TOPORS

Связанная с топоизомеразой I, богатая аргинином/серином, убиквитин-лигаза белка Е3
Связанная с топоизомеразой I, богатая аргинином/серином, убиквитин-лигаза белка Е3
Идентификаторы
Символ
Внешние ID
Функция	• DNA binding; • antigen binding; • ubiquitin-protein transferase activity; • protein binding; • zinc ion binding; • SUMO ligase activity; • DNA topoisomerase binding;
Компонент клетки	• ubiquitin ligase complex; • spindle pole; • gamma-tubulin complex; • nucleus; • centriole; • cytoplasmic dynein complex; • PML body; • nuclear speck; • midbody; • photoreceptor connecting cilium; • ciliary basal body;
Биологический процесс	• transcription, DNA-templated; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein monoubiquitination; • cellular response to DNA damage stimulus; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • retina layer formation; • protein sumoylation; • protein localization to nucleus; • photoreceptor cell outer segment organization; • regulation of cell proliferation; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • negative regulation of apoptotic process; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • retinal rod cell development; • retinal cone cell development; • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • maintenance of protein location in nucleus; • protein K48-linked ubiquitination;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Связанная с топоизомеразой I, богатая аргинином/серином, убиквитин-лигаза белка Е3
Связанная с топоизомеразой I, богатая аргинином/серином, убиквитин-лигаза белка Е3
Идентификаторы
Символ
Внешние ID
Функция	• DNA binding; • antigen binding; • ubiquitin-protein transferase activity; • protein binding; • zinc ion binding; • SUMO ligase activity; • DNA topoisomerase binding;
Компонент клетки	• ubiquitin ligase complex; • spindle pole; • gamma-tubulin complex; • nucleus; • centriole; • cytoplasmic dynein complex; • PML body; • nuclear speck; • midbody; • photoreceptor connecting cilium; • ciliary basal body;
Биологический процесс	• transcription, DNA-templated; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein monoubiquitination; • cellular response to DNA damage stimulus; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • retina layer formation; • protein sumoylation; • protein localization to nucleus; • photoreceptor cell outer segment organization; • regulation of cell proliferation; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • negative regulation of apoptotic process; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • retinal rod cell development; • retinal cone cell development; • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • maintenance of protein location in nucleus; • protein K48-linked ubiquitination;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Убиквитин-лигаза белка Е3 Topors является ферментом, который у человека кодируется геном TOPORS .^[1]^[2]^[3]^[4] Этот ген кодирует ядерный белок, богатый серином и аргинином и содержит домен цинкового пальца RING-типа. Он сильно выражен в семенниках и функционирует в качестве убиквитин-лигазы белка E3. Мутации в этом гене связаны с пигментным ретинитом типа 31. Альтернативные варианты сплайсинга, кодирующих различные изоформы, были характерны и для этого локуса.

Zhou R., Wen H., Ao S.Z. Identification of a novel gene encoding a p53-associated protein. (англ.) // Gene (журнал) : journal. — Elsevier, 1999. — Vol. 235, no. 1—2. — P. 93—101. — doi:10.1016/S0378-1119(99)00203-6. — PMID 10415337.
Souto-Carneiro M.M., Krenn V., Hermann R., et al. IgVH genes from different anatomical regions, with different histopathological patterns, of a rheumatoid arthritis patient suggest cyclic re-entry of mature synovial B-cells in the hypermutation process (англ.) // Arthritis Res. : journal. — 2001. — Vol. 2, no. 4. — P. 303—314. — doi:10.1186/ar105. — PMID 11056671. — PMC 17813.
Chu D., Kakazu N., Gorrin-Rivas M.J., et al. Cloning and characterization of LUN, a novel ring finger protein that is highly expressed in lung and specifically binds to a palindromic sequence (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 17. — P. 14004—14013. — doi:10.1074/jbc.M010262200. — PMID 11278651.
Weger S., Hammer E., Heilbronn R. Topors, a p53 and topoisomerase I binding protein, interacts with the adeno-associated virus (AAV-2) Rep78/68 proteins and enhances AAV-2 gene expression (англ.) // Journal of General Virology : journal. — Microbiology Society, 2002. — Vol. 83, no. Pt 3. — P. 511—516. — PMID 11842245.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Imabayashi H., Mori T., Gojo S., et al. Redifferentiation of dedifferentiated chondrocytes and chondrogenesis of human bone marrow stromal cells via chondrosphere formation with expression profiling by large-scale cDNA analysis (англ.) // Experimental Cell Research : journal. — 2003. — Vol. 288, no. 1. — P. 35—50. — doi:10.1016/S0014-4827(03)00130-7. — PMID 12878157.
Weger S., Hammer E., Engstler M. The DNA topoisomerase I binding protein topors as a novel cellular target for SUMO-1 modification: characterization of domains necessary for subcellular localization and sumolation (англ.) // Experimental Cell Research : journal. — 2003. — Vol. 290, no. 1. — P. 13—27. — doi:10.1016/S0014-4827(03)00292-1. — PMID 14516784.
Saleem A., Dutta J., Malegaonkar D., et al. The topoisomerase I- and p53-binding protein topors is differentially expressed in normal and malignant human tissues and may function as a tumor suppressor (англ.) // Oncogene (журнал) : journal. — 2004. — Vol. 23, no. 31. — P. 5293—5300. — doi:10.1038/sj.onc.1207700. — PMID 15107820.
Humphray S.J., Oliver K., Hunt A.R., et al. DNA sequence and analysis of human chromosome 9 (англ.) // Nature. — 2004. — Vol. 429, no. 6990. — P. 369—374. — doi:10.1038/nature02465. — PMID 15164053. — PMC 2734081.
Colland F., Jacq X., Trouplin V., et al. Functional proteomics mapping of a human signaling pathway (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 7. — P. 1324—1332. — doi:10.1101/gr.2334104. — PMID 15231748. — PMC 442148.
Rajendra R., Malegaonkar D., Pungaliya P., et al. Topors functions as an E3 ubiquitin ligase with specific E2 enzymes and ubiquitinates p53 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 35. — P. 36440—36444. — doi:10.1074/jbc.C400300200. — PMID 15247280.
Beausoleil S.A., Jedrychowski M., Schwartz D., et al. Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2004. — Vol. 101, no. 33. — P. 12130—12135. — doi:10.1073/pnas.0404720101. — PMID 15302935. — PMC 514446.
Oyanagi H., Takenaka K., Ishikawa S., et al. Expression of LUN gene that encodes a novel RING finger protein is correlated with development and progression of non-small cell lung cancer (англ.) // Lung Cancer : journal. — 2005. — Vol. 46, no. 1. — P. 21—8. — doi:10.1016/j.lungcan.2004.03.009. — PMID 15364129.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Flatten K., Dai N.T., Vroman B.T., et al. The role of checkpoint kinase 1 in sensitivity to topoisomerase I poisons (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 14. — P. 14349—14355. — doi:10.1074/jbc.M411890200. — PMID 15699047.
Lin L., Ozaki T., Takada Y., et al. topors, a p53 and topoisomerase I-binding RING finger protein, is a coactivator of p53 in growth suppression induced by DNA damage (англ.) // Oncogene (журнал) : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 21. — P. 3385—3396. — doi:10.1038/sj.onc.1208554. — PMID 15735665.
Weger S., Hammer E., Heilbronn R. Topors acts as a SUMO-1 E3 ligase for p53 in vitro and in vivo (англ.) // FEBS Letters : journal. — 2005. — Vol. 579, no. 22. — P. 5007—5012. — doi:10.1016/j.febslet.2005.07.088. — PMID 16122737.
Papaioannou M., Chakarova C.F., Prescott D.C., et al. A new locus (RP31) for autosomal dominant retinitis pigmentosa maps to chromosome 9p (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 2006. — Vol. 118, no. 3—4. — P. 501—503. — doi:10.1007/s00439-005-0063-3. — PMID 16189705.

[1]

[2]

[3]

[4]

TOPORS

Примечания

Литература