Reptile Database

Reptile Database — научная база данных, собирающая таксономическую информацию обо всех современных рептилиях и их видах (то есть не включает ископаемые виды, такие как динозавры). База данных фокусируется на уровне видов (в отличие от более высоких таксонов, таких как семейства) и содержит записи обо всех в настоящее время признанных ~14 000 видах и их подвидов[1], хотя обычно существует задержка до нескольких месяцев, прежде чем недавно описанные виды становятся доступны онлайн. В базе данных собираются научные и тривиальные названия, синонимы, библиографические ссылки, сведения о распространении, типовые экземпляры, этимология и другая таксономически значимая информация.

История

База данных была основана в 1995 году как EMBL Reptile Database[2], когда её основатель, Петер Уэц, был аспирантом в Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) в Гейдельберге, Германия. Тюре Эцольд разработал первый веб-интерфейс для EMBL DNA sequence database, который также использовался как интерфейс для Reptile Database. В 2006 году база данных была перенесена в Институт геномных исследований (TIGR) и некоторое время функционировала как TIGR Reptile Database[3], пока TIGR не был объединён с J Craig Venter Institute (JCVI), где Уэц работал доцентом до 2010 года. С 2010 года база данных поддерживается на серверах в Чехии под руководством Петера Уэца и чешского программиста Йиржи Гошека[4]. В 2021 году база данных отметила своё 25-летие вместе с AmphibiaWeb, который отметил 20-летие[5].

Содержание

undefined

По состоянию на август 2024 года в Reptile Database содержится около 12 200 видов (включая ещё ~2 200 подвидов) примерно в 1250 родах (см. рисунок), а также более 60 000 библиографических ссылок и около 22 000 фотографий. База данных постоянно пополняется с момента основания, в среднем ежегодно описывается от 100 до 200 новых видов за последнее десятилетие[6]. В последнее время в базу также добавлен более или менее полный список первичных типовых экземпляров[7].

Связь с другими базами данных

Reptile Database является участником проекта Species 2000, который создал Catalogue of Life (CoL) — метабазу данных, объединяющую более 150 специализированных баз, каталогизирующих все современные виды на планете[8]. CoL предоставляет таксономическую информацию для Encyclopedia of Life (EoL). Reptile Database также сотрудничает с World Register of Marine Species (WoRMS), проектом гражданской науки iNaturalist[9], и содержит ссылки на базу данных Красного списка МСОП. База данных таксономии NCBI также ссылается на Reptile Database.

Примечания

  1. Uetz, Peter, Stylianou, Alexandrea (2018). “The original descriptions of reptiles and their subspecies”. Zootaxa. 4375 (2): 257—264. DOI:10.11646/zootaxa.4375.2.5.
  2. Uetz, P.; Etzold, T. (1996). “The EMBL/EBI Reptile Database”. Herpetological Review. 27 (4): 174—175.
  3. Uetz, P.; J. Goll; J. Hallermann (2007). “Die TIGR-Reptiliendatenbank”. Elaphe. 15 (3): 22—25.
  4. Abraham, S.A. VCU professor manages comprehensive database to map reptilian lineage. Across the Spectrum. Virginia Commonwealth University (9 января 2015).
  5. Uetz, Peter; et al. (2021-06-16). “A Quarter Century of Reptile and Amphibian Databases”. Herpetological Review. 52: 246—255.
  6. Uetz, P. (2010). “The original descriptions of reptiles” (PDF). Zootaxa. 2334 (1): 59—68. DOI:10.11646/zootaxa.2334.1.3.
  7. Uetz, Peter, Cherikh, Sami, Shea, Glenn, Ineich, Ivan, Campbell, Patrick D., Doronin, Igor V., Rosado, José, Wynn, Addison, Tighe, Kenneth A., Mcdiarmid, Roy, Lee, Justin L. (2019-11-12). “A global catalog of primary reptile type specimens”. Zootaxa [англ.]. 4695 (5): 438—450. DOI:10.11646/zootaxa.4695.5.2. HDL:10141/622594. ISSN 1175-5334. S2CID 207962117.
  8. Catalogue of Life Source databases Архивировано 17 сентября 2020 года., дата обращения: август 2015
  9. iNaturalist. Inaturalist.org. Дата обращения: 9 июня 2022.

Ссылки

Категории