В 1799 году в мадридском магазине духов и ликеров можно было приобрести серию из восьмидесяти эстампов гравюр под названием «Капричос», представляющую собой собрание сатирических и демонических офортов Гойи. Гойя писал, что в основе этой серии лежат «бесчисленные слабости и глупости, встречающиеся в каждом цивилизованном обществе, а также общие предрассудки и неразумные действия, которые привычка, глупость или корысть сделали обычными». Он добавляет, что любое сходство офортов с реальными событиями является чисто случайным^[8].

Следует отметить, что одновременно в эти годы Гойя создавал легкие и воздушные картины, такие как фреска купола в Королевской капелле Святого Антония Флоридского в Мадриде^[11].

Наибольшую известность среди ценителей искусства художника приобрели две картины с изображением одной и той же женщины. Это «Маха обнажённая» и «Маха одетая». Это отнюдь не традиционные образы Венеры, которые до этого рисовал Гойя. Вместо экзальтации на первый план выходит чувственность.На обоих картинах изображена женщина на кровати. Сначала Гойя написал картину «Маха обнажённая», а через несколько лет — «Маха одетая», причем неизвестно, почему Гойя рисовал именно в этой последовательности^[12].

Существует множество предположений относительно личности женщины. Возможно, моделью была герцогиня Альба, с которой, по слухам, у Гойи был роман, а возможно, это Пепита Тудо, любовница премьер-министра Мануэля Годоя, в коллекции которого находились картины. Исследователям пока не удалось точно установить личность этой женщины^[11].

После так называемого восстания Дос де Майо в Мадриде против французской власти Наполеона I испанские повстанцы в нескольких местах города были казнены . В частности, французы казнили группу из 43 повстанцев на горе Принсипе-Пио. Чтобы почтить память жертв трагедии и увековечить «героические события и сцены нашего славного восстания против европейского тирана», Гойя в 1814 году создал картины «Восстание 2 мая 1808 года в Мадриде» и «Третье мая 1808 года в Мадриде»^[13].

Картины были заказаны испанским правительством через либерального кардинала Луиса Марию де Бурбон-и-Вальябрига, который был представителем правительства до возвращения Фердинанда VII. Именно Гойя сам предложил кардиналу и правительству эти заказы. Вероятно, художник предложил эти картины, чтобы улучшить свои отношения с Фердинандом VII, возвращавшимся на испанский престол.

Картина «Третье мая 1808 года в Мадриде» оказала влияние на многих художников, изображавших подобные события, например, на картины Эдуарда Мане «Расстрел императора Максимилиана» (1867 год) и Пабло Пикассо «Резня в Корее» (1951 год).

Восстание в Мадриде в 1808 года стало началом кровопролитной войны за независимость Испании, продолжавшейся до 1814 года. Гойя был свидетелем многих варварских «сцен», происходивших в эти годы, которые он запечатлел в серии гравюр «Ужасы войны». Офорты были выполнены в 1810—1815 годах и наглядно демонстрируют отвращение Гойи к жестокости войны^[13].

Подобные офорты были сделаны почти за 200 лет до этого, во время Тридцатилетней войны: «Большие Бедствия Войны» в 1633 году французом Жаком Калло. Гойя, вероятно, изучал несколько гравюр Калло^[13].

На первых 47 из 84 офортов Гойи изображены события войны и их неумолимое воздействие на небольшие группы и отдельных людей. Номера с 48 по 64 в серии изображают сцены голода в Мадриде во время осады города французами. Заключительная часть серии была выполнена Гойей после возвращения Фердинанда VII на престол в 1813 году, эти офорты являются критическими комментариями к политической ситуации в Испании^[13].

Серия гравюр была впервые опубликована в 1863 году, через тридцать пять лет после смерти Гойи, под названием «Fatales consequencias de la sangrienta guerra en España con Buonaparte, Y otros caprichos enfáticos» («Фатальные последствия кровавой войны Испании с Бонапартом и другие выразительные причуды»). Историки предполагают, что Гойя намеревался опубликовать офорты при жизни, но вскоре счел это политически невозможным^[14].

«Чёрные картины» — это собрание картин, написанных Гойей в последние годы его жизни, в 1819—1823 годы маслом непосредственно на стенах его двухэтажного дома «Кинта дель Сордо» (Дом глухого) под Мадридом. Он купил этот дом в 1819 году и переехал туда в возрасте 72 лет со своей невестой Леокадией Вайс и её (их) дочерью. Эти напряженные, призрачные картины свидетельствуют как о его страхе перед безумием, так и о разочаровании в человечестве^[13].

После наполеоновских войн и политических потрясений в Испании Гойя потерял веру в человечество. Он столкнулся с паникой, ужасом, страхом и истерией. Он пережил смертельные болезни и все больше опасался заболеть снова. Считается, что именно эти факторы привели к созданию 14 картин Гойи, известных под названием «Черные картины». Гойя никогда не собирался показывать их публике, это были картины, о которых он никогда не говорил и не писал. В 1879 году, через пятьдесят лет после смерти Гойи, картины были перенесены со стен на холст. Сегодня они выставлены в музее Прадо в Мадриде^[13].

• 1958 — «Обнажённая Маха» (The Naked Maja), производство США — Италия — Франция. Режиссёр Генри Костер; в роли Гойи — Энтони Франчоза.
• 1971 — «Гойя, или Тяжкий путь познания», производство СССР — ГДР — Болгария — Югославия. По одноимённому роману Лиона Фейхтвангера. Режиссёр Конрад Вольф; в роли Гойи — Донатас Банионис.
• 1985 — «Гойя» (Goya), производство Испания. Режиссёр Хосе Рамон Ларрас; в роли Гойи — Энрик Махо и Хорхе Санс.
• 1999 — «Гойя в Бордо» (Goya en Burdeos), производство Италия — Испания. Режиссёр Карлос Саура; в роли Гойи — Франсиско Рабаль.
• 1999 — «Обнажённая Маха» (Volaverunt), производство Франция — Испания. Режиссёр Бигас Луна; в роли Гойи — Хорхе Перугоррия.
• 2006 — «Призраки Гойи», производство Испания — США. Режиссёр Милош Форман; в роли Гойи — Стеллан Скарсгард.
• 2015 — Мордекай (Mortdecai) — о краже картины Гойи.

• В честь Ф. Гойи назван астероид (6592) Goya, открытый астрономом Людмилой Карачкиной в Крымской Астрофизической Обсерватории 3 октября 1986 г.
• В память о художнике в Испании в 1930 году была выпущена скандальная серия «Маха обнажённая» — первые в мире почтовые марки в жанре ню.
• В честь Гойи назван кратер на Меркурии.