Каспаза 9

Каспаза 9
Каспаза 9
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	4RHW, 1JXQ, 1NW9, 2AR9, 3D9T, 3V3K, 3YGS
Идентификаторы
Псевдонимы	CASP9, APAF-3, APAF3, ICE-LAP6, MCH6, PPP1R56, caspase 9
Внешние ID	OMIM: 602234 MGI: 1277950 HomoloGene: 31024 GeneCards: CASP9
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	1-я хромосома человека
Конец	15,526,534 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	4-я хромосома мыши
Конец	141,543,287 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	right uterine tube; ; secondary oocyte; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; adrenal cortex; ; mucosa of urinary bladder; ; body of pancreas;
	Наибольшая экспрессия в
	medullary collecting duct; ; cumulus cell; ; Region I of hippocampus proper; ; saccule; ; superior surface of tongue; ; trigeminal ganglion;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	cysteine-type peptidase activity; SH3 domain binding; peptidase activity; связывание с белками плазмы; enzyme activator activity; гидролазная активность; protein kinase binding; cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; cysteine-type endopeptidase activity; связывание похожих белков; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
Компонент клетки	Цитоплазма; цитозоль; Митохондрия; апоптосома; клеточное ядро; protein-containing complex;
Биологический процесс	regulation of apoptotic process; response to estradiol; response to organic cyclic compound; signal transduction in response to DNA damage; cellular response to UV; response to antibiotic; cellular response to organic cyclic compound; старение человека; Тромбопоэз; glial cell apoptotic process; cellular response to dexamethasone stimulus; Протеолиз; cellular response to DNA damage stimulus; response to lipopolysaccharide; positive regulation of neuron apoptotic process; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c; intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; regulation of response to DNA damage stimulus; response to cobalt ion; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; response to UV; execution phase of apoptosis; positive regulation of apoptotic process; Апоптоз; нефрогенез; response to ischemia; leukocyte apoptotic process;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	842
	12371
	ENSG00000132906
	ENSMUSG00000028914
	P55211
	Q8C3Q9
	NM_001229; NM_001278054; NM_032996
	NM_001277932; NM_015733; NM_001355176
	NP_001220; NP_001264983; NP_127463
	NP_001264861; NP_056548; NP_001342105
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Каспаза 9
Каспаза 9
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	4RHW, 1JXQ, 1NW9, 2AR9, 3D9T, 3V3K, 3YGS
Идентификаторы
Псевдонимы	CASP9, APAF-3, APAF3, ICE-LAP6, MCH6, PPP1R56, caspase 9
Внешние ID	OMIM: 602234 MGI: 1277950 HomoloGene: 31024 GeneCards: CASP9
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	1-я хромосома человека
Конец	15,526,534 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	4-я хромосома мыши
Конец	141,543,287 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	right uterine tube; ; secondary oocyte; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; adrenal cortex; ; mucosa of urinary bladder; ; body of pancreas;
	Наибольшая экспрессия в
	medullary collecting duct; ; cumulus cell; ; Region I of hippocampus proper; ; saccule; ; superior surface of tongue; ; trigeminal ganglion;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	cysteine-type peptidase activity; SH3 domain binding; peptidase activity; связывание с белками плазмы; enzyme activator activity; гидролазная активность; protein kinase binding; cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; cysteine-type endopeptidase activity; связывание похожих белков; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
Компонент клетки	Цитоплазма; цитозоль; Митохондрия; апоптосома; клеточное ядро; protein-containing complex;
Биологический процесс	regulation of apoptotic process; response to estradiol; response to organic cyclic compound; signal transduction in response to DNA damage; cellular response to UV; response to antibiotic; cellular response to organic cyclic compound; старение человека; Тромбопоэз; glial cell apoptotic process; cellular response to dexamethasone stimulus; Протеолиз; cellular response to DNA damage stimulus; response to lipopolysaccharide; positive regulation of neuron apoptotic process; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c; intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; regulation of response to DNA damage stimulus; response to cobalt ion; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; response to UV; execution phase of apoptosis; positive regulation of apoptotic process; Апоптоз; нефрогенез; response to ischemia; leukocyte apoptotic process;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	842
	12371
	ENSG00000132906
	ENSMUSG00000028914
	P55211
	Q8C3Q9
	NM_001229; NM_001278054; NM_032996
	NM_001277932; NM_015733; NM_001355176
	NP_001220; NP_001264983; NP_127463
	NP_001264861; NP_056548; NP_001342105
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Каспаза 9 — одна из каспаз человека, кодируемая геном CASP9 на 1-й хромосоме. Каспаза 9 играет важную роль в сигнальной цепочке апоптоза, вероятно, представляя наиболее «верхний» узел протеазного каскада этой цепочки после сборки апоптосомы.^[5] После активации апоптосомой каспаза 9 в свою очередь активирует ряд других молекул, что в конечном счёте и вызывает запрограммированную клеточную смерть. Такая способность позволила использовать её в генной инженерии в качестве индуцируемого малой молекулой "предохранителя" для самоликвидации ИПСК в случае необходимости^[6].

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000132906 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028914 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Li, P.; Nijhawan, D.; Budihardjo, I.; Srinivasula, S. M.; Ahmad, M.; Alnemri, E. S.; Wang, X. : Cytochrome c and dATP-dependent formation of Apaf-1/caspase-9 complex initiates an apoptotic protease cascade. Cell 91: 479—489, 1997. PMID 9390557
↑ Miki Ando, Toshinobu Nishimura, Satoshi Yamazaki,et al., & Hiromitsu Nakauchi (2015). A Safeguard System for Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Rejuvenated T Cell Therapy. Stem Cell Reports. DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.stemcr.2015.07.011

[refGRCh38EnsemblENSG00000132906-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000132906 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000028914-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028914 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[upstream97-5] Li, P.; Nijhawan, D.; Budihardjo, I.; Srinivasula, S. M.; Ahmad, M.; Alnemri, E. S.; Wang, X. : Cytochrome c and dATP-dependent formation of Apaf-1/caspase-9 complex initiates an apoptotic protease cascade. Cell 91: 479—489, 1997. PMID 9390557

[6] Miki Ando, Toshinobu Nishimura, Satoshi Yamazaki,et al., & Hiromitsu Nakauchi (2015). A Safeguard System for Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Rejuvenated T Cell Therapy. Stem Cell Reports. DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.stemcr.2015.07.011

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]

Протеазы: Цистеиновые (тиоловые) протеазы (КФ 3.4.22)
Кальпаин	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Каспазы	Каспаза 1 Каспаза 2 Каспаза 3 Каспаза 4 Каспаза 5 Каспаза 6 Каспаза 7 Каспаза 8 Каспаза 9 Каспаза 10 Каспаза 12 Каспаза 13 Каспаза 14
Катепсин	B C F H K L1 V/L2 O S W Z
Полученные из растений (плодов)	Папаин Фицин (фикаин) Бромелаин Актинидаин
Остальные	Клострипаин Аутофагин

Каспаза 9

Примечания

Дополнительно по теме

Категории