Подопланин

Подопланин (англ. Podoplanin, PDPN) — белок, кодируемый геном PDPN[5][6][7].

Что важно знать
Подопланин
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3WSR, 4YO0

Идентификаторы
ПсевдонимыPDPN, AGGRUS, GP36, GP40, Gp38, HT1A-1, OTS8, PA2.26, T1A, T1A-2, T1A2, TI1A, podoplanin, D2-40
Внешние IDOMIM: 608863 MGI: 103098 HomoloGene: 4729 GeneCards: PDPN
Расположение гена (человек)
Хр.1-я хромосома человека[1]
Локус1p36.21Начало13,583,465 bp[1]
Конец13,617,957 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.4-я хромосома мыши[2]
Локус4|4 E1Начало142,994,001 bp[2]
Конец143,026,134 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001006624
NM_001006625
NM_006474
NM_198389
NM_001385053

NM_013317

NM_001290822
NM_010329

RefSeq (белок)

NP_001006625
NP_001006626
NP_006465
NP_938203

NP_001277751
NP_034459

Локус (UCSC)Chr 1: 13.58 – 13.62 MbChr 4: 142.99 – 143.03 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Структура и функция

Подопланин — интегральный мембранный белок типа I, сильно O-гликозилированный гликопротеин типа муцинов, с молекулярной массой 36—43 кДа. В царстве животных это достаточно консервативный белок: его гомологи есть у человека, мышей, крыс, собак и хомяков[8].

Подопланин широко распространён в тканях человека. Гомологи данного белка у других видов выполняют функцию антигенов дифференцировки и рецепторов вируса гриппа. Конкретная функция белка у человека не идентифицирована, но предполагается, что он может быть маркером повреждения лёгких. Были получены альтернативно сплайсированные варианты, кодирующие разные изоформы[7].

Было обнаружено, что подопланин функционирует в альвеолярных клетках лёгких, подоцитах почек и клетках эндотелия лимфатической системы. Также этот белок был обнаружен в образцах нервной ткани мышей и человека[9]. Кроме того, было продемонстрировано, что подопланин играет роль в разделении лимфатической и кровеносной системе во время эмбрионального развития, а его дефицит приводит к стеатозу печени у мышей[9].

Хотя конкретная функция подопланина неизвестна, была отмечена его колокализация с белком промежуточных филаментов нестином, который экспрессируется практически исключительно в нервной ткани[10]. По состоянию на 2013 год, единственный белок, с которым как известно взаимодействует подопланин — это лектин-подобный рецептор CLEC-2 (англ. C-type lectin-like receptor 2)[11]. Оба этих белка играют роль в правильном формировании связей лимфатической и кровеносной систем во время эмбрионального развития.

Клиническое значение

Подопланин активно изучается онкологами. Он является специфичным маркером лимфатических сосудов. Поскольку лимфангиогенез (формирование новых лимфатических сосудов) коррелирует с плохим прогнозом у раковых больных, подопланин может быть полезным диагностическим маркером[8]. Отмечена положительная регуляция подопланина в различных видах опухолей, например в нескольких видах карциномы плоского эпителия, злокачественной мезотелиоме и опухолях мозга[8]. Кроме того, он положительно регулируется ассоциированными с опухолью фибробластами (англ. cancer-associated fibroblasts (CAFs)) в опухолевой строме[8][12], что ассоциируется с неблагоприятным прогнозом течения болезни[13].

В карциномах плоского эпителия подопланин играет ключевую роль в инвазивности раковых клеток, контролируя инвадоподии, что обеспечивает эффективную деградацию внеклеточного матрикса[14].

Примечания