SMC4

Pause

SMC4, или белок структурной поддержки хромосом номер четыре (англ. Structural maintenance of chromosomes protein 4), также известный как хромосом-ассоцированный полипептид C или XCAP-C гомолог — это белок, который у человека кодируется геном SMC4[5][6][7]. SMC4 — основная субъединица комплекса конденсина I и II, большого мультибелкового комплекса, участвующего в конденсации хромосом[8].

Общие сведения
SMC4
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4U4P

Идентификаторы
ПсевдонимыSMC4, CAP-C, CAPC, SMC-4, SMC4L1, hCAP-C, structural maintenance of chromosomes 4
Внешние IDOMIM: 605575 MGI: 1917349 HomoloGene: 4015 GeneCards: SMC4
Расположение гена (человек)
Хр.3-я хромосома человека[1]
Локус3q25.33Начало160,399,274 bp[1]
Конец160,434,954 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.3-я хромосома мыши[2]
Локус3|3 E1Начало68,912,071 bp[2]
Конец68,941,956 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001002799
NM_001002800
NM_001288753
NM_005496

NM_133786
NM_001356976

RefSeq (белок)

NP_001002800
NP_001275682
NP_005487

NP_598547
NP_001343905

Локус (UCSC)Chr 3: 160.4 – 160.43 MbChr 3: 68.91 – 68.94 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функции

SMC4 имеет обширный ряд функций, важных для развития организма человека. В основном он участвуют в конденсации и сегрегации хромосом, а также в таких функциях хромосом, как поддержание подавленного состояния экспрессии генов, организация гетерохроматина и репарация ДНК[9].

Роль SMC4 в развитии карциномы

SMC4 участвует в опухолевом процессе в печени, толстой кишке и лёгких. Этот белок тесно связан с клеточным циклом, клеточной адгезией и модификацией РНК в развитии лёгких и канцерогенезе. Он сверхэкспрессируется в тканях аденокарциномы лёгких и может служить независимым прогностическим фактором. Инактивация SMC4 сильно подавляет пролиферацию и инвазию клеток A549, белок также взаимодействует с DDX46. Ключевая роль белка в развитии лёгких и канцерогенезе показывает, что гены с аналогичным паттерном экспрессии SMC4 в развитии лёгких могут способствовать прогрессии рака лёгких[9].

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000113810 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034349 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Schmiesing J.A., Ball AR Jr, Gregson H.C., Alderton J.M., Zhou S., Yokomori K. Identification of two distinct human SMC protein complexes involved in mitotic chromosome dynamics (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — November (vol. 95, no. 22). — P. 12906—12911. — doi:10.1073/pnas.95.22.12906. — PMID 9789013. — PMC 23650.
  6. ↑ Nishiwaki T., Daigo Y., Kawasoe T., Nagasawa Y., Ishiguro H., Fujita M., Furukawa Y., Nakamura Y. Isolation and characterization of a human cDNA homologous to the Xenopus laevis XCAP-C gene belonging to the structural maintenance of chromosomes (SMC) family (англ.) // Journal of Human Genetics : journal. — 1999. — June (vol. 44, no. 3). — P. 197—202. — doi:10.1007/s100380050142. — PMID 10319587.
  7. ↑ Entrez Gene: SMC4 structural maintenance of chromosomes 4. Архивировано 5 декабря 2010 года.
  8. ↑ Alliance of Genome Resources. www.alliancegenome.org. Дата обращения: 15 августа 2021. Архивировано 15 августа 2021 года.
  9. ↑ 1 2 Chengli Zhang, Manchao Kuang, Meng Li, Lin Feng, Kaitai Zhang. SMC4, which is essentially involved in lung development, is associated with lung adenocarcinoma progression (англ.) // Scientific Reports. — 2016-09-30. — Vol. 6, iss. 1. — P. 34508. — ISSN 2045-2322. — doi:10.1038/srep34508. Архивировано 15 августа 2021 года.

Категории

Pause