Yarrowia lipolytica

Ярро́вия липоли́тика (лат. Yarrowia lipolytica) — вид аскомицетовых дрожжевых грибов. Таксономическое положение вида является предметом дискуссий: согласно одним источникам, его относят к порядку Сахаромицетовые (Saccharomycetales)[7], согласно другим — к порядку Dipodascales[8]. Вид известен своей способностью утилизировать жиры и углеводороды, благодаря чему широко используется в биотехнологии для производства лимонной кислоты, липидов и других соединений[9]. Признан безопасным (статус GRAS) для использования в промышленности[9].

Общие сведения
Ярровия липолитика[1]
Научная классификация
Царство:
Подцарство:
Подотдел:
Saccharomycotina O.E.Erikss. & Winka, 1997
Класс:
Сахаромицеты (Saccharomycetes G.Winter, 1880)
Семейство:
Род:
Вид:
Ярровия липолитика[1]
Международное научное название
Yarrowia lipolytica (Wick., Kurtzman & Herman) Van der Walt & Arx, 1980[3]
Синонимы
  • Candida lipolytica
  • Endomycopsis lipolytica[4]
  • Saccharomycopsis lipolytica[5]
  • Mycotorula lipolytica[3]

Описание

Yarrowia lipolytica — диморфный гриб, способный существовать как в виде отдельных дрожжевых клеток, так и в форме нитевидного мицелия в зависимости от условий окружающей среды.

Колонии на питательных средах имеют цвет от белого до кремово-белого, маслянистую, пастообразную или сухую текстуру[10]. По форме они круглые, слегка приподнятые в центре, с ровными или волнистыми краями. Со временем поверхность может становиться морщинистой или складчатой[10].

В дрожжевой форме клетки имеют шаровидную, овальную или удлинённо-эллипсоидальную форму размером 4,6–6,0 × 4,5–12,5 мкм[10]. Размножение происходит путём почкования.

В определённых условиях, в частности при низкой концентрации кислорода, вид переходит в мицелиальную форму, образуя псевдомицелий (цепочки почкующихся клеток) и истинный мицелий (гифы)[11]. При культивировании по методу Дальмау на дрожжевом морфологическом агаре (YMA) на 7-е сутки под стеклом также образуются гифы и псевдогифы.

Гетероталличный вид. Аски с 1—4 спорами. Аскоспоры разнообразной формы — шаровидные, шляповидные, линзовидные, полушаровидные, неправильные, иногда шероховатые, появляются на 3—7-е сутки на YMA.

К сбраживанию сахаров не способна.

Экология

Yarrowia lipolytica — убиквитарный (вездесущий) вид, представители которого выделяются из разнообразных сред обитания. Чаще всего эти дрожжи встречаются в субстратах, богатых липидами и углеводородами[12]. Их обнаруживают в морской воде, почвах, загрязнённых нефтью, а также на пищевых продуктах с высоким содержанием жиров и белков, таких как сыры и колбасные изделия[13].

Вид обладает высокой экологической пластичностью и способен адаптироваться к экстремальным условиям, включая кислые и щелочные pH, высокую солёность и наличие тяжёлых металлов[14]. Благодаря своей метаболической гибкости Y. lipolytica играет важную роль в процессах биоремедиации, утилизируя промышленные отходы и загрязнители.

Y. lipolytica способна формировать симбиотические отношения с другими организмами. Её штаммы обнаруживают в пищеварительном тракте некоторых насекомых (например, жуков), а также в качестве микоризных грибов или эндофитов у растений. Недавние исследования показали, что вид может вступать во взаимодействие с азотфиксирующими бактериями, такими как Azotobacter vinelandii. В таких микробных сообществах дрожжи могут расти, используя аммоний, который бактерии производят путём фиксации атмосферного азота[15].

Значение

Ярровия липолитика — один из наиболее изученных «неконвенциональных» видов дрожжей, имеющий большое значение в биотехнологии.

Вид признан безопасным для использования в промышленности. Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) присвоило процессам с его использованием статус GRAS (общепризнанный как безопасный), а Европейское агентство по безопасности пищевых продуктов (EFSA) включило его в список микроорганизмов со статусом QPS (квалифицированная презумпция безопасности)[16]. Y. lipolytica относится к 1-му уровню биобезопасности (BSL-1), поскольку большинство штаммов не способны расти при температуре человеческого тела (выше 32 °C)[17]. Несмотря на это, в медицинской литературе описаны единичные случаи оппортунистических инфекций у пациентов с тяжёлым иммунодефицитом.

Благодаря своей способности усваивать широкий спектр субстратов, включая углеводороды (в частности, парафины) и жиры, Y. lipolytica широко используется для производства кормового белка, липидов, ферментов (липаз и протеаз) и органических кислот, в первую очередь лимонной кислоты. В контексте циркулярной экономики вид применяют для биоремедиации и валоризации (переработки в ценные продукты) промышленных и сельскохозяйственных отходов, таких как сырой глицерин (побочный продукт производства биодизеля), сточные воды маслобойных заводов и отработанные кулинарные масла[17][18].

С развитием синтетической биологии и методов генетического редактирования (например, CRISPR) Y. lipolytica используется как «клеточная фабрика» для синтеза высокоценных соединений. Инженерные штаммы способны производить полиненасыщенные жирные кислоты (в том числе ЭПК), каротиноиды (ликопин, бета-каротин), биополимеры (например, полилактид), а также ароматические вещества, такие как 2-фенилэтанол[19][20][21].

Таксономия

Вид был впервые описан в 1970 году Линфордом Д. Уикерхэмом, Клетом П. Курцманом и А. И. Херманом как Endomycopsis lipolytica. В 1980 году Йоханнес П. ван дер Вальт и Йозеф А. фон Аркс перенесли вид в род Yarrowia, установив современное валидное название Yarrowia lipolytica.

В 2024 году в микологическом сообществе обсуждалось предложение по изменению названия вида на Yarrowia cornealis в связи со сложными правилами номенклатурного приоритета[22]. Предложение было вынесено на рассмотрение XII Международного микологического конгресса[23], но в итоге было отклонено[24]. Таким образом, официальное название Yarrowia lipolytica было сохранено.

Синонимы

  • Azymoprocandida lipolytica (F.C.Harrison) E.K.Novák & Zsolt, 1961
  • Candida oleae Kreger-van Rij & Verona, 1949
  • Candida lipolytica (F.C.Harrison) Diddens & Lodder, 1942
  • Candida lipolytica var. thermotolerans Blagod. & Kock.-Krat., 1973
  • Candida paralipolytica K.Yamada & Y.Ota, 1963
  • Candida pseudolipolytica Blagod. & Kock.-Krat., 1973
  • Endomycopsis lipolytica Wick. et al., 1970
  • Monilia cornealis Nann., 1928
  • Mycotorula lipolytica F.C.Harrison, 1928
  • Proteomyces cornealis (Nann.) C.W.Dodge, 1935
  • Saccharomycopsis lipolytica (Wick. et al.) Yarrow, 1972

Примечания

  1. Штамм дрожжей yarrowia lipolytica для получения лимонной кислоты. Google Patents. Дата обращения: 30 июля 2024.
  2. МОРФОЛОГО-КУЛЬТУРАЛЬНЫЕ И ФИЗИОЛОГО-БИОХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА ДРОЖЖЕЙ РОДА YARROWIA, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ПРИРОДНЫХ И ТЕХНОГЕННЫХ СУБСТРАТОВ. journals.eco-vector.com. Дата обращения: 30 июля 2024.
  3. 1 2 Yarrowia lipolytica. NCBI Taxonomy Browser. National Center for Biotechnology Information. Дата обращения: 30 июля 2024.
  4. Yarrowia lipolytica. Index Fungorum. Дата обращения: 30 июля 2024.
  5. Yarrowia lipolytica: A Model Oleaginous Yeast for Understanding and Optimizing Lipogenesis. PMC. National Center for Biotechnology Information (19 декабря 2018). Дата обращения: 30 июля 2024.
  6. Candida lipolytica (F.C. Harrison) Diddens & Lodder. Integrated Taxonomic Information System. Дата обращения: 30 июля 2024.
  7. Yarrowia lipolytica. MDPI Encyclopedia. Дата обращения: 30 июля 2024.
  8. Yarrowia lipolytica. UniProt. Дата обращения: 30 июля 2024.
  9. 1 2 Yarrowia lipolytica as a chassis for the production of valuable compounds: A review of the literature and patent landscape. PubMed. National Center for Biotechnology Information (12 февраля 2021). Дата обращения: 30 июля 2024.
  10. 1 2 3 ШТАММ ДРОЖЖЕЙ YARROWIA LIPOLYTICA ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ЛИПИДОВ. Google Patents. Дата обращения: 30 июля 2024.
  11. Yarrowia lipolytica: a model organism for study of the dimorphic transition. PubMed. National Center for Biotechnology Information (8 февраля 2014). Дата обращения: 30 июля 2024.
  12. Yarrowia lipolytica: a model organism for biotechnology. PubMed. National Center for Biotechnology Information (3 марта 2009). Дата обращения: 30 июля 2024.
  13. Yarrowia lipolytica: how a yeast becomes a workhorse for biotechnology. Atlas of Science. Дата обращения: 30 июля 2024.
  14. Yarrowia lipolytica, an oleaginous yeast with biotechnological potential. academic.oup.com. Oxford University Press (23 февраля 2021). Дата обращения: 30 июля 2024.
  15. Identification of Yarrowia lipolytica as a Platform for Designed Consortia to Incorporate in situ N2 Fixation. PNNL. Pacific Northwest National Laboratory. Дата обращения: 30 июля 2024.
  16. Scientific Opinion on the update of the list of QPS-recommended microbiological agents. European Food Safety Authority (24 января 2024). Дата обращения: 30 июля 2024.
  17. 1 2 Yarrowia lipolytica: A Key Player in the Valorization of Olive Mill Wastewaters. MDPI (1 июня 2024). Дата обращения: 30 июля 2024.
  18. Valorization of agro-industrial wastes for microbial lipid production by Yarrowia lipolytica: A review. PubMed. National Center for Biotechnology Information (16 июня 2021). Дата обращения: 30 июля 2024.
  19. Development of CRISPR-based tools for metabolic engineering in Yarrowia lipolytica. eScholarship, University of California. Дата обращения: 30 июля 2024.
  20. Biotechnological production of 2-phenylethanol. PMC. National Center for Biotechnology Information (14 марта 2013). Дата обращения: 30 июля 2024.
  21. One-step assembly of a 15-gene cassette for high-level lycopene production in Yarrowia lipolytica. PubMed. National Center for Biotechnology Information (1 января 2025). Дата обращения: 30 июля 2024.
  22. Proposal to conserve the name Yarrowia lipolytica against Candida cornealis (Saccharomycetales, Dipodascaceae). Smithsonian Institution. Дата обращения: 30 июля 2024.
  23. Synopsis of proposals on fungal nomenclature. International Mycological Association. Дата обращения: 30 июля 2024.
  24. Report on the Nomenclature Session of the 12th International Mycological Congress (IMC12). PubMed. National Center for Biotechnology Information (ноябрь 2024). Дата обращения: 30 июля 2024.

Литература

  • The Yeasts: A Taxonomic Study / C. P. Kurtzman, J. W. Fell, T. Boekhout (eds.). — 5th edition. — 2011. — Vol. 1. — P. 928—929. — ISBN 978-0-123-84708-9.

Ссылки

Категории