Zobellviridae


Zobellviridae — семейство преимущественно морских бактериофагов с подовирусной морфологией.

Общие сведения
Zobellviridae
Научная классификация
Группа:
Реалм:
Царство:
Тип:
Uroviricota
Класс:
Caudoviricetes
Семейство:
Zobellviridae
Международное научное название
Zobellviridae
Группа по Балтимору
I: дцДНК-вирусы

История

В 2019 году Вера Бишофф с соавторами опубликовали исследование, посвящённое двум новым бактериофагам, паразитирующим на морской бактерии рода Lentibacter, и генетическому разнообразию сходных вирусов. Методами филогенетического анализа полных геномов была очерчена группа вирусов альфа-протеобактерий Celeribacter, Lentibacter и Sulfitobacter[2]. В 2021 году описанный таксон ратифицирован Международным комитетом по таксономии вирусов в ранге семейства, названного в честь американского исследователя Клода Э. Зобелля (англ. Claude Ephraim ZoBell)[3].

Характеристика

В июне 2022 года в составе семейства насчитывалось 8 родов и 11 видов[4]. Размер геномов варьирует в пределах 37—51 килобаз[5], геномные концы организованы в виде прямых повторов. Характер генного состава фагов семейства Zobellviridae и наличие прямых концевых повторов указывают на репликацию генома и механизм упаковки ДНК в капсид по типу фага T7. Лизис бактериальных клеток проходит по каноническому холин-эндолизиновому пути. Согласно метагеномным данным, представители семейства обнаруживаются по всему миру в морях умеренных, тропических и экваториальной зон. Вероятно, Zobellviridae в основном инфицируют бактерий, находящихся в симбиотических отношениях с протистами[2]. Также известен бактериофаг vB_KpnP_Klyazma, обладающий активностью в отношении Klebsiella pneumoniae[6].

Примечания

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. 1 2 Bischoff V, Bunk B, Meier-Kolthoff JP, Spröer C, Poehlein A, Dogs M et al. (2019). “Cobaviruses - a new globally distributed phage group infecting Rhodobacteraceae in marine ecosystems”. The ISME Journal. 13 (6): 1404—1421. DOI:10.1038/s41396-019-0362-7. PMID 30718806.
  3. Krupovic M, Turner D, Morozova V, Dyall-Smith M, Oksanen HM, Edwards R et al. (2021). “Bacterial Viruses Subcommittee and Archaeal Viruses Subcommittee of the ICTV: update of taxonomy changes in 2021”. Archives of Virology. 166 (11): 3239—3244. DOI:10.1007/s00705-021-05205-9. PMID 34417873.
  4. Virus Taxonomy: 2021 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Дата обращения: 24 июня 2022.
  5. [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=txid2842333[Organism:exp] Nucleotide Database]. National Library of Medicine. Дата обращения: 24 июня 2022.
  6. Gorodnichev RB, Kornienko MA, Malakhova MV, Bespiatykh DA, Manuvera VA, Selezneva OV et al. (2023). “Isolation and characterization of the first Zobellviridae family bacteriophage infecting Klebsiella pneumoniae”. International Journal of Molecular Sciences. 24: 4038. DOI:10.3390/ijms24044038. PMID 36835449.