Флаг составлен на основании герба Мценского муниципального района по правилам и соответствующим традициям вексиллологии и отражает исторические, культурные, социально-экономические, национальные и иные местные традиции.
«Прямоугольное белое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее центрально симметричный крест из двух полос шириной в 1/4 длины полотнища каждая, с изображением на фоне креста четырёх жёлтых снопов, развёрнутых к краям полотнища».
Флаг создан с учётом герба Мценского района, который разработан на основе исторического герба города Мценска Орловского наместничества, Высочайше утверждённого 16 (27) августа1781 года. Описание исторического герба гласит: в верхней части щита герб Орловский, в нижней «Пшеничные четыре снопа, в зелёном поле, положенные крестообразно, в знак благословеннаго сей страны изобилия хлебом»[2].
Использование в качестве геральдической основы исторического герба символизирует бережное отношение жителей района к своему прошлому, тесную историческую связь города и района.
Символика креста на флаге района многозначна:
— крест — это перепутье дорог — на территории района издавна встречались дороги разных направлений и это причина того, что в XVII веке Мценск стал крупным хлеботорговым центром. Об этом говорят хлебные снопы, лежащие на лапах креста.
— Снопы и крест символизируют земледелие как основу экономики района.
— На территории современного района найдены многочисленные городища одного из восточнославянских племён — вятичей. Крест напоминает о легенде о монахе Кукше сподвижнике Черниговского архипастыря Феоктиста и первокрестителе вятичей.
Жёлтый цвет (золото) — символ урожая, богатства, стабильности, уважении и интеллекте.
Белый цвет (серебро) — символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Зелёный цвет — символ молодости, здоровья, природы, жизненного роста.