В апреле 2022 года Басманный суд Москвы арестовал Кара-Мурзу по обвинению в распространении клеветы о российской армии. В своём выступлении в нижней палате законодательного собрания американского штата Аризона публицист безосновательно обвинил российскую армию в использовании запрещённых средств и методов ведения войны на Украине[6].
17 апреля 2023 года приговорён к 25 годам лишения свободы за государственную измену[⇨]. 14 мая 2024 года Верховный суд России оставил приговор без изменений[7].
В журналистике с 16 лет. В 1997—2000 годах — собственный корреспондент газеты «Новые Известия», в 2000—2004 годах — собственный корреспондент, обозреватель издательского дома «Коммерсантъ». В 2002 году был главным редактором делового журнала «Russian Investment Review».
На выборах 7 декабря 2003 года — единый кандидат в депутаты Государственной думы от партий СПС и «Яблоко» в Чертановском избирательном округе № 204 Москвы. Во время кампании команда кандидата партии «Единая Россия» Владимира Груздева предпринимала попытки снять Кара-Мурзу с выборов. Согласно официальным результатам выборов Груздев получил 149 069 голосов (53,78 %), Кара-Мурза — 23 800 голосов (8,59 %), кандидат КПРФ Сергей Серёгин — 18 992 голоса (6,85 %)[10].
В январе 2004 года Кара-Мурза стал соучредителем Комитета-2008: свободный выбор. В мае 2007 года Кара-Мурза выступил инициатором выдвижения писателя и правозащитника Владимира Буковского кандидатом в президенты РФ от демократической оппозиции на выборах 2008 года. Автор «Обращения Инициативной группы», в котором, в частности, говорилось: «Оппозиции нужен свой кандидат в Президенты. Сильный, бескомпромиссный, решительный. С безупречным политическим и — что важнее — нравственным авторитетом. Известный и уважаемый в обществе. Не связанный ни с какими партиями и группами. Способный предложить стране честную программу демократических, правовых и социальных реформ. Нам нужен кандидат, которого смогут поддержать все демократические избиратели России. Такой кандидат есть. Его имя — Владимир Константинович Буковский».
С мая по декабрь 2007 года — координатор Инициативной группы по выдвижению Буковского, в состав которой входили академик РАН Юрий Рыжов, писатель Виктор Шендерович, публицист Андрей Пионтковский, адвокат Юрий Шмидт, правозащитник Александр Подрабинек, политолог Владимир Прибыловский и другие общественные деятели. В октябре 2007 года — один из организаторов «Митинга свободных людей» в поддержку кандидатуры Буковского на Триумфальной площади в Москве. На собрании группы избирателей в поддержку выдвижения Владимира Буковского кандидатом на пост президента РФ 16 декабря 2007 года, в котором приняли 823 человека (при необходимых 500), избран уполномоченным представителем группы в Центральной избирательной комиссии РФ. 22 декабря ЦИК РФ отказал Буковскому в регистрации.
На съезде СПС 17 декабря 2007 года Кара-Мурза был избран в состав Федерального политического совета. 29 сентября 2008 года написал заявление о выходе из партии в знак протеста против её вхождения в кремлёвский проект «Правое дело»[11]. На учредительном съезде Объединённого демократического движения «Солидарность» 13 декабря 2008 года избран членом Федерального политического совета. По итогам голосования занял 2-е место из 77 кандидатов, уступив только Борису Немцову[12].
В 2011 году в Москве и Санкт-Петербурге была представлена книга Владимира Кара-Мурзы (младшего) «Реформы или революция: к истории попытки образовать ответственное министерство в I Государственной Думе»[13]. Книга рассказывает о попытке победившей на выборах в I Думу Конституционно-демократической партии (партии кадетов) добиться формирования правительства парламентского большинства весной-летом 1906 года. Издателем книги выступила Российская объединённая демократическая партия «Яблоко».
С февраля по май 2011 года Кара-Мурза от имени российской оппозиции вёл в Конгрессе США переговоры «о расширении категорий лиц, подпадающих под действие визовых санкций» в рамках законопроекта «Об ответственности и верховенстве закона» имени Сергея Магнитского, предусматривающего запрет на въезд в США и замораживание финансовых активов в США для российских чиновников, ответственных за «грубые нарушения прав человека»[14]. Добился внесения в окончательный текст законопроекта ссылок на нарушения прав на свободу «самовыражения, союзов и собраний, а также права на справедливый суд и демократические выборы». Выступал в поддержку законопроекта на слушаниях в Конгрессе США и Европейском парламенте. В рамках продвижения «Закона Магнитского» проводил встречи с членами Конгресса США вместе с Борисом Немцовым, Михаилом Касьяновым и Гарри Каспаровым.
Весной 2012 года контроль над RTVi перешёл от Владимира Гусинского к бывшему руководителю государственного медиахолдинга «Звезда» Руслану Соколову[16]. Новое руководство телеканала уволило Кара-Мурзу с 1 сентября, однако уже 12 июля его журналистская аккредитация была аннулирована распоряжением посла России в США Сергея Кисляка. Пресс-секретарь посольства Евгений Хоришко объяснил это решение тем, что Кара-Мурза больше «не является журналистом».
В августе 2013 года Кара-Мурза был зарегистрирован кандидатом в депутаты Ярославской областной думы в составе списка РПР-ПАРНАС, возглавляемого Борисом Немцовым, однако позже был снят с выборов на основании наличия двойного гражданства, которое он указал при подаче документов[17][18]. Немцов пообещал, что снятие Кара-Мурзы будет оспорено в Европейском суде по правам человека[18]. В декабре 2013 года Кара-Мурза подал в ЕСПЧ жалобу на нарушение его права на участие в выборах. Жалоба была коммуницирована Европейским судом в мае 2017 года, в удовлетворении жалобы отказано[19].
26 мая 2015 года Кара-Мурза вместе с коллегой по партии ПАРНАС пообедал в одном из ресторанов в центре Москвы, а затем, в здании МИА «Россия сегодня», встретился с двумя другими коллегами. В ходе беседы с ними Кара-Мурзе внезапно стало плохо. Сначала у него ускорилось сердцебиение, затем началась рвота. Когда приехала скорая помощь, он уже практически не мог двигаться. Врачи сначала подумали, что у него случился инфаркт, но позднее поставили диагноз «острая почечная недостаточность на фоне интоксикации». Кара-Мурзу сначала госпитализировали в городскую клиническую больницы им. Давыдовского, а вечером того же дня перевезли в кардиологическую клинику им. Бакулева, где начали готовить к операции. Затем было решено отправить пациента в 1-ю городскую больницу имени Пирогова[20]. 27 мая Владимир был госпитализирован в Первую Градскую больницу[21]. 5 июля пациента вывезли на самолёте в США[22]. В США в течение шести месяцев Кара-Мурза проходил курс реабилитации. После возвращения в Россию некоторое время ходил с палочкой.
В декабре 2015 года Кара-Мурза подал заявление в Следственный комитет РФ, в котором попросил возбудить уголовное дело по ст. 30 и 105 УК РФ (покушение на убийство), однако следствие не нашло оснований для этого[23].
В июле 2015 года Кара-Мурза был избран заместителем председателя Партии народной свободы. Перед парламентскими выборами 2016 года выступал резко против включения в список кандидатов от партии националиста Вячеслава Мальцева[24]. На съезде Партии народной свободы в декабре 2016 года внёс проект резолюции с осуждением решения о включении Мальцева в список и участия в предвыборной кампании партии «лиц, придерживающихся националистических и антисемитских взглядов»; после отклонения проекта большинством съезда Кара-Мурза сложил полномочия заместителя председателя партии и покинул её ряды[25].
С мая 2016 года — председатель совета Фонда Бориса Немцова за свободу[26].
2 февраля 2017 года Кара-Мурза был госпитализирован в критическом состоянии в Городскую клиническую больницу имени С. С. Юдина (бывшая городская больница № 7) в Коломенском проезде в Москве с такими же симптомами отравления, что и в 2015 году[27]. 13 февраля Кара-Мурзу перевели из реанимации в терапевтическое отделение[28]. 19 февраля его выписали из больницы, после чего он прошёл курс реабилитации за границей[29]. Пробы крови Кара-Мурзы, а также образцы волос и ногтей были отправлены во Францию, США и Израиль для токсикологического анализа. Осенью 2018 года стало известно, что ФБР отказалось опубликовать результаты проведённых лабораторных анализов.
В апреле 2018 года Следственный комитет РФ возобновил проверку по факту отравлений Владимира Кара-Мурзы. Его адвокат Вадим Прохоров связал пробуждение интереса СК к этому делу с отравлением Скрипалей.
В июле 2019 года Кара-Мурза занял должность вице-президента фонда «Свободная Россия», объявленного в Российской Федерации нежелательным[4].
17 апреля 2023 года Московский городской суд приговорил Владимира Кара-Мурзу к 25 годам лишения свободы по обвинению в государственной измене, в распространении клеветы о российской армии и в сотрудничестве с нежелательной организацией[31]. 14 мая 2024 года Верховный суд России оставил приговор без изменений[7].
С сентября 2023 года отбывал наказание в колонии строгого режима (ИК-6) в Омской области[32].
Правнук латвийского революционера Вольдемара Бисениекса (1884—1938), двоюродный правнук латвийского политика и дипломата, первого посла Латвии в Великобритании Георга Бисениекса (1885—1941) и латвийского агронома и общественного деятеля Яниса Бисениекса (1864—1923).