АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
О РУВИКИ

SIN3B

SIN3B (англ. Paired amphipathic helix protein Sin3a — белок парной амфипатической спирали Sin3b) — белок, кодируемый у человека геном SIN3B [1][2].

Что важно знать
Член B семейства регуляторов транскрипции SIN3
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1e91, 1pd7, 2cr7, 2czy, 2f05

Идентификаторы
Символ SIN3B ; KIAA0700
Внешние ID OMIM: 607777 MGI: 107158 HomoloGene: 81810 GeneCards: Ген SIN3B
Генная онтология
Функция • chromatin binding

• transcription corepressor activity

• protein binding
Компонент клетки • X chromosome

• Y chromosome
• XY body
• nucleus
• nucleoplasm
• cytoplasm

• autosome
Биологический процесс • transcription, DNA-templated

• skeletal muscle tissue development
• cellular lipid metabolic process
• small molecule metabolic process
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• rhythmic process

• cardiac muscle tissue development
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
PBB GE SIN3B 209352 s at tn.png
PBB GE SIN3B 39705 at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 23309 20467
Ensembl ENSG00000127511 ENSMUSG00000031622
UniProt O75182 Q62141
RefSeq (мРНК) NM_001297595 NM_001113248
RefSeq (белок) NP_001284524 NP_001106719
Локус (UCSC) Chr 19:
16.94 – 16.99 Mb		 Chr 8:
72.72 – 72.76 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Взаимодействия с другими белками

Примечания

Литература

  • Ayer D.E., Lawrence Q.A., Eisenman R.N. Mad-Max transcriptional repression is mediated by ternary complex formation with mammalian homologs of yeast repressor Sin3 (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1995. — Vol. 80, no. 5. — P. 767—776. — doi:10.1016/0092-8674(95)90355-0. — PMID 7889570.
  • David G., Alland L., Hong S.H., et al. Histone deacetylase associated with mSin3A mediates repression by the acute promyelocytic leukemia-associated PLZF protein (англ.) // Oncogene (журнал) : journal. — 1998. — Vol. 16, no. 19. — P. 2549—2556. — doi:10.1038/sj.onc.1202043. — PMID 9627120.
  • Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histone deacetylase complexes (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 11. — P. 3090—3100. — doi:10.1093/emboj/18.11.3090. — PMID 10357820. — PMC 1171390.
  • Naruse Y., Aoki T., Kojima T., Mori N. Neural restrictive silencer factor recruits mSin3 and histone deacetylase complex to repress neuron-specific target genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2000. — Vol. 96, no. 24. — P. 13691—13696. — doi:10.1073/pnas.96.24.13691. — PMID 10570134. — PMC 24126.
  • Spronk C.A., Tessari M., Kaan A.M., et al. The Mad1-Sin3B interaction involves a novel helical fold (англ.) // Nat. Struct. Biol. : journal. — 2001. — Vol. 7, no. 12. — P. 1100—1104. — doi:10.1038/81944. — PMID 11101889.
  • Spronk C.A., Jansen J.F., Tessari M., et al. Sequence-specific assignment of the PAH2 domain of Sin3B free and bound to Mad1 (англ.) // Journal of Biomolecular NMR : journal. — 2001. — Vol. 19, no. 4. — P. 377—378. — doi:10.1023/A:1011262214741. — PMID 11370785.
  • Alland L., David G., Shen-Li H., et al. Identification of Mammalian Sds3 as an Integral Component of the Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 8. — P. 2743—2750. — doi:10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002. — PMID 11909966. — PMC 133736.
  • Rayman J.B., Takahashi Y., Indjeian V.B., et al. E2F mediates cell cycle-dependent transcriptional repression in vivo by recruitment of an HDAC1/mSin3B corepressor complex (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2002. — Vol. 16, no. 8. — P. 933—947. — doi:10.1101/gad.969202. — PMID 11959842. — PMC 152357.
  • Koipally J., Georgopoulos K. A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 31. — P. 27697—27705. — doi:10.1074/jbc.M201694200. — PMID 12015313.
  • Yang L., Mei Q., Zielinska-Kwiatkowska A., et al. An ERG (ets-related gene)-associated histone methyltransferase interacts with histone deacetylases 1/2 and transcription co-repressors mSin3A/B (англ.) // Biochemical Journal : journal. — 2003. — Vol. 369, no. Pt 3. — P. 651—657. — doi:10.1042/BJ20020854. — PMID 12398767. — PMC 1223118.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Petrie K., Guidez F., Howell L., et al. The histone deacetylase 9 gene encodes multiple protein isoforms (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 18. — P. 16059—16072. — doi:10.1074/jbc.M212935200. — PMID 12590135.
  • Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., et al. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1 (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2003. — Vol. 17, no. 7. — P. 896—911. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868. — PMC 196026.
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Dugast-Darzacq C., Pirity M., Blanck J.K., et al. Mxi1-SRalpha: a novel Mxi1 isoform with enhanced transcriptional repression potential (англ.) // Oncogene (журнал) : journal. — 2004. — Vol. 23, no. 55. — P. 8887—8899. — doi:10.1038/sj.onc.1208107. — PMID 15467743.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Rampalli S., Pavithra L., Bhatt A., et al. Tumor Suppressor SMAR1 Mediates Cyclin D1 Repression by Recruitment of the SIN3/Histone Deacetylase 1 Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2005. — Vol. 25, no. 19. — P. 8415—8429. — doi:10.1128/MCB.25.19.8415-8429.2005. — PMID 16166625. — PMC 1265755.
  • Xu Y., Sengupta P.K., Seto E., Smith B.D. RFX family proteins differentially interact with HDACs to repress collagen alpha 2(I) gene (COL1A2) expression (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2006. — Vol. 281, no. 14. — P. 9260—9270. — doi:10.1074/jbc.M511724200. — PMID 16464847. — PMC 1434794.