В 1933 году Екатерина Агибалова поступила в Харьковский планово-экономический техникум. Также училась на вечернем отделении исторического факультета Харьковского университета, который окончила с отличием в 1938 году. Продолжила обучение на аспирантуре исторического факультета, которую окончила в 1941 году. В феврале того же года была назначена на должность старшего преподавателя кафедры средней истории. Была замужем, её муж по национальности был евреем и работал в Харьковском университете[2][3].
После начала Великой Отечественной войны была вынуждена остаться в Харькове из-за своей больной матери. Муж Екатерины Агибаловой был расстрелян немецкими оккупантами в Дробицком Яру. Сама она работала школьным учителем в посёлке Кочеток. В декабре 1943 года вернулась работать на историческом факультете Харьковского университета, где сначала исполняла обязанности заведующего кафедрой всеобщей истории, а позже последовательно занимала должность преподавателя и старшего преподавателя кафедры средней истории на том же факультете[2].
В июне 1947 года была уволена из университета из-за нахождения на оккупированной территории во время войны. В дальнейшем работала школьным учителем истории в средних школах Харькова, в частности, в школе № 131. Во второй половине 1950-х годов, на перерыве одного из семинаров для учителей истории, она предложила своему коллеге Григорию Донскому стать соавтором школьного учебника по истории средних веков. Сначала он отказался, но через два года согласился. Агибалова с Донским начали работу над учебником за полгода до объявления Всесоюзного конкурса учебников по истории для средних школ, который состоялся в 1961 году. Авторы решили принять в нём участие и их учебник «История средних веков» был признан лучшим среди представленных четырнадцати работ и был удостоен первой премии[4][5][3]. От предыдущих учебников по истории работа Агибаловой и Донского отличалась простотой и ясностью преподавания материала, большим количеством иллюстраций и точно выверенной методологией[6].
В следующем году учебник Агибаловой и Донского вышел в печать, всего он выдержал более 25 переизданий. За первые тридцать лет, с момента издания учебника, он дважды коренным образом перерабатывался авторами. В новых версиях они уделяли внимание не только образованию и воспитанию ученика, но и его развитию[7]. Кроме СССР, учебник издавался в Польше, Чехословакии, Вьетнаме, Монголии и Кубе. Также Абигалова была автором ряда методических работ по преподаванию истории в школе, которые были высоко оценены специалистами. В 1973 году Екатерине Агибаловой с Григорием Донским «за учебник для 6 класса „История средних веков“ (1971, 10-е издание)» была присуждена Государственная премия СССР в области науки и техники[2]. Она стала первой школьной учительницей, которая была удостоена такой награды[8].
Публицист Феликс Рахлин подчеркивал, что каждый из соавторов учебника испытывал притеснения от советской власти. Если Григорий Донской страдал из-за своего еврейского происхождения[К 1], то Екатерина Агибалова за то, что осталась на оккупированной территории. По этой причине против вручения ей государственной премии выступал парторг школы где она работала — Анатолий Тарасенко. Он считал аморальным давать премию «коллаборационистке» и писал протестные письма в ЦК КПСС и в другие инстанции[10][3].
Позже Агибалова переехала в Орджоникидзе (с 1990 года Владикавказ). В 1989 году вела переписку с Павлом Сокольским, председателем комиссии «Дробицкий Яр». В письмах она поделилась своими воспоминаниями о Холокосте в Харькове[11]. Умерла Екатерина Агибалова в ноябре 2000 года[2].
Её ученик Александр Шульман охарактеризовал Екатерину Васильевну как высокообразованную и очень добросовестную женщину[12].
Агибалова Е. В. Уроки истории средних веков в седьмом классе: Поурочное метод. пособие (Из опыта работы). — Москва: Учпедгиз, 1959. — 307 с.
Агибалова Е. В., Донской Г. М. История средних веков: Учебник для 6-го класса. — Москва: Учпедгиз, 1962. — 272 с.
Агибалова Е. В., Донской Г. М. Методика преподавания истории средних веков: Пособие для учителей. — Москва: Просвещение, 1966. — 314 с.
Агибалова Е. В., Донской Г. М. Методическое пособие по истории средних веков в 6 классе. — Москва: Просвещение, 1978. — 338 с. — (Библиотека учителя истории и обществоведения).
↑Екатерина Агибалова вспоминала, как председатели областного и городского отделов народного образования упрекали её, что она взяла в соавторы еврея и обещали, что не дадут ему «подняться»[9].
Агібалова Катерина Василівна // Біобібліографічний словник учених Харківського університету : [укр.] / уклад. Б. П. Зайцев, С. Б. Глибицька, С. М. Куделко, С. І. Посохов, В. Д. Прокопова. — Харків : Бізнес-інформ, 2001. — Т. 2. Історики (1905—1920, 1933—2000). — С. 124. — 350 с. — ISBN 966-7702-08-1.
Агібалова Катерина Василівна // Історики Харківського університету (1905-2012 рр.) : [укр.] / уклад. О. М. Богдашина, В. І. Бутенко, С. Р. Марченко. — Харків : ХНУ імені В. Н. Каразіна, 2013. — С. 15—16. — 284 с. — ISBN 978-966-623-881-1.
Frejdenberg M., Rakhlin F. A scholar and pedagogue (In memory of historian Grigorii Markovich Donskoi (1924–1992) : [англ.]. — Shvut. — 1998. — № 5. — P. 193—201.
Эта статья входит в число добротных статей русскоязычного раздела Рувики.