Фосфолипаза А2 пчелиного яда во внеклеточном пространстве вблизи липидного бислоя.Полярные группы фосфолипидов находятся между жёлтой и красной плоскостями. Неполярные ацильные цепи — между красной и чёрной плоскостями.
Фосфолипазы А2 включают несколько не связанных белковых семейств с общей ферментативной активностью. Два наиболее важных семейства — это секретируемые и цитозольные фосфолипазы А2.
Экстраклеточные формы фосфолипаз А2 были выделены из различных ядовзмей, пчёл и ос. Они также находятся во всех тканях млекопитающих и в бактериях. Активность этих фосфолипаз требует наличия кальция.
Панкреатическая фосфолипаза А2 относится к ферментам пищеварения и участвует в переваривании липидов пищи. Фосфолипазы яда участвуют в обездвиживании жертвы за счёт лизиса её клеток.
Внутриклеточные фосфолипазы, также как и внеклеточные, относятся к кальций-зависимым ферментам. Структурно, однако, они сильно отличаются от секретируемых фосфолипаз. Как правило, они значительно крупнее (более 700 аминокислот) и содержат C2 домен, который направляет фермент к клеточной мембране.
Грам-отрицательные бактерии содержат на внешней мембране фосфолипазы А2 с широким спектром специфичности. В кишечной палочке (Escherichia coli) этот фермент участвует в выбросе токсина бактериоцина из клетки за счёт повышенной проницаемости мембраны при увеличении уровня лизофосфолипидов и жирных кислот в мембране.