Основано в 1842 году выходцами из Воронежской, Харьковской, Полтавской и других губерний внутренней России. Первоначально именовалось как Безыменка, а позже стало селом Богородицким. В 1847 году построена деревянная церковь в честь Казанской Божией Матери[3]. В 1892 году началось строительство второй церкви, которое было окончено примерно в 1899 году. В селе было три улицы: Нижняя, Средняя, Верхняя. Главным занятие жителей села было земледелие и скотоводство. Многие крестьяне пахали землю деревянной сохой, сеяли из лукошка, вручную косили хлеб. В то время село имело 16760 десятин земли. У большинства жителей были огороды, фруктовые сады.
По окладным листам в селе Богородицком на 1897 год числилось 1316 ревизских душ, а по посемейным спискам 2741 мужского пола и 2752 женского пола наличных души. В селе были иногородние, их 184 душ мужского и 163 женского пола[3].
Село Богородицкое на 1897 год имело два училища: одноклассное Министерства народного просвещения и школу грамоты[3].
После Великой Октябрьской социалистической революции в 1917 году, произошли изменения в административно-территориальной устройстве. Так, с июня 1924 года село Богородицкое вошло в состав Воронцово-Николаевского района Сальского округа Юго-Востока России, позже Северо-Кавказского края.
Селе Богородицкое, являвшееся центром Богородицкого сельсовета административно входило в состав Воронцово-Николаевского района, который в августе 1930 года был переименован в Сальский район.
После проведённой в 1926 году Всероссийской переписи населения в селе Богородицком насчитывалось 7 380 душ обоего пола, в том числе 3 519 мужского и 3 861 женского пола[5]. Кроме этого, в состав Богородицкого сельсовета входили четыре хутора: Мухин (с населением 257 душ), Смелый (89 душ), Сухинский (66 душ) и Кислицын (53).
После разделения Северо-Кавказского края в январе 1934 года на Азово-Черноморский и Северо-Кавказский, село Богородицкое и Богородицкий сельсовет оставались в составе Сальского района, который вошёл в состав Азово-Черноморского края.
На основании постановления Президиума ВЦИК СССР от 28 декабря 1934 года Богородицкий сельсовет и само село Богородицкое вошли в состав вновь образованного Развиленского района в начале Азово-Черноморского края, а с сентября 1937 года Ростовской области.
В годы Великой Отечественной войны около тысячи сельчан отправились на фронт. С войны не вернулось около пятисот человек. В августе 1942 года село Богородицкое было оккупировано немецко-фашистскими захватчиками. 23 января 1943 года село было освобождено войсками Советской Армии.
В 1959 году Развиленский и Песчанокопский районы были объединены в один Развиленский район, который в 1960 году был переименован в Песчанокопский. С этого времени село Богородицкое в составе этого района.
В период с марта 1963 года по ноябрь 1965 года, после упразднения Песчанокопского района, село Богородицое входило в состав Сальского района.
В 1950-1960-е годы в селе проводилась радиофикация и электрификация, были построены магазины, школа на 269 мест. 1956 году был построен кирпичный завод. В 1966—1967 годах в селе построили Дворец Культуры, здание конторы колхоза «Родина», пекарню, маслоцех, торговый комплекс. В 1967 году в центре села был заложен парк с аллеями из берёзы, липы, ивами.
В 1968 году колхозом «Родина» в селе были построены водопровод, больница на 35 коек, быткомбинат с швейной и обувной мастерской, парикмахерская[6].
XXI век
С марта 2005 года в результате проведённой реформы органов местного самоуправления вошло в состав Богородицкого сельского поселения Песчанокопского района Ростовской области, став его административным центром.
Село Богородицкое имеет развитую социальную инфраструктуру, в состав которой входят средняя общеобразовательная школа № 20, детский сад № 16 «Светлячок», Богородицкая амбулатория Песчанокопской районной больницы, аптека, Дом культуры, библиотека, многочисленные магазины и торговые точки.
Село полностью газифицировано, обеспечено водопроводом и электроснабжением. Основные улицы имеют твёрдое асфальтовое покрытие. С районным центром селом Песчанокопским и ближайшим городом Сальском село Богородицкое связано асфальтированным шоссе.
В 1899 году в селе завершилось строительство церкви высотой 96 метров. Церковь имела позолоченные купола. Вес большого колокола составлял 586 пудов.
В центре села по улице Ленина сооружён обелиск погибшим в войну землякам. Обелиск представляет собой семнадцатиметровый шпиль с красной звездой. На обелиске написаны слова: «Они умирали, чтоб жили мы» и список 432 погибших богородчан. В стене обелиска замуровано письмо к потомкам, которые будут жить в 2045 году. К столетию со дня Великой Победы над фашистской Германией сельчане прочтут адресованные им строки.