Расположено на правом берегу Селенги, при впадении речки Кяхты, в 26 км северо-западнее районного центра — города Кяхта. Ближайшая ж/д станция Хоронхой находится в 16 км по автодороге на юго-запад от села.
Первоначально, Усть-Кяхта — ремесленная слобода Троицкосавска, основанная в 1730 году[2].
15 декабря 1743 года был издан указ Сената о выселении из Троицкосавска на постоянное местожительство лиц, не имеющих капитала, которых сначала стали селить в окрестностях Усть-Кяхты. Так, в Липовском жил Липка, в Киприяновке — Киприян и т. п. Выселенцы стремились к тому, чтобы накопив капитал снова вернуться в торговую слободу Троицкосавска.
В 1775 году построена Богородице-Тихвинская церковь. В это время в слободе было 70 дворов и 500 жителей. Жители занимались хлебопашеством и сенокошением. Было развито огородничество, которое появилось здесь благодаря капитану Кропотову, прибывшему в эти места по поручению Екатерины II для переговоров с китайцами. Капитан появлялся в Усть-Кяхте дважды — в 1763 и 1765 годах. Во второй приезд он прожил здесь три года и в это время занялся введением огородничества[3]. Огороды поливали из речки Савва. В 1800 году Савва после сильного дождя разлилась и затопила все огороды, вынудив жителей селиться на высокие места. Село разделилось на три части — на Заречную, Сухоруку и Горную.
С развитием торговли в Кяхте в селе стали появляться торговые дельцы, которые начали создавать различные ремесленные производства и ввели некоторые улучшения в сельском хозяйстве. Купец Николай Игумнов открыл конный завод с лошадьми орловской породы, разводил холмогорских коров, мериносовых овец и пчёл; построил ирригационные сооружения на сенокосных угодьях. Сено продавали ямщикам, возившим чай из Кяхты в Иркутск на весьма выгодных условиях. В 1820 году купец заложил сад в селе.
26 июня 1812 года была произведена закладка каменной Богородице-Тихвинской церкви, которая строилась в течение 15 лет за счёт средств местных жителей. Кирпич делали здесь же.
Вслед за Игумновым появляется некий Орлов, который открыл торговлю предметами первой необходимости (чаем, сахаром и другими мелкими товарами). Дорогостоящих мануфактур, как ситец, здесь не покупали. Местные жители в основном носили одежду из дешёвой китайской материи (даба, далемба). В 1818 году Орлов открыл небольшой кожевенный завод, который вырабатывал в год до тысячи кож. Потребителями кож была кяхтинская торговля.
В 1835 году в Усть-Кяхте открылся сахарный завод. Свекловица для завода рассаживалась в окрестности и Бичуре. Выращивали неплохую свеклу, но сахар не могли получать, так как не было хорошо знающих сахарное производство мастеров. Затем завод переключился на выработку мыла и свечей.
С 1837 года число мелких промышленных предприятий увеличивается. Так, кожевенных заводов стало 10, мыловаренных — 3, свечных — 2. Мыло и свечи распространялись по всему Забайкалью до 1875 года. К 1840 году заметно увеличилось и население Усть-Кяхты — насчитывалось до 700 жителей, при числе дворов 120. Преобладало население мещанского и крестьянского сословий.
С осени каждого года в Усть-Кяхту начинали прибывать томские, иркутские и кабанские ямщики, которые находились в селе почти до Рождества в ожидании замерзания Байкала и установления санного пути.
В 1860 году открылось Усть-Кяхтинское начальное училище[4].
В 1864 году в село был проведён телеграф из Троицкосавска.
В 1869 году началось пароходное сообщение по Селенге с Усть-Кяхтой[5].
В 1870 году был проложен новый путь от Байкала в слободу Усть-Кяхта и далее до Кяхты через Удунгу с остановкой в Зарубино[6].
24 августа 1884 года открылась Матвеевская богадельня. Весной 1883 года кяхтинский купец I гильдии Матвей Васильевич Шишмаков приобрёл дом рядом с церковью и приходским училищем. После ремонта в богадельню заселились 10 человек. Управляли богадельней священник, попечители церкви и церковный староста[7].
В 1888 году впервые в Усть-Кяхте появился медицинский пункт в лице одной акушерки.
В 1902 году в селе была открыта церковно-приходская библиотека. Книгами читатели пользовались бесплатно. В фондах имелись произведения русских классиков. Особенно хорошо была представлена литература по географии и этнографии Центральной Азии.
22 июля 1926 года началось регулярное воздушное сообщение по линии Верхнеудинск — Урга. Линия стала первой международной авиалинией СССР. Самолёты совершали промежуточную посадку в Усть-Кяхте[9].
Пристань в Усть-Кяхте была самой верхней на Селенге. Утратила своё значение после строительства железнодорожной ветки Улан-Удэ — Наушки.
В окрестностях села Усть-Кяхта известны многочисленные местонахождения археологических памятников, которые осматривались и исследовались А. П. Мостицем в 1894 г., С. Н. Лаптевым в 1924 г., Г. Ф. Дебецем и Г. П. Сосповским в 1926 г., А. П. Окладниковым и З. А. Абрамовой в 1947, 1949, 1950 гг., Ю. А. Гричаном, Ю. П. Холюшкиным в 1974-77 гг. (в составе экспедиции под руководсгвом A. П. Окладникова), В. И. Ташаком в 1989—1995 гг.
Зуб древнего человека, найденный близ деревни Усть-Кяхта на участке Усть-Кяхта-3[23] и исследованный генетиками, показал, что геном его обладателя, жившего ок. 14 тыс. л. н., происходит от смешанной популяции древних северных евразийцев (ANE)[en] (Мальта́) и северо-восточных азиатов (Northeast Asian (NEA))[24].
↑Крит Н. Будущность Кяхтинской торговли. — Санкт-Петербург: типография Артиллерийского департамента В. С., 1862.
↑Памятная книжка Забайкальской области на 1891 год. Изд. Забайк. ОСК — Чита, 1891, стр. 41
↑И. В. Щеглов Хронологический перечень важнейших данных из истории Сибири. Издание ВСРГО. Иркутск. 1883. стр. 386
↑Тугутов Р. Ф. Село Усть-Кяхта // Знамя Ленина, 26 и 28 февраля, 12 марта 1958 г.
↑Мих. Рещиков Открытіе и освященіе усть-кяхтинской Матѳіевской богадѣльни 9 августа 1884 года. //Прибавления к Иркутским епархиальным ведомостям. № 35, 1 октября 1884 года. стр. 391—397
↑Старицкий А. К. Отчёт по исследованию в 1907—1909 гг. реки Селенги и её притоков. Изд. под ред. Бюро изысканий Упр. В. В. П. и Ш. Д. — Санкт-Петербург. 1913. стр. 45
↑Зарёв Бурят-Монгольская воздушная линия открыта // Бурят-Монгольская правда. Верхнеудинск. № 162 (835) 23 июля 1926 года. стр. 4
Мартос А. И. Письма о Восточной Сибири. // Москва. Университетская типография. 1827. стр. 58-59
Крит Н. Будущность Кяхтинской торговли. — Санкт-Петербург: типография Артиллерийского департамента В. С., 1862
Талько-Грынцевич Ю. Д. Материалы к палеоэтнологии Забайкалья // Труды Троицкосавско-Кяхтинского отделения Приамурского отдела Императорского Русского географического общества, т. I, вып. 3, 1898, стр. 35-76.
Талько-Грынцевич Ю. Д. Материалы к палеоэтнологии Забайкалья // Труды Троицкосавско-Кяхтинского отделения Приамурского отдела Императорского Русского географического общества, т. IV, вып. 2, 1901, стр. 32-59.
Верблеонер А. И. Проект постройки железной дороги от Мысовска до Троицкосавска и Кяхты в связи с её продолжением по Монголии через Ургу до Калгана (с картой и профилем) // Труды Троицкосавско-Кяхтинского отделения Приамурского отдела Императорского Русского географического общества, т. XII, вып. 1,2 и последний, 1909. — СПб, 1911.
Старицкий А. К. Река Селенга в Забайкальской области. — СПб, 1913
Окладников А. П., Запорожская В. Д. Петроглифы Забайкалья. — Л., 1969. — Ч 1
Окладников А. П., Запорожская В. Д. Петроглифы Забайкалья. — Л., 1970. — Ч 2
Коновалов П. Б. Хунну в Забайкалье (погребальные памятники). — Улан-Удэ: Бурятское книжное издательство, 1976. 248 с.
Тиваненко А. В. Древнее наскальное искусство Бурятии: новые памятники. — Новосибирск, 1990
Ташак В. И. Усть-Кяхта — многослойное поселение на р. Селенге // Культуры и памятники эпохи камня и раннего металла Забайкалья. — Новосибирск, 1993
Тиваненко А. В. Древние святилища Восточной Сибири в эпоху раннего средневековья. — Новосибирск, 1994
Лбова Л. В., Хамзина Е. А. Древности Бурятии: карта археологических памятников. — Улан-Удэ, 1999.
Цыбиктаров В. А. Петроглифы Забайкалья (вопросы формирования источниковой базы, историографии и культурно-исторической интерпретации)//Автореферат на соискание ученой степени кандидата исторических наук. — Новосибирск, 2006