АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
О РУВИКИ

CAP1

CAP1 (англ. Adenylyl cyclase-associated protein 1) — белок, регулирующий динамику актина. Продукт гена CAP1[4][5][6]

Что важно знать
CAP1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1K8F

Идентификаторы
ПсевдонимыCAP1, CAP, CAP1-PEN, CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast), adenylate cyclase associated protein 1
Внешние IDOMIM: 617801 MGI: 88262 HomoloGene: 74572 GeneCards: CAP1
Расположение гена (Мышь)
Хр.4-я хромосома мыши[1]
Локус4|4 D2.2Начало122,752,840 bp[1]
Конец122,779,849 bp[1]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
    н/д
Наибольшая экспрессия в
  • left lung lobe

  • right lung lobe
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

10487

12331

Ensembl

ENSG00000131236

ENSMUSG00000028656

UniProt

Q01518
Q5T0R9

P40124

RefSeq (мРНК)

NM_001105530
NM_006367
NM_001330502

NM_001301067
NM_007598
NM_001358035
NM_001358036

RefSeq (белок)
NP_001099000
NP_001317431
NP_006358
NP_001337404
NP_001337405

NP_001337406
NP_001337407
NP_001337408
NP_001337409
NP_001337410
NP_001337411
NP_001337412
NP_001337413
NP_001337414

NP_001287996
NP_031624
NP_001344964
NP_001344965

Локус (UCSC)н/дChr 4: 122.75 – 122.78 Mb
Поиск по PubMedИскать[2]Искать[3]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функция

Белок регулирует динамику актиновых филаментов и участвует в ряде комплексных процессов развития и морфологии, включая локализацию мРНК и установление полярности клетки[7]. Белок экспрессирован практически во всех тканях организма[7].

Структура

Ген CAP1 близок по структуре с соответствующим геном CAP из S. cerevisiae, который играет роль в сигнальном пути цАМФ. Белок человека CAP1 взаимодействует с другим CAP1, а также с CAP2 и актином[6]. Белок состоит из 475 аминокислот, молекулярная масса 51,9 кДа. Содержит домен C-CAP (319–453). Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 3 изоформ белка.

Взаимодействия

CAP1 взаимодействует с ACTG1[8] и CAP2[5].

Литература

  • Yu G., Swiston J., Young D. Comparison of human CAP and CAP2, homologs of the yeast adenylyl cyclase-associated proteins (англ.) // Journal of Cell Science : journal. — The Company of Biologists, 1994. — Vol. 107, no. 6. — P. 1671—1678. — PMID 7962207.
  • Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene (журнал) : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
  • Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K. et al. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene (журнал) : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
  • Moriyama K., Yahara I. Human CAP1 is a key factor in the recycling of cofilin and actin for rapid actin turnover (англ.) // Journal of Cell Science : journal. — The Company of Biologists, 2003. — Vol. 115, no. Pt 8. — P. 1591—1601. — PMID 11950878.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — Bibcode: 2002PNAS...9916899M. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Gevaert K., Goethals M., Martens L. et al. Exploring proteomes and analyzing protein processing by mass spectrometric identification of sorted N-terminal peptides (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2004. — Vol. 21, no. 5. — P. 566—569. — doi:10.1038/nbt810. — PMID 12665801.
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Dodatko T., Fedorov A. A., Grynberg M. et al. Crystal structure of the actin binding domain of the cyclase-associated protein (англ.) // Biochemistry : journal. — 2004. — Vol. 43, no. 33. — P. 10628—10641. — doi:10.1021/bi049071r. — PMID 15311924.
  • Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Rual J. F., Venkatesan K., Hao T. et al. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — Bibcode: 2005Natur.437.1173R. — PMID 16189514.
  • Fautsch M. P., Vrabel A. M., Johnson D. H. The identification of myocilin-associated proteins in the human trabecular meshwork (англ.) // Exp. Eye Res. : journal. — 2006. — Vol. 82, no. 6. — P. 1046—1052. — doi:10.1016/j.exer.2005.09.016. — PMID 16289162.
  • Oh J. H., Yang J. O., Hahn Y. et al. Transcriptome analysis of human gastric cancer (англ.) // Mamm. Genome : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 12. — P. 942—954. — doi:10.1007/s00335-005-0075-2. — PMID 16341674.
  • Gregory S. G., Barlow K. F., McLay K. E. et al. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — Bibcode: 2006Natur.441..315G. — PMID 16710414.
  • Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D. M., Giorgianni F. Phosphoproteomic analysis of the human pituitary (неопр.) // Pituitary. — 2006. — Т. 9, № 2. — С. 109—120. — doi:10.1007/s11102-006-8916-x. — PMID 16807684.
  • Garewal G., Das R., Awasthi A. et al. The clinical significance of the spectrum of interactions of CAP+1 (A-->C), a silent beta-globin gene mutation, with other beta-thalassemia mutations and globin gene modifiers in north Indians (англ.) // Eur. J. Haematol. : journal. — 2007. — Vol. 79, no. 5. — P. 417—421. — doi:10.1111/j.1600-0609.2007.00958.x. — PMID 17900295.

Примечания