Площадь озера около 320 км², глубина при этом в среднем составляет около одного метра.
Озеро имеет неправильную форму, вытянуто с севера на юг. Береговая линия — изрезанная, с несколькими глубокими заливами. На озере есть несколько больших островов и множество маленьких островков и отмелей. Длина озера с севера на юг — 36 километров, ширина колеблется от 6 до 12 километров. Высота над уровнем моря — 115 метров, площадь водосбора — около 1300 км². Нойзидлер-Зе чрезвычайно мелко, средняя глубина около метра, наибольшая — 1,8 метра.
Возраст озера примерно 20 тысяч лет: оно возникло в конце ледникового периода, в результате колебаний земной коры.
В озеро впадает несколько ручьёв, крупнейший из которых Вулка. Озеро принадлежит к бассейну Рабы и Дуная, оно имело сток в своей юго-восточной оконечности. В настоящее время сток озера зарегулирован с целью поддержания постоянного уровня воды.
Вода в озере Нойзидлер-Зе слабосолёная, уровень воды подвержен большим колебаниям. Несколько раз в истории отмечалось полное высыхание озера (последний раз в 1866 году, когда можно было пересечь его по дну, не намочив ботинок). В 1956 году была учреждена совместная австро-венгерская комиссия по контролю за уровнем воды, в её обязанности входит регулировать сток из озера для поддержания заданного уровня. Несмотря на это, полностью избежать флуктуаций не удаётся. Так в 1965 году после проливных дождей уровень озера поднялся на 35 см, в 2003 году вода упала почти на 30 см.
Поверхность озера сильно заросла тростником, через который местами прорублены проходы для лодок.
В озере обитает 15 видов рыб (наиболее распространенные — вьюны, судак, щука и сазан). Воды озера богаты разными видами беспозвоночных, а в зарослях камыша обитают различные виды редких насекомых.
На озере Нойзидлер-Зе в естественных условиях можно наблюдать более 300 видов гнездящихся и перелётных птиц, среди которых множество видов цапель (включая большую белую), а также колпицы, дикие гуси, поганки, свиязь, камышовки и многие другие.
На территории национального парка по берегу озера проложена учебная тропинка, с которой орнитологи и посетители парка могут вести наблюдение за биосферой заповедника.
Вдоль западного берега озера проходит холмистая гряда, сложенная известняками. Холмы покрыты лесами и очень живописны, на них произрастает большое количество редких видов растений.
Озеро привлекает большое количество туристов и любителей природы. На берегах большое количество пляжей. Разрешён ограниченный вылов рыбы по лицензиям. На Нойзидлер-Зе занимаются парусным спортом и виндсёрфингом, однако небольшая глубина озера временами создаёт проблемы для спортсменов. По той же причине на озере мало развито пассажирское и грузовое судоходство.
↑ 123456Neusiedler See(англ.). — Информация о водоёме на сайте базы данных по озерам мира Международного комитета по проблемам озер (International Lake Environment Committee World Lake Database, ILEC WLDB): wldb.ilec.or.jp (англ.). Дата обращения: 9 июня 2021. Архивировано 6 августа 2020 года.
↑Австрия // Атлас мира / сост. и подгот. к изд. ПКО «Картография» в 2009 г. ; гл. ред. Г. В. Поздняк. — М. : ПКО «Картография» : Оникс, 2010. — С. 63. — ISBN 978-5-85120-295-7 (Картография). — ISBN 978-5-488-02609-4 (Оникс).
↑Нойзи́длер-Зе // Словарь географических названий зарубежных стран / отв. ред. А. М. Комков. — 3-е изд., перераб. и доп. — М. : Недра, 1986. — С. 256.
↑Фе́ртё // Словарь географических названий зарубежных стран / отв. ред. А. М. Комков. — 3-е изд., перераб. и доп. — М. : Недра, 1986. — С. 391.