Reptile Database

Pause

Reptile Database — научная база данных, собирающая таксономическую информацию обо всех современных рептилиях и их видах (то есть не включает ископаемые виды, такие как динозавры). База данных фокусируется на уровне видов (в отличие от более высоких таксонов, таких как семейства) и содержит записи обо всех в настоящее время признанных ~14 000 видах и их подвидов[1], хотя обычно существует задержка до нескольких месяцев, прежде чем недавно описанные виды становятся доступны онлайн. В базе данных собираются научные и тривиальные названия, синонимы, библиографические ссылки, сведения о распространении, типовые экземпляры, этимология и другая таксономически значимая информация.

История

База данных была основана в 1995 году как EMBL Reptile Database[2], когда её основатель, Петер Уэц, был аспирантом в Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) в Гейдельберге, Германия. Тюре Эцольд разработал первый веб-интерфейс для EMBL DNA sequence database, который также использовался как интерфейс для Reptile Database. В 2006 году база данных была перенесена в Институт геномных исследований (TIGR) и некоторое время функционировала как TIGR Reptile Database[3], пока TIGR не был объединён с J Craig Venter Institute (JCVI), где Уэц работал доцентом до 2010 года. С 2010 года база данных поддерживается на серверах в Чехии под руководством Петера Уэца и чешского программиста Йиржи Гошека[4]. В 2021 году база данных отметила своё 25-летие вместе с AmphibiaWeb, который отметил 20-летие[5].

Содержание

undefined

По состоянию на август 2024 года в Reptile Database содержится около 12 200 видов (включая ещё ~2 200 подвидов) примерно в 1250 родах (см. рисунок), а также более 60 000 библиографических ссылок и около 22 000 фотографий. База данных постоянно пополняется с момента основания, в среднем ежегодно описывается от 100 до 200 новых видов за последнее десятилетие[6]. В последнее время в базу также добавлен более или менее полный список первичных типовых экземпляров[7].

Связь с другими базами данных

Reptile Database является участником проекта Species 2000, который создал Catalogue of Life (CoL) — метабазу данных, объединяющую более 150 специализированных баз, каталогизирующих все современные виды на планете[8]. CoL предоставляет таксономическую информацию для Encyclopedia of Life (EoL). Reptile Database также сотрудничает с World Register of Marine Species (WoRMS), проектом гражданской науки iNaturalist[9], и содержит ссылки на базу данных Красного списка МСОП. База данных таксономии NCBI также ссылается на Reptile Database.

Примечания

  1. ↑ Uetz, Peter, Stylianou, Alexandrea (2018). “The original descriptions of reptiles and their subspecies”. Zootaxa. 4375 (2): 257—264. DOI:10.11646/zootaxa.4375.2.5.
  2. ↑ Uetz, P.; Etzold, T. (1996). “The EMBL/EBI Reptile Database”. Herpetological Review. 27 (4): 174—175.
  3. ↑ Uetz, P.; J. Goll; J. Hallermann (2007). “Die TIGR-Reptiliendatenbank”. Elaphe. 15 (3): 22—25.
  4. ↑ Abraham, S.A. VCU professor manages comprehensive database to map reptilian lineage. Across the Spectrum. Virginia Commonwealth University (9 января 2015).
  5. ↑ Uetz, Peter; et al. (2021-06-16). “A Quarter Century of Reptile and Amphibian Databases”. Herpetological Review. 52: 246—255.
  6. ↑ Uetz, P. (2010). “The original descriptions of reptiles” (PDF). Zootaxa. 2334 (1): 59—68. DOI:10.11646/zootaxa.2334.1.3.
  7. ↑ Uetz, Peter, Cherikh, Sami, Shea, Glenn, Ineich, Ivan, Campbell, Patrick D., Doronin, Igor V., Rosado, José, Wynn, Addison, Tighe, Kenneth A., Mcdiarmid, Roy, Lee, Justin L. (2019-11-12). “A global catalog of primary reptile type specimens”. Zootaxa [англ.]. 4695 (5): 438—450. DOI:10.11646/zootaxa.4695.5.2. HDL:10141/622594. ISSN 1175-5334. S2CID 207962117.
  8. ↑ Catalogue of Life Source databases Архивировано 17 сентября 2020 года., дата обращения: август 2015
  9. ↑ iNaturalist. Inaturalist.org. Дата обращения: 9 июня 2022.

Ссылки

Категории

Pause