S100B

S100B
S100B
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1MQ1, 1UWO, 2H61, 2M49, 2PRU, 3CZT, 3D0Y, 3D10, 3HCM, 4XYN, 5CSJ, 5CSF, 5CSN, 5CSI
Идентификаторы
Псевдонимы	S100B, NEF, S100, S100-B, S100beta, S100 calcium binding protein B
Внешние ID	OMIM: 176990 MGI: 98217 HomoloGene: 4567 GeneCards: S100B
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	21-я хромосома человека
Конец	46,605,208 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	10-я хромосома мыши
Конец	76,096,993 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	inferior ganglion of vagus nerve; ; trigeminal ganglion; ; internal globus pallidus; ; superior vestibular nucleus;
	Наибольшая экспрессия в
	anterior horn of spinal cord; ; stria vascularis; ; pontine nuclei; ; facial motor nucleus; ; utricle; ; dorsal tegmental nucleus; ; medial vestibular nucleus;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	calcium ion binding; S100 protein binding; гомодимеризация белка; zinc ion binding; связывание с ионом металла; calcium-dependent protein binding; связывание с белками плазмы; связывание похожих белков; tau protein binding; signaling receptor binding; RAGE receptor binding;
Компонент клетки	Цитоплазма; ruffle; внеклеточная область; neuronal cell body; perinuclear region of cytoplasm; клеточное ядро; внеклеточное пространство;
Биологический процесс	axonogenesis; response to glucocorticoid; Память; negative regulation of skeletal muscle cell differentiation; central nervous system development; astrocyte differentiation; positive regulation of synaptic transmission; позитивная регуляция пролиферации клеток; regulation of cell shape; positive regulation of apoptotic process; обучение или память; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; regulation of neuronal synaptic plasticity; response to methylmercury; пролиферация; Врождённый иммунитет; cellular response to hypoxia; Долговременная потенциация; positive regulation of myelination;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	6285
	20203
	ENSG00000160307
	ENSMUSG00000033208
	P04271
	P50114
	NM_006272
	NM_009115
	NP_006263
	NP_033141
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

S100B
S100B
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1MQ1, 1UWO, 2H61, 2M49, 2PRU, 3CZT, 3D0Y, 3D10, 3HCM, 4XYN, 5CSJ, 5CSF, 5CSN, 5CSI
Идентификаторы
Псевдонимы	S100B, NEF, S100, S100-B, S100beta, S100 calcium binding protein B
Внешние ID	OMIM: 176990 MGI: 98217 HomoloGene: 4567 GeneCards: S100B
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	21-я хромосома человека
Конец	46,605,208 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	10-я хромосома мыши
Конец	76,096,993 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	inferior ganglion of vagus nerve; ; trigeminal ganglion; ; internal globus pallidus; ; superior vestibular nucleus;
	Наибольшая экспрессия в
	anterior horn of spinal cord; ; stria vascularis; ; pontine nuclei; ; facial motor nucleus; ; utricle; ; dorsal tegmental nucleus; ; medial vestibular nucleus;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	calcium ion binding; S100 protein binding; гомодимеризация белка; zinc ion binding; связывание с ионом металла; calcium-dependent protein binding; связывание с белками плазмы; связывание похожих белков; tau protein binding; signaling receptor binding; RAGE receptor binding;
Компонент клетки	Цитоплазма; ruffle; внеклеточная область; neuronal cell body; perinuclear region of cytoplasm; клеточное ядро; внеклеточное пространство;
Биологический процесс	axonogenesis; response to glucocorticoid; Память; negative regulation of skeletal muscle cell differentiation; central nervous system development; astrocyte differentiation; positive regulation of synaptic transmission; позитивная регуляция пролиферации клеток; regulation of cell shape; positive regulation of apoptotic process; обучение или память; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; regulation of neuronal synaptic plasticity; response to methylmercury; пролиферация; Врождённый иммунитет; cellular response to hypoxia; Долговременная потенциация; positive regulation of myelination;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	6285
	20203
	ENSG00000160307
	ENSMUSG00000033208
	P04271
	P50114
	NM_006272
	NM_009115
	NP_006263
	NP_033141
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Белок S100B принадлежит к группе кальций-связывающих белков S100, производится в глиальных клетках, преимущественно астроцитах, но также и за пределами ЦНС, например, в адипоцитах.

Среди возможных функций белка — участие в росте нейритов, пролиферации клеток меланомы, стимуляция притока Ca2+, ингибирование PKC-опосредованного фосфорилирования, астроцитоз, аксональная пролиферация, ингибирование сборки микротрубочек.

Хромосомные изменения, затрагивающие ген S100B, а также измененный уровень белка обнаруживаются в ряде расстройств, таких как болезнь Альцгеймера, синдром Дауна, эпилепсия, амиотрофический латеральный склероз, меланома, диабет 1 типа.

Несколько факторов говорят о возможном взаимодействии белка с дофаминовым D2-рецептором^[5].

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160307 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033208 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Liu Y., Buck D.C., Neve K.A. Novel interaction of the dopamine D2 receptor and the Ca2+ binding protein S100B: role in D2 receptor function (англ.) // Mol. Pharmacol. : journal. — 2008. — August (vol. 74, no. 2). — P. 371—378. — doi:10.1124/mol.108.044925. — PMID 18445708.

[refGRCh38EnsemblENSG00000160307-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160307 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000033208-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033208 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid18445708-5] Liu Y., Buck D.C., Neve K.A. Novel interaction of the dopamine D2 receptor and the Ca2+ binding protein S100B: role in D2 receptor function (англ.) // Mol. Pharmacol. : journal. — 2008. — August (vol. 74, no. 2). — P. 371—378. — doi:10.1124/mol.108.044925. — PMID 18445708.

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

S100B

Примечания

Категории