АссистентНовый вопросИсторияОбласти знаний
Партнёрские проектыСпецпроектыСтать автором
Сменить язык
О РУВИКИ

Бестропин 1

Бестропин-1  — белок, который у человека кодируется геном BEST1.[5][6][7] Он может быть связан с вителиформной макулярной дистрофией .

Общие сведения
Бестропин 1
Идентификаторы
ПсевдонимыBEST1, ARB, BEST, BMD, RP50, TU15B, VMD2, Bestrophin 1, Best1V1Delta2
Внешние IDOMIM: 607854 MGI: 1346332 HomoloGene: 37895 GeneCards: BEST1
Расположение гена (человек)
Хр.11-я хромосома человека[1]
Локус11q12.3Начало61,950,063 bp[1]
Конец61,965,515 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
Хр.19-я хромосома мыши[2]
Локус19|19 AНачало9,962,538 bp[2]
Конец9,978,997 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • external globus pallidus

  • inferior olivary nucleus

  • internal globus pallidus
Наибольшая экспрессия в
  • seminiferous tubule

  • otolith organ

  • utricle

  • proximal tubule

  • body of femur
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

7439

24115

Ensembl

ENSG00000167995

ENSMUSG00000037418

UniProt

O76090

O88870

RefSeq (мРНК)
NM_001139443
NM_001300786
NM_001300787
NM_004183
NM_001363591

NM_001363592
NM_001363593

NM_011913

RefSeq (белок)
NP_001132915
NP_001287715
NP_001287716
NP_004174
NP_001350520

NP_001350521
NP_001350522

NP_036043

Локус (UCSC)Chr 11: 61.95 – 61.97 MbChr 19: 9.96 – 9.98 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функция

BEST1 принадлежит бестропиновому семейству кальций-активируемых анионных каналов, которое включает в себя BEST2 , BEST3 и BEST4. Бестропины являются трансмембранными (ТМ) белками, которымм разделяют гомологический регион с высоким содержанием ароматических остатков, в том числе инвариантный Arg-Phe-Pro (RFP) мотив. Бестропины, как полагают, действуют как хлоридные каналы, которые также могут служить в качестве регуляторов внутриклеточной кальциевой сигнализации.[8]

Бестропин 1, как было выявлено, проницаем для хлорида, тиоцианата, бикарбоната, глутамата, и ГАМК. Бестропин 1 опосредует высвобождение ГАМК, недавно было продемонстрировано, что он ответственен за тонизацию торможения в мозжечке гранулярных клеток,[9] и был связан с патологией болезни Альцгеймера.[10]

Генная структура

В бестропине гены делят консервативную генную структуру, с почти одинакового размера 8 RFP-ТМ кодируемыми доменом экзонами и высоко консервативными экзон-интронными границами. Каждый из 4 генов бестропина имеет 3 первичных уникальных конца переменной длины.[7][11][12]

BEST1, как было показано с помощью двух независимых исследований, регулирует ассоциированный с микрофтальмией транскрипционный фактор.[13][14]

Взаимодействия

Бестропин 1, как было выявлено, взаимодействуют с PPP2CA .[15]

Антагонисты

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000167995 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037418 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Stone E.M., Nichols B.E., Streb L.M., Kimura A.E., Sheffield V.C. Genetic linkage of vitelliform macular degeneration (Best's disease) to chromosome 11q13 (англ.) // Nature Genetics : journal. — 1993. — June (vol. 1, no. 4). — P. 246—250. — doi:10.1038/ng0792-246. — PMID 1302019.
  6. ↑ Barro Soria R., Spitzner M., Schreiber R., Kunzelmann K. Bestrophin 1 enables Ca2+ activated Cl− conductance in epithelia (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2006. — September (vol. 284, no. 43). — P. 29405—29412. — doi:10.1074/jbc.M605716200. — PMID 17003041. — PMC 2785573.
  7. ↑ 1 2 Entrez Gene: BEST1 bestrophin 1. Архивировано 6 марта 2010 года.
  8. ↑ Hartzell H.C., Qu Z., Yu K., Xiao Q., Chien L.T. Molecular physiology of bestrophins: multifunctional membrane proteins linked to best disease and other retinopathies (англ.) // Physiological Reviews : journal. — 2008. — April (vol. 88, no. 2). — P. 639—672. — doi:10.1152/physrev.00022.2007. — PMID 18391176.
  9. ↑ Lee S., Yoon B.E., Berglund K., Oh S.J., Park H., Shin H.S., Augustine G.J., Lee C.J. Channel-mediated tonic GABA release from glia (англ.) // Science. — 2010. — November (vol. 330, no. 6005). — P. 790—796. — doi:10.1126/science.1184334. — PMID 20929730.
  10. ↑ Jo Seonmi, Yarishkin Oleg, Hwang Yu Jin, Chun Ye Eun, Park Mijeong, Woo Dong Ho, Bae Jin Young, Kim Taekeun, Lee Jaekwang, Chun Heejung, Park Hyun Jung, Lee Da Yong, Hong Jinpyo, Kim Hye Yun, Oh Soo-Jin, Park Seung Ju, Lee Hyo, Yoon Bo-Eun, Kim YoungSoo, Jeong Yong, Shim Insop, Bae Yong Chul, Cho Jeiwon, Kowall Neil W, Ryu Hoon, Hwang Eunmi, Kim Daesoo, Lee C Justin. GABA from reactive astrocytes impairs memory in mouse models of Alzheimer's disease // Nature Medicine. — 2014. — 29 июня (т. 20, № 8). — С. 886—896. — ISSN 1078-8956. — doi:10.1038/nm.3639. [исправить]
  11. ↑ Stöhr H., Marquardt A., Nanda I., Schmid M., Weber B.H. Three novel human VMD2-like genes are members of the evolutionary highly conserved RFP-TM family (англ.) // European Journal of Human Genetics : journal. — 2002. — April (vol. 10, no. 4). — P. 281—284. — doi:10.1038/sj.ejhg.5200796. — PMID 12032738.
  12. ↑ Tsunenari T., Sun H., Williams J., Cahill H., Smallwood P., Yau K.W., Nathans J. Structure-function analysis of the bestrophin family of anion channels (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — October (vol. 278, no. 42). — P. 41114—41125. — doi:10.1074/jbc.M306150200. — PMID 12907679. — PMC 2885917.
  13. ↑ Esumi N., Kachi S., Campochiaro P.A., Zack D.J. VMD2 promoter requires two proximal E-box sites for its activity in vivo and is regulated by the MITF-TFE family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2007. — Vol. 282, no. 3. — P. 1838—1850. — doi:10.1074/jbc.M609517200. — PMID 17085443.
  14. ↑ Hoek K.S., Schlegel N.C., Eichhoff O.M., Widmer D.S., Praetorius C., Einarsson S.O., Valgeirsdottir S., Bergsteinsdottir K., Schepsky A., Dummer R., Steingrimsson E. Novel MITF targets identified using a two-step DNA microarray strategy (англ.) // Pigment Cell & Melanoma Research : journal. — 2008. — Vol. 21, no. 6. — P. 665—676. — doi:10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x. — PMID 19067971.
  15. ↑ Marmorstein L.Y., McLaughlin P.J., Stanton J.B., Yan L., Crabb J.W., Marmorstein A.D. Bestrophin interacts physically and functionally with protein phosphatase 2A (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 34. — P. 30591—30597. — doi:10.1074/jbc.M204269200. — PMID 12058047.
  16. ↑ Rao PR. Identification of novel selective antagonists for Bestrophin-1 protein by homology modeling and molecular docking. International Journal of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences 2012; 4(S4):195-200. Дата обращения: 17 января 2015. Архивировано 14 июля 2014 года.

Литература

  • White K., Marquardt A., Weber B.H. VMD2 mutations in vitelliform macular dystrophy (Best disease) and other maculopathies (англ.) // Human Mutation : journal. — 2000. — Vol. 15, no. 4. — P. 301—308. — doi:10.1002/(SICI)1098-1004(200004)15:4<301::AID-HUMU1>3.0.CO;2-N. — PMID 10737974.
  • Nordström S., Barkman Y. Hereditary maculardegeneration (HMD) in 246 cases traced to one gene-source in central Sweden (англ.) // Hereditas : journal. — 1977. — Vol. 84, no. 2. — P. 163—176. — doi:10.1111/j.1601-5223.1977.tb01394.x. — PMID 838599.
  • Forsman K., Graff C., Nordström S., et al. The gene for Best's macular dystrophy is located at 11q13 in a Swedish family (англ.) // Genetics (журнал) : journal. — Genetics Society of America, 1992. — Vol. 42, no. 3. — P. 156—159. — doi:10.1111/j.1399-0004.1992.tb03229.x. — PMID 1395087.
  • Stöhr H., Marquardt A., Rivera A., et al. A gene map of the Best's vitelliform macular dystrophy region in chromosome 11q12-q13.1 (англ.) // Genome Research : journal. — 1998. — Vol. 8, no. 1. — P. 48—56. — doi:10.1101/gr.8.1.48. — PMID 9445487. — PMC 310689.
  • Petrukhin K., Koisti M.J., Bakall B., et al. Identification of the gene responsible for Best macular dystrophy (англ.) // Nature Genetics : journal. — 1998. — Vol. 19, no. 3. — P. 241—247. — doi:10.1038/915. — PMID 9662395.
  • Pennisi E. New gene found for inherited macular degeneration (англ.) // Science. — 1998. — Vol. 281, no. 5373. — P. 31. — doi:10.1126/science.281.5373.31. — PMID 9679014.
  • Marquardt A., Stöhr H., Passmore L.A., et al. Mutations in a novel gene, VMD2, encoding a protein of unknown properties cause juvenile-onset vitelliform macular dystrophy (Best's disease) (англ.) // Human Molecular Genetics : journal. — Oxford University Press, 1998. — Vol. 7, no. 9. — P. 1517—1525. — doi:10.1093/hmg/7.9.1517. — PMID 9700209.
  • Caldwell G.M., Kakuk L.E., Griesinger I.B., et al. Bestrophin gene mutations in patients with Best vitelliform macular dystrophy (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1999. — Vol. 58, no. 1. — P. 98—101. — doi:10.1006/geno.1999.5808. — PMID 10331951.
  • Bakall B., Marknell T., Ingvast S., et al. The mutation spectrum of the bestrophin protein--functional implications (англ.) // Human Genetics : journal. — 1999. — Vol. 104, no. 5. — P. 383—389. — doi:10.1007/s004390050972. — PMID 10394929.
  • Allikmets R., Seddon J.M., Bernstein P.S., et al. Evaluation of the Best disease gene in patients with age-related macular degeneration and other maculopathies (англ.) // Human Genetics : journal. — 1999. — Vol. 104, no. 6. — P. 449—453. — doi:10.1007/s004390050986. — PMID 10453731.
  • Palomba G., Rozzo C., Angius A., et al. A novel spontaneous missense mutation in VMD2 gene is a cause of a best macular dystrophy sporadic case (англ.) // American Journal of Ophthalmology : journal. — 2000. — Vol. 129, no. 2. — P. 260—262. — doi:10.1016/S0002-9394(99)00327-X. — PMID 10682987.
  • Lotery A.J., Namperumalsamy P, Jacobson S.G., et al. Mutation analysis of 3 genes in patients with Leber congenital amaurosis (англ.) // JAMA Ophthalmology : journal. — 2000. — Vol. 118, no. 4. — P. 538—543. — doi:10.1001/archopht.118.4.538. — PMID 10766140.
  • Lotery A.J., Munier F.L., Fishman G.A., et al. Allelic variation in the VMD2 gene in best disease and age-related macular degeneration (англ.) // Investigative Ophthalmology & Visual Science : journal. — 2000. — Vol. 41, no. 6. — P. 1291—1296. — PMID 10798642.
  • Krämer F., White K., Pauleikhoff D., et al. Mutations in the VMD2 gene are associated with juvenile-onset vitelliform macular dystrophy (Best disease) and adult vitelliform macular dystrophy but not age-related macular degeneration (англ.) // European Journal of Human Genetics : journal. — 2000. — Vol. 8, no. 4. — P. 286—292. — doi:10.1038/sj.ejhg.5200447. — PMID 10854112.
  • Marmorstein A.D., Marmorstein L.Y., Rayborn M., et al. Bestrophin, the product of the Best vitelliform macular dystrophy gene (VMD2), localizes to the basolateral plasma membrane of the retinal pigment epithelium (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 97, no. 23. — P. 12758—12763. — doi:10.1073/pnas.220402097. — PMID 11050159. — PMC 18837.
  • Marchant D., Gogat K., Boutboul S., et al. Identification of novel VMD2 gene mutations in patients with best vitelliform macular dystrophy (англ.) // Human Mutation : journal. — 2001. — Vol. 17, no. 3. — P. 235. — doi:10.1002/humu.9. — PMID 11241846.
  • Eksandh L., Bakall B., Bauer B., et al. Best's vitelliform macular dystrophy caused by a new mutation (Val89Ala) in the VMD2 gene (англ.) // Ophthalmic Genet. : journal. — 2001. — Vol. 22, no. 2. — P. 107—115. — doi:10.1076/opge.22.2.107.2226. — PMID 11449320.
  • Sun H., Tsunenari T., Yau K.W., Nathans J. The vitelliform macular dystrophy protein defines a new family of chloride channels (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 6. — P. 4008—4013. — doi:10.1073/pnas.052692999. — PMID 11904445. — PMC 122639.
  • Xiao Q., Yu K., Cui Y.Y., Hartzell H.C. Dysregulation of human bestrophin-1 by ceramide-induced dephosphorylation (англ.) // J Physiol. : journal. — 2009. — Vol. 587, no. 18. — P. 4379—4391. — doi:10.1113/jphysiol.2009.176800. — PMID 19635817. — PMC 2766645.
  • Xiao Q., Prussia A., Yu K., Cui Y.Y., Hartzell H.C. Regulation of bestrophin Cl channels by calcium: role of the C terminus (англ.) // J Gen Physiol. : journal. — 2008. — Vol. 132, no. 6. — P. 681—692. — doi:10.1085/jgp.200810056. — PMID 19029375. — PMC 2585866.

Категории