Философский факультет был в числе трёх первых факультетов, существовавших в образованном Петром I университете при Академии наук.
После создания (воссоздания) в 1819 году Императорского Санкт-Петербургского университета на основе Главного педагогического института на базе соответствующего отделения института был образован философско-юридический факультет. В 1835 году произошла реорганизация университета, включавшая разделение на два факультета — философский и юридический. Философский факультет в свою очередь распадался на два отделения — I (включавшее в себя гуманитарные науки, в том числе кафедру философии) и II (точные и естественные науки). В 1849—1850 годах в условиях политической реакции философский факультет был реорганизован (созданы историко-филологический и физико-математический факультеты), а кафедра философии упразднена. Воссоздание кафедры философии (в рамках историко-филологического факультета) произошло только в 1863 году с введением в действие нового университетского устава. В ходе реорганизаций университетской структуры в раннее советское время философия была отнесена к факультету общественных наук (1919), в 1920-е годы представители старой школы подвергались репрессиям, в том числе высылке (философский пароход), а система преподавания философских наук в университете была практически свёрнута.
В 1939 году решением ЦК ВКП(б) на базе философского отделения кафедры диалектического и исторического материализма исторического факультета ЛГУ было создано философское отделение. 23 июня 1940 года приказом директора ЛГУ П. В. Золотухина № 80 в соответствии с Уставом университета и на основании разрешения Всесоюзного комитета по высшей школе (ВКВШ) на базе философского отделения исторического факультета с 1 сентября был создан философский факультет. Основной целью выделения кафедры в отдельный факультет была необходимость углублённой подготовки преподавательских кадров для вузов и средних учебных заведений страны.
К началу Великой Отечественной войны на факультете работало три кафедры: кафедра диалектического и исторического материализма, кафедра истории философии и кафедра педагогики. В годы войны факультет был эвакуирован в Саратов. В 1944 году, когда деканом был М. В. Серебряков, к ним прибавилась кафедра психологии, а в 1947 году — кафедра логики, таким образом число кафедр достигло пяти. В 1949 году Серебрякова сместили в связи с ленинградским делом, была произведена «чистка» профессорско-преподавательского состава. Новый декан Д. М. Михайлин характеризовался современниками как «личность психопатологическая»[1].
При следующем декане В. П. Рожине (1961—1970) было уже семь кафедр: истории философии, диалектического и исторического материализма для естественных факультетов, диалектического и исторического материализма для гуманитарных факультетов, логики, психологии, этики и эстетики, педагогики. В это время на факультете обострилась клановая борьба между «полковниками» и их оппонентами «евреями»[5]. С этой борьбой связывается уход с факультета И. С. Кона (1967) и М. А. Кисселя (хотя по воспоминаниям Г. Л. Тульчинского, тот отправился в Москву ради карьерного роста)[источник не указан 3020 дней]. В. И. Кобзарь также констатирует наличие ожесточённой борьбы на факультете, называя противников «консерваторами» и «новаторами»[6]. Г. Л. Тульчинский признаёт наличие антисемитских настроений, но приписывает их одному В. А. Светлову. Одной стороной конфликта был В. И. Свидерский, а другой — группа В. Я. Ельмеева, А. К. Белых, А. А. Галактионова (оставил факультет в 1979), П. Ф. Никандрова (оставил факультет в 1974)[1]. В 1966 году отделение психологии философского факультет стало самостоятельным факультетом психологии.
В 1989 году с началом перестройки и первым в истории избранием декана Ю. Н. Солонина на факультете были произведены реформы. Подверглись расформированию (или переименованию) как не отвечающие «духу времени» кафедры и появились новые, такие как кафедра политологии, кафедра социальной философии, истории русской философии, истории и философии религии, философии науки и техники, онтологии и теории познания, философской антропологии, философии культуры и культурологии, кафедра политических институтов и прикладных политических исследований, кафедра социально-политических реформ России.
С 2001 года заслуженным учёным факультета присуждается звание «Почётный профессор СПбГУ». На данный момент его удостоены: д.филос.н. М. С. Каган (2001), д.филос.н. В. П. Бранский (2004), д.филос.н. Я. А. Слинин (2005), д.филос.н. В. Г. Марахов (2008), д.филос.н. Ю. В. Перов (2009) и д.филос.н. Б. В. Марков (2015).
В 2006 году философский факультет был переименован в факультет философии и политологии. Во время реорганизации упразднилась[7] существовавшая с 1970 года кафедра современной зарубежной философии.
30 марта 2009 года учёный совет СПбГУ постановил на основе факультета философии и политологии создать факультет политологии и философский факультет. В 2010 году специалисты факультета (заведующий кафедрой этики В. Ю. Перов) отказались участвовать в разработке курса Основы светской этики[8]. В 2011 году на факультете на базе существовавшего с 2000 года Центра библеистики и иудаики была создана кафедра еврейской культуры[9].
Ежегодно в 20-х числах ноября на факультете проводятся Дни философии в Петербурге: это мероприятие международного значения, собирающее деятелей в области философии и смежных дисциплин. Данное мероприятие представляет собой несколько параллельно идущих конференций различной тематики.
Возникла как кафедра диалектического и исторического материализма (спец. 09.00.01), онтологическое направление начала приобретать при Тугаринове в 1950-е гг., современное название с 1989 года