CARD (домен)

CARD (сокр. от англ. Caspase recruitment domains, или Caspase activation and recruitment domains) — домены активации и рекрутирования каспаз, являются мотивами взаимодействия, обнаруживаемыми в широком спектре белков, как правило, участвующих в процессах, связанных с воспалением и апоптозом. Эти домены опосредуют образование более крупных белковых комплексов посредством прямого взаимодействия между отдельными CARD-содержащими белками. Домены CARD находятся в поразительно широком диапазоне белков, включая хеликазы, киназы, митохондриальные белки, каспазы и другие цитоплазматические факторы.

Общие сведения
Caspase recruitment domain
Идентификаторы
Символ CARD
Pfam PF00619
InterPro IPR001315
SMART SM00114
PROSITE PS50209
SCOP 3crd
SUPERFAMILY 3crd
CDD cd01671
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель

Основные характеристики

Домены CARD являются подклассом белкового мотива, известного как фолд смерти, в котором расположено шесть-семь антипараллельных альфа-спиралей с гидрофобным сердечником (кор) и наружной поверхностью, состоящей из заряженных аминокислотных остатков. Другие мотивы этого класса включают пириновый домен (PYD), домен смерти (DD) и домен эффектора смерти (DED), они все также участвуют в основном в регуляции апоптоза и воспалительных реакциях.

Участие в апоптозе

Домены CARD ранее характеризовались активацией каспазы и апоптозом[2]. Основная шестиспиральная структура области, по-видимому, сохраняется еще в виде генов ced-3 и ced-4 у C. elegans, организма, в котором сначала были описаны несколько компонентов апоптотического аппарата. CARD мотивы присутствуют в ряде белков, которые способствуют апоптозу, в основном это каспазы 1,2,4,5,9 и 15 у млекопитающих.

Участие в воспалении

Список CARD-содержащих белков

Примечания

  1. Chou J. J., Matsuo H., Duan H., Wagner G. Solution structure of the RAIDD CARD and model for CARD/CARD interaction in caspase-2 and caspase-9 recruitment (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — July (vol. 94, no. 2). — P. 171—180. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81417-8. — PMID 9695946.
  2. Hofmann K., Bucher P., Tschopp J. The CARD domain: a new apoptotic signalling motif (англ.) // Trends (journals) : journal. — 1997. — Vol. 22, no. 5. — P. 155—156. — doi:10.1016/S0968-0004(97)01043-8. — PMID 9175472.

Категории