Родился Джованни Доменико де Купис в 1493 году, в Риме, Папская область. Происходил из прославленной семьи из Монтефалько, сын Бернардино де Куписа и Лукреции Норманни. Его имя также упоминается как Джандоменико, а его фамилия Куппи[4].
Джованни Доменико де Купис изучал право (никакой дополнительной образовательной информации не найдено)[4].
Где, когда и кем был рукоположен в священники информация была не найдена[4].
Епископ Нардо с 15 января 1532 года, подал в отставку от управления епархией 22 мая 1536 года. Администратор диоцеза Монтепелосо с 13 ноября 1532 года по 11 апреля 1537 года[4].
16 декабря 1532 года избран кардиналом-епископом Сабины[4].
Администратор диоцеза Камерино с 5 июля 1535 года по 5 марта 1537 года. Папский легат в Агро-Пичено с 1 сентября 1536 года. 28 ноября 1537 года избран кардиналом-епископом Остии и Веллетри. Декан Священной Коллегии Кардиналов с 28 ноября 1537 года. Папский легат в Марке с 1537 года. Губернатор Тиволи с 1537 года[4].
7 января 1538 года кардинал Де Купис назначен вместе с другими восемью кардиналами членом комиссии по торжествам Вселенского собора. 10 февраля 1540 года ему было поручено, вместе с тремя другими кардиналами дело, чтобы собрать средства для войны против турок. 27 августа 1540 года кардинал Де Купис был назначен, вместе с ещё одиннадцатью кардиналами, членом комиссии по реформе Римской курии и ее должностных лиц. 2 ноября 1544 года назначен, вместе с другими десятью кардиналами, членами Вселенского собора[4].
Протектор Шотландии с 5 марта 1550 года. Папский легат a latere в Болонье с 9 сентября 1551 года. Президент наблюдательной комиссии Анноны с декабря 1551 года. Протектор Франции[4].
Кардинал Де Купис поддерживал тесную дружбу с Игнатием Лойолой, будущим святым, несмотря на своё плохое мнение о нём вначале, после двухчасового разговора с Лойолой он изменил свое первоначальное мнение и попросил прощения. Из-за своей религиозности и доброты по отношению к другим, его современники дали ему титул ottimo tra i mortali (лучший среди смертных)[4].
Скончался кардинал Джованни Доменико де Купис 10 декабря 1553 года, в Риме. Похоронен в церкви Сант-Агостино, в Риме, где был похоронен в 1507 году его отец. Позднее его останки были перенесены в Монтефалько и похоронены в усыпальнице его семьи[4].