Первый рассказ «Спасибо» опубликовал в 1962 году в газете «Красноярский комсомолец». В том же году за участие в самиздатовском журнале в Красноярске был исключён из комсомола. Как высказывался спустя многие годы сам Попов: «С 16 лет я сочиняю художественные произведения, которые сначала шли по разряду „идейно-ущербных, близких к клеветническим“, однако к настоящему времени их уж издали в количестве 20 книг, переведённых на различные языки народов мира»[2].
После окончания Московского геологоразведочного института им. С. Орджоникидзе (1968), работая геологом на северо-восточных «просторах нашей Родины чудесной», он создал множество рассказов, где в качестве скромных героев эпохи выступали сибирские бичи, пьяницы, проститутки, чиновники, интеллектуалы, графоманы и коммунисты.
Первая серьёзная публикация в журнале «Новый мир» (1976) с предисловием Василия Шукшина принесла ему всесоюзную славу. Принятый в Союз писателей в 1978 году, Попов через семь месяцев и тринадцать дней был из Союза исключён за создание (вместе с Василием Аксёновым, Андреем Битовым, Виктором Ерофеевым и Фазилем Искандером) неподцензурного альманаха «Метрополь», вышедшего на Западе и ставшего причиной последнего крупного литературного скандала «брежневской эпохи». В 1980 году преследовался КГБ как один из авторов и редакторов альманаха современной литературы «Каталог», опубликованного в США. В 1988 году восстановлен в Союзе писателей. В мае 1980 вошёл в «Клуб беллетристов».
Рассказы Попова радуют многообразием, что относится как к выбору судеб и персонажей, так и к манере, в которой соседствуют трезвый реализм, трагическая ирония и расширение повествовательной перспективы через сказ[3].
Является секретарём Союза писателей Москвы, одним из основателей и вице-президентом Русского ПЕН-центра, ассоциированным членом Шведского ПЕН-центра[2]. Отмечен премиями журналов «Волга» (1989), «Стрелец» (1995), «Знамя» (1998), «Октябрь» (2002), премией Союза писателей Москвы «Венец» (2003), памятным знаком венгерского Министерства культуры «Pro cultura Hungaria» (2005).
В 2011 году Евгений Попов в соавторстве с Александром Кабаковым издал книгу воспоминаний «Аксёнов». Автор труда «Социализм и судьба России».
Отмечал, что знал Катаева, Паустовского, Михалкова, Алексея и Георгия Марковых, Алена Роб-Грийе, Умберто Эко, Петера Эстерхази, Шукшина, Высоцкого, Окуджаву; и что дружил с Аксеновым, Ахмадулиной, Вознесенским, Искандером[1].
Ныне пенсионер; инвалид III группы. Ветеран труда[1].
1 марта 2022 года подписал «Обращение писателей России по поводу специальной операции нашей армии в Донбассе и на территории Украины», опубликованное в «Литературной газете»[4].
4 сентября 2023 года указом президента России награждён орденом Дружбы[5].
↑Лексикон русской литературы XX века = Lexikon der russischen Literatur ab 1917 / В. Казак ; [пер. с нем.]. — М. : РИК «Культура», 1996. — XVIII, 491, [1] с. — 5000 экз. — ISBN 5-8334-0019-8.
↑Кто хочет жертв? (неопр.) Литературная газета (1 марта 2022). Дата обращения: 6 сентября 2023.