23 мая2024 года задержан по уголовному делу (ч. 6 ст. 290 УК РФ, получение взятки в особо крупном размере), которое ведёт Главное военное следственное управление СК РФ[3]. Решением 235-го гарнизонного военного суда помещён под арест на два месяца[4], 18 июля 2024 года арест продлён до 21 октября[5].
С 1992 года проходил службу в Дальневосточном военном округе, занимал должность командира взвода дистанционного управления радиоцентра, был заместителем начальника радиоцентра по технической части, начальником центра каналообразующих систем, заместителем начальника узла—начальника пункта управления связью, начальником штаба—заместителем начальника узла связи и начальника узла связи бригады связи[6].
С 2006 года назначен начальником штаба—заместителем командира бригады связи Восточного военного округа. С декабря 2009 года — командир бригады связи. С декабря 2010 года временно исполнял обязанности начальника связи—замначальника штаба Восточного военного округа по связи.
С 1 июня 2011 года назначен начальником связи—заместителем начальника штаба Восточного военного округа по связи.
С 2016 года назначен заместителем начальника Главного управления связи вооружённых сил России. С мая 2020 года являлся временно исполняющим начальника, затем утверждён начальником Главного управления связи ВС России—заместителем начальника Генерального штаба ВС России.
На этом посту отвечал за обеспечение связи и устойчивое управление в Вооружённых Силах РФ; подразделениях, входящих в состав сил ядерного сдерживания; подразделениях, задействованных в специальной военной операции на Украине, а также выполняющих задачи в Сирии[7]. Помимо того возглавлял координационный комитет начальников связи вооружённых сил стран СНГ.
23 мая 2024 года был задержан сотрудниками Главного военного следственного управления СК РФ. Обвинён в получении взятки в размере 36 млн рублей от генерального директора ОАО «Пермский телефонный завод "Телта"» Алексея Высокова и главного бухгалтера Елены Гришиной — за покровительство при распределении госконтрактов от Минобороны[8]. Посредником при передаче денег выступил бывший глава 1-го управления Главного управления связи Александр Оглоблин (в особом порядке был осуждён на 4,5 года, лишён звания генерал-майора), давший в своё время показания на предшественника Шамарина в должности начальника Главного управления связи Халила Арсланова (общая сумма вменённого ущерба — 6,7 млрд рублей). Предприниматели Высоков и Гришина оформили явки с повинной, раскрыв детали выстроенных между заводом «Телта» и ведомством коррупционных схем. Предприятие получило в 2015-2016 годах госконтракты на поставки для Минобороны РФ, «Воентелекома» и предприятий ОПК на 442 млн рублей[9].
В апреле-мае 2024 года по обвинению в коррупции при распределении госконтрактов от Минобороны были также задержаны:
замминистра обороны Тимур Иванов, его подельники — бизнесмены Сергей Бородин и Александр Фомин;
начальник Главного управления кадров Минобороны генерал-лейтенанта Юрий Кузнецов;
бывший командующий 58-й общевойсковой армией генерал-майор Иван Попов;
глава управления департамента Министерства обороны по обеспечению гособоронзаказа Владимир Вертелецкий[10].
При обыске в московской квартире Вадима Шамарина на улице Полины Осипенко не было обнаружено крупных сумм денег и ценностей. Был изъят только автомобиль марки «Мерседес» стоимостью 14 млн рублей[8].
18 июля 2024 года арест Вадиму Шамарину продлён до 21 октября 2024 года[11], он обвиняется в получении взятки в размере порядка 32 миллионов рублей[12].
9 августа 2024 года стало известно, что Шамарин признал вину в получении 19 млн рублей за поставку в войска раций определённой модели[13].