Проколофоны

Существует две основные группы проколофонов: маленькие, похожие на ящериц Procolophonoidea, и Pareiasauroidea, которые включают в себя крупных, панцирных Pareiasauridae. Согласно «традиционной» классификации Кэрролла 1988 года, а также филогенетическому анализу 2012 года, более мелкие группы, такие как Rhipaesauridae (в настоящее время считается синонимом Nycteroleteridae) и Sclerosauridae, классифицируются как парейазавры и Procolophonidae соответственно^[2]. Во многих исследованиях Nyctiphruretidae определялись как сестринский таксон Procolophonia, но после новых находок их поместили в данную группу как сестринский таксон по отношению к Procolophonoidea^[3].

Упрощённая кладограмма согласно филогенетическому анализу MacDougall и Reisz (2014) с положением проколофонов внутри парарептилий. Родственные связи внутри клад, выделенных жирным, не отображены^[3]:

Традиционно считалось, что проколофоны являются предками черепах, хотя эксперты расходятся во мнениях по поводу того, можно ли найти предков черепах среди Procolophonidae, Pareiasauridae (Lee 1995, 1996, 1997) или предковый род среди просто проколофонов. Мишель Лорен и Роберт Рафаэль Рейс определили кладу проколофонов как «самого последнего общего предка парейазавров, проколофонов, черепах (Chelonia) и всех его потомков» и перечислили ряд аутапоморфий. Тем не менее, Rieppel и deBraga, 1996 и deBraga & Rieppel, 1997 утверждали, что черепахи произошли от завроптеригий. Это означает, что парарептилии и проколофоны — полностью вымершие клады, которые лишь отдалённо связаны с ныне живущими рептилиями. Первый подробный филогенетический анализ родственных связей черепах был проведён Wang et al. (2013). Используя черновые геномы Chelonia mydas и Pelodiscus sinensis, команда воспользовалась самым большим набором данных о черепахах на сегодняшний день и пришла к выводу, что черепахи, вероятно, являются сестринской группой крокодилов и птиц архозавров (Archosauria)^[4]. Включение в группу диапсид говорит о том, что линия черепах утратила характеристики диапсидного черепа и приобрела признаки анапсидов.