Rad50

Белок, кодируемый этим геном очень похож на белок Rad50, Saccharomyces cerevisiae, участвующий в репарации двойных разрывов цепочки ДНК. Этот белок образует комплекс с MRE11 и NBS1 (также известный как Xrs2 в дрожжах). Этот комплекс MRN (комплекс MRX в дрожжах) связывается с повреждёнными концами ДНК и представляет многочисленные ферментативные активности, необходимые для репарации двойных разрывов нити присоединением негомологичного конца или гомологичной рекомбинацией. Исследования нокаутом гена мышиного гомолога Rad50 предполагают, что это важно для роста клеток и жизнеспособности. Было опубликовано два варианта транскрипта альтернативного сплайсинга Rad50, которые кодируют белки^[1].

Rad50 является членом структурного семейства белков поддержания хромосом (SMC)^[2]. Как и другие белки SMC, Rad50 содержит длинный внутренний биспиральных домен, который складывается обратно на себя, в результате чего N- и С-концы вместе образуют шаровидную ABC АТФазную голову домена. Rad50 может димеризовать как за счет своей головы домена, так и через цинко-связывающий димеризационный мотив на противоположном биспиральном конце, известном как «цинковый крючок»^[3]. Результаты микроскопии атомных сил показывают, что в свободном комплексе NBS1 Mre11-Rad50, цинковые крючки одного димера Rad50 ассоциируются с образованием замкнутого контура, в то время как цинковые крючки оснастки, после связывания ДНК, подвергаются конформации, что, как полагают, позволяет цинковым трубкам опосредованное скрепление повреждённых концов ДНК^[4].

Rad50, как было выявлено, взаимодействует с:

• BRCA1^[5][6][7],
• MRE11A^{[5][6][8][9][10]},
• NBN^{[5][9][11][12]},
• RINT1^[13],
• TERF2IP^[14] и
• TERF2^[14][15].

Белок Rad50 в основном изучали у эукариот. Тем не менее, недавняя работа показала, что ортологи белка Rad50 также сохраняется в дошедших до нас прокариотических архей, где они, вероятно, функционируют в гомологичной рекомбинационной репарации^[16]. В гипертермофильной архее Sulfolobus acidocaldarius , белки Rad50 и Mre11 взаимодействуют и, кажется, играют активную роль в репарации повреждений ДНК, причинённых гамма-излучением^[17]. Эти результаты показывают, что Rad50 эукариот может быть произошёл из наследственного белка Rad50 архей, который играл роль в гомологичной рекомбинационной репарации повреждений ДНК.