PMID 12711221.
- Zhang Y., Dufau M.L. Dual mechanisms of regulation of transcription of luteinizing hormone receptor gene by nuclear orphan receptors and histone deacetylase complexes (англ.) // The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology : journal. — 2003. — Vol. 85, no. 2—5. — P. 401—414. — doi:10.1016/S0960-0760(03)00230-9. — PMID 12943729.
- Furukawa Y., Kawakami T., Sudo K., Inazawa J., Matsumine A., Akiyama T., Nakamura Y. Isolation and mapping of a human gene (RPD3L1) that is homologous to RPD3, a transcription factor in Saccharomyces cerevisiae (англ.) // Cytogenetic and Genome Research : journal. — 1996. — Vol. 73, no. 1—2. — P. 130—133. — doi:10.1159/000134323. — PMID 8646880.
- Yang W.M., Inouye C., Zeng Y., Bearss D., Seto E. Transcriptional repression by YY1 is mediated by interaction with a mammalian homolog of the yeast global regulator RPD3 (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 23. — P. 12845—12850. — doi:10.1073/pnas.93.23.12845. — PMID 8917507. — PMC 24008.
- Laherty C.D., Yang W.M., Sun J.M., Davie J.R., Seto E., Eisenman R.N. Histone deacetylases associated with the mSin3 corepressor mediate mad transcriptional repression (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 349—356. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80215-9. — PMID 9150134.
- Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 357—364. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80216-0. — PMID 9150135.
- Yang W.M., Yao Y.L., Sun J.M., Davie J.R., Seto E. Isolation and characterization of cDNAs corresponding to an additional member of the human histone deacetylase gene family (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 44. — P. 28001—28007. — doi:10.1074/jbc.272.44.28001. — PMID 9346952.
- Hassig C.A., Tong J.K., Fleischer T.C., Owa T., Grable P.G., Ayer D.E., Schreiber S.L. A role for histone deacetylase activity in HDAC1-mediated transcriptional repression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — Vol. 95, no. 7. — P. 3519—3524. — doi:10.1073/pnas.95.7.3519. — PMID 9520398. — PMC 19868.
- Randhawa G.S., Bell D.W., Testa J.R., Feinberg A.P. Identification and mapping of human histone acetylation modifier gene homologues (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 51, no. 2. — P. 262—269. — doi:10.1006/geno.1998.5370. — PMID 9722949.
- Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.P., Lane W.S., Reinberg D. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 95, no. 2. — P. 279—289. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. — PMID 9790534.
- Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395, no. 6705. — P. 917—921. — doi:10.1038/27699. — PMID 9804427.
- Hsieh J.J., Zhou S., Chen L., Young D.B., Hayward S.D. CIR, a corepressor linking the DNA binding factor CBF1 to the histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 1. — P. 23—8. — doi:10.1073/pnas.96.1.23. — PMID 9874765. — PMC 15086.
- Yarden R.I., Brody L.C. BRCA1 interacts with components of the histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 9. — P. 4983—4988. — doi:10.1073/pnas.96.9.4983. — PMID 10220405. — PMC 21803.
- Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histone deacetylase complexes (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 11. — P. 3090—3100. — doi:10.1093/emboj/18.11.3090. — PMID 10357820. — PMC 1171390.
- Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
- Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 1. — P. 58—61. — doi:10.1038/12659. — PMID 10471499.
- Wade P.A., Gegonne A., Jones P.L., Ballestar E., Aubry F., Wolffe A.P. Mi-2 complex couples DNA methylation to chromatin remodelling and histone deacetylation (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 1. — P. 62—6. — doi:10.1038/12664. — PMID 10471500.
- Lai A., Lee J.M., Yang W.M., DeCaprio J.A., Kaelin W.G., Seto E., Branton P.E. RBP1 Recruits Both Histone Deacetylase-Dependent and -Independent Repression Activities to Retinoblastoma Family Proteins (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 10. — P. 6632—6641. — PMID 10490602. — PMC 84642.
