С 1990 года занимался предпринимательской деятельностью. Основал исследовательскую и консультационную компанию «Центр экономики», а также Российский акционерный концерн «АКРОС». Инициатор создания Конгресса российских деловых кругов. Возглавлял крупные бизнес-объединения.
В 1993 году в Российской академии управления под научным руководством доктора философских наук, профессора В. А. Кулинченко защитил диссертацию на соискание учёной степени кандидата политических наук по теме «Социальное партнерство как фактор политической стабилизации Российского общества» (специальность 23.00.02 — политические институты и процессы). Официальные оппоненты — доктор исторических наук, профессор В. А. Сулемов и кандидат философских наук, доцент А. Ф. Костин. Ведущая организация — Российский государственный социальный институт[5].
В январе 2003 года в газетах «Завтра» и «Советская Россия» была опубликована статья Александра Проханова и Валентина Чикина «Операция „Крот“»[7]. В ней главные редакторы оппозиционных газет обвинили Геннадия Семигина в сотрудничестве с Администрацией президента РФ и в участии в планах властей по расколу народно-патриотических сил перед парламентскими выборами 2003 года. 18 января 2003 года Президиум ЦК КПРФ подверг резкой критике деятельность Семигина в НПСР. В частности, его обвиняли в создании в структуре союза «кабинета министров НПСР», кандидатуры в который он подбирал единолично. По словам критиков, исполком НПСР во главе с Семигиным взял на себя функции высшего органа организации — координационного совета[8].
Несмотря на противоречия с руководством компартии, в сентябре 2003 г. Семигин был официально принят в КПРФ и включен в число её кандидатов на предстоящих парламентских выборах.
7 декабря 2003 года был избран в Государственную Думу РФ IV созыва по Хакасскому одномандатному округу № 31 от КПРФ (48,41 % голосов). Тогда же сторонники Семигина пытались выдвинуть его в качестве кандидата от КПРФ на президентских выборах в марте 2004 года. Однако съезд партии, по инициативе Геннадия Зюганова, поддержал выдвижение первого зампредседателя комитета Госдумы по аграрным вопросам Николая Харитонова (за него проголосовали 128 делегатов, за Семигина — 105). В ответ Геннадий Семигин заявил о решении инициировать создание «широкой левой коалиции».
В январе 2004 года руководство КПРФ обвинило Геннадия Семигина в «подкупе секретарей ряда местных парторганизаций» с целью выдвижения кандидатом в президенты, а также в попытке «приватизации» партии. 18 мая того же года он был исключён из КПРФ с формулировкой «за раскольническую деятельность» и на следующий день вышел из состава думской фракции партии[9]. В июле 2004 г. Семигин заявил об исключении представителей компартии из руководства НПСР. 3 июля вместе со своими сторонниками (Владимир Тихонов, Елена Драпеко, Виктор Зоркальцев, Александр Шабанов, Леонид Иваненко, Вячеслав Бойко, Татьяна Астраханкина) предпринял попытку провести альтернативный съезд КПРФ, целью которого было отстранение от руководства партией Геннадия Зюганова. Однако законность этого съезда не была признана Минюстом РФ.
После исключения из рядов КПРФ за «раскольничество» 30 октября 2004 года создал и возглавил политическую коалицию «Патриоты России», объединившую десять малых партий левоцентристского толка:
«Евразийская партия — Союз патриотов России» (лидер — Павел Бородин),
Коалиция «Патриоты России» была образована на базе Конгресса патриотов, созванного в марте 2004 года по инициативе Геннадия Семигина сразу после президентских выборов, которые вслед за думскими оказались провальными для левых партий, и в первую очередь для КПРФ.
В апреле 2005 года возглавил созданную им политическую партию «Патриоты России» (в неё вошли Евразийская партия, Народно-патриотический союз России, большая часть партии «СЛОН» и Партия труда).
10 марта 2005 года создал[10] «теневое» Народное правительство, в которое вошли такие известные политики, как Оксана Дмитриева (министр соцзащиты), Сергей Глазьев (министр финансов), Игорь Родионов (министр обороны), Сергей Бабурин (министр по делам СНГ), Геннадий Гудков (министр внутренних дел и безопасности), Иван Грачёв (министр внешнеэкономических связей и развития предпринимательства), Николай Киселёв (министр сельского хозяйства), Елена Драпеко (министр культуры), Виктор Алкснис (председатель народного комитета по миграционной политике и связям с соотечественниками), Ренат Акчурин (министр здравоохранения), Магомед Толбоев (министр по чрезвычайным ситуациям) и другие. Структура правительства — 22 народных министерства и 4 комитета, объединённые в три блока: экономический, социальный и правовой.
12 декабря 2006 года Семигин с Юрием Савельевым, Еленой Драпеко и Геннадием Селезнёвым, раннее исключёнными из фракции КПРФ, были приняты во фракцию «Родина». 15 декабря фракция приняла решение, что Геннадий Семигин с 9 января 2007 года возглавит её вместо Сергея Бабурина, совмещавшего эту должность с постом вице-спикера Думы. Голосование было проведено в отсутствие Бабурина по инициативе его заместителя Сергея Глотова. Уже 20 декабря против этого назначения и изменения названия фракции на «Родина» («Народная воля»-СЕПР-«Патриоты России») выступил лидер Социалистической единой партии России (СЕПР) Василий Шестаков, которого поддержал и Сергей Бабурин.
Тем не менее, 9 января 2007 года Семигин провёл первое заседание новой объединённой фракции. На заседании он предложил сразу 15 законопроектов для внесения в Думу.
Тем временем Сергей Бабурин заявил 17 января 2007 года, что, если его сторонникам не удастся вернуть контроль над фракцией «Родина» («Народная воля»-СЕПР-«Патриоты России»), то 7 из 17 членов фракции, в том числе сами лидеры двух из трёх партий-соучредителей блока «Родина» — «Народной воли» и Социалистической единой партии России (СЕПР) — Сергей Бабурин и Василий Шестаков — учредят новое депутатское объединение «Народно-патриотический союз» (НПС), чего, однако, сделано не было.
Фракция «Родина» («Народная воля» — СЕПР) возникла в июле 2005 года в результате раскола фракции «Родина», которую тогда возглавлял Дмитрий Рогозин. Новую фракцию возглавил вице-спикер Госдумы Сергей Бабурин, вместе с ним «Родину» покинули ещё семь депутатов. Тогда думский комитет по регламенту решил, что «Народная воля» и СЕПР, наряду с Партией российских регионов, позднее переименованной в «Родину», имеют право на создание своей фракции как партии, преодолевшие на выборах в Госдуму-2003 пятипроцентный барьер в составе блока «Родина». В январе 2007 года фракция состояла уже из 17 депутатов.
На выборах в Государственную думуV созыва возглавляемая Семигиным партия «Патриоты России» получила 0,89 % голосов и не преодолела 7%-го проходного порога.
В декабре 2020 года появились данные, что парламентская партия Справедливая Россия готовится к объединению с партиями «За правду» и «Патриоты России». В конце декабря лидер партии Сергей Миронов подтвердил эти намерения, а 20 января 2021 года было объявлено о достижении соглашения. Объединение партий планируется в феврале-марте того же года под названием «Справедливая Россия — Патриоты — За правду» или «Справедливая Россия — За правду»[11]. Федеральный список на выборах депутатов Государственной Думы возглавят лидеры трёх партий — Сергей Миронов, Захар Прилепин и Геннадий Семигин[12].
22 февраля 2021 года на объединительном съезде трёх партий Сергей Миронов был избран её председателем, а Геннадий Семигин и Захар Прилепин — сопредседателями[13].
26 октября 2024 года председатель партии Сергей Миронов сообщил, что получил от Семигина заявление о сложении полномочий сопредседателя партии. При этом он остаётся членом партии[3].
В конце мая 2024 года фракция СРЗП приняла решение освободить Семигина от поста главы комитета Госдумы по делам национальностей, объяснив это ротацией. 11 июня Госдума приняла соответствующее постановление. Ранее Геннадий Семигин стал фигурантом скандала после публикации на сайте движения «Патриоты России», которое он возглавляет. В ней, в частности, говорилось, что бойцы подразделения «Ахмат» в ходе СВО «загоняют пинками» российских военных на поле боя. Сам Семигин заявил, что сайт взломали для целенаправленной диверсии[2].
↑Семигин, Геннадий Юрьевич. Политическая стабильность общества в условиях реформ : автореф. дис. … д-ра полит. наук : 22.00.05 / Ин-т социально-политич. исслед. — Москва, 1996. — 59 с.