Гистондеацетилаза 3
Гистондеацетилаза 3 (англ. Histone deacetylase 3) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC3 [5][6].
Общие сведения
Функция
Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и процессов развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном принадлежит семейству гистондезацетилаз/acuc/APHA. Он имеет функциональность гистондеацетилазы и подавляет транскрипцию, когда связан с промотором. Он может участвовать в регуляции транскрипции путём связывание с фактором транскрипции цинковый палец YY1 . Этот белок также может негативно регулировать функцию p53 и, таким образом, модулировать рост клеток и апоптоз. Этот ген рассматривается в качестве потенциального гена-супрессора опухоли[7].
Этот фермент участвует в координации синантропного бактериально-зависимого кишечного гомеостаза при экспрессии в эпителиальных клетках кишечника.
Альтернативные функции
Гистондезацетилазы могут регулировать с помощью эндогенных факторов, биологически активных компонентов, синтетических ингибиторов и бактериально полученных сигналов. Исследования на мышах с определённой делецтией HDAC3 в эпителиальных клетках кишечника (IEC) показали экспрессию гена дерегулированных IEC. В этих делециях мутантных мышей, наблюдались потеря клеток Панета, нарушение функции IEC и изменения в составе кишечных комменсальных бактерий. Тот факт что эти негативные эффекты не наблюдались у стерильных мышей, указывает на то, что эффекты делеции видны только в присутствии кишечной микробной колонизации. Но негативные последствия делеций HDAC3 происходят не из-за наличия изменённого микробиоценоза, потому что колонии нормальных стерильных мышей с изменённой микрофлорой не показали негативных эффектов, наблюдаемых у делеционных мутантов.
Хотя точный механизм и специфика сигналов не вполне понятны, ясно что HDAC3 взаимодействует с полученными сигналами синантропных бактерий кишечной микрофлоры. Эти взаимодействия ответственны за калибровки откликов эпителиальных клеток в плане необходимости установки нормальных отношений между хостовыми и синантропными клетками, а также для поддержания кишечного гомеостаза[8][9][10][11].
Модельные организмы
Модельные организмы были использованы при исследовании функций HDAC3. Условная линия нокаутных мышей, называемая Hdac3tm1a(EUCOMM)Wtsi [12][13] была создана в рамках программы международного Консорциума нокаутных мышей, проектом мутагенеза с высокой пропускной способностью генерирации и распространения животных моделей болезней заинтересованным ученым[14][15][16].
Мужские и женские особи проходили стандартизированный фенотипический скриннинг для определения последствий делеции[17][18].
Двадцать шесть тестов проводились на мутантных мышах и наблюдались два существенных нарушения[17]. Не было гомозиготных мутантных эмбрионов определено во время беременности, и в отдельных исследованиях ни доживали до конца лактации. Остальные тесты были проведены на гетерозиготных мутантных взрослых мышах; никаких существенных отклонений не наблюдались у этих животных[17].
Взаимодействия
HDAC3, как было выявлено, взаимодействует с:
- CBFA2T3[19][20],
- CCND1[21][22],
- GATA1[23],
- GATA2[24],
- GPS2[25],
- GTF2I[26][27],
- HDAC4[28][29][30][31],
- HDAC5[29][30][25][31],
- HDAC7[28],
- HDAC9[32][33],
- MAP3K7IP2[34],
- MAPK11[35],
- NCOR1[28][30][25][36][37][38][39],
- NCOR2[30][40][36][37][38][39][41],
- PPARD,
- PPARG[42][43],
- PML[44]
- RBBP4[45],
- RELA[46],
- RP[47][48],
- RUNX2[49],
- SUV39H1[50],
- TCP1[41],
- TBL1X[25][40],
- TR2[51][42][52],
- Убиквитин C[53],
- YY1[54][55], и
- ZBTB33[36].
См. также
Примечания
Литература
- Verdin E., Dequiedt F., Kasler H.G. Class II histone deacetylases: versatile regulators (англ.) // Trends (journals) : journal. — 2003. — Vol. 19, no. 5. — P. 286—293. — doi:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. — PMID 12711221.